More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_R0014 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_R0014  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0055  tRNA-Ile  96.88 
 
 
77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.168616  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0057  tRNA-Ile  96.88 
 
 
77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.085942  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0048  tRNA-Ile  96.88 
 
 
77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0041  tRNA-Ile  96.88 
 
 
77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130016  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0050  tRNA-Ile  96.88 
 
 
77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0039  tRNA-Ile  96.88 
 
 
77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0065  tRNA-Ile  92.11 
 
 
77 bp  103  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00143134  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0014  tRNA-Ile  92.11 
 
 
77 bp  103  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.207182  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0028  tRNA-Ile  92.11 
 
 
77 bp  103  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0034  tRNA-Ile  92.11 
 
 
77 bp  103  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4579  tRNA-Ile  95.24 
 
 
77 bp  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6551  tRNA-Ile  95.24 
 
 
77 bp  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4551  tRNA-Ile  95.24 
 
 
77 bp  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.349279  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6554  tRNA-Ile  95.24 
 
 
77 bp  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0035  tRNA-Ile  95.16 
 
 
74 bp  99.6  9e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.849815  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0047  tRNA-Ile  95.16 
 
 
74 bp  99.6  9e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t33  tRNA-Ile  96.43 
 
 
74 bp  95.6  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.332244  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t38  tRNA-Ile  96.43 
 
 
74 bp  95.6  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00741229  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt14  tRNA-Ile  96.43 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.033496  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1021  tRNA-Ile  96.43 
 
 
79 bp  95.6  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0055  tRNA-Ile  96.43 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.744049  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0011  tRNA-Ile  96.43 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0071  tRNA-Ile  96.43 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.741425  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0008  tRNA-Ile  90.79 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1793  tRNA-Ile  96.43 
 
 
79 bp  95.6  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00299619  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0019  tRNA-Ile  96.43 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0058  tRNA-Ile  90.79 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.102192  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0040  tRNA-Ile  90.79 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.443427  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1585  tRNA-Ile  96.43 
 
 
79 bp  95.6  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0010  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0369476  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0040  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000178667  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0013  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.059772  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0032  tRNA-Ile  93.1 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0042  tRNA-Ile  93.1 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0014    93.1 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.686239  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0054  tRNA-Ile  93.1 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0666927 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0019  tRNA-Ile  93.1 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.848767  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0064  tRNA-Ile  93.1 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.17499  normal  0.116646 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0011  tRNA-Ile  93.1 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0219307 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0069  tRNA-Ile  93.1 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0006  tRNA-Ile  93.1 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0062  tRNA-Ile  93.1 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.648574  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0052  tRNA-Ile  93.1 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.461525 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0014  tRNA-Ile  93.1 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA17  tRNA-Ile  93.1 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA9  tRNA-Ile  93.1 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0048  tRNA-Ile  93.1 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.622626  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0055  tRNA-Ile  93.1 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0002  tRNA-Ile  89.86 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0021  tRNA-Ile  89.86 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0055  tRNA-Ile  89.86 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0078  tRNA-Ile  89.86 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0035  tRNA-Ile  89.86 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.215089 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0033  tRNA-Ile  90.62 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0026  tRNA-Ile  90.62 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0532408 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0037  tRNA-Ile  90.62 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0057  tRNA-Ile  90.62 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.926394 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0052  tRNA-Ile  88.16 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0058  tRNA-Ile  88.16 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0064  tRNA-Ile  88.16 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0040  tRNA-Ile  90.62 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.241965  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0063  tRNA-Ile  90.62 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.809971 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0028  tRNA-Ile  90.32 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.897252  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0223  tRNA-Ile  91.38 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0090777  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0012  tRNA-Ile  91.38 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0038  tRNA-Ile  90.32 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00492352  normal  0.805671 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0017  tRNA-Ile  90.32 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0599655  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0006  tRNA-Ile  89.06 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293878 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0259  tRNA-Ile  91.07 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0084  tRNA-Ile  89.06 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0029  tRNA-Ile  89.06 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.125391  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0022  tRNA-Ile  86.84 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.368494 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1085  tRNA-Ile  91.07 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0022  tRNA-Ile  89.06 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0077  tRNA-Ile  89.06 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.982522 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0001  tRNA-Ile  92 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000567837 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28350  tRNA-Ile  92 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.145936 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0276  tRNA-Ile  89.66 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  2.66107e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0030  tRNA-Ile  89.66 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0547  tRNA-Ile  89.66 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0036  tRNA-Ile  89.66 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.912426  normal  0.0318611 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00070  tRNA-Ile  92 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000758823  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0002  tRNA-Ile  91.84 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000539151  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0004  tRNA-Ile  91.84 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000076362  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t03  tRNA-Ile  91.84 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0004  tRNA-Ile  91.84 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00301418 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0024  tRNA-Ile  91.84 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0052  tRNA-Ile  91.84 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0029428  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0047  tRNA-Ile  91.84 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.026073  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0009  tRNA-Ile  86.96 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.389462  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0004  tRNA-Ile  91.84 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000939428  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0009  tRNA-Ile  91.84 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0767985  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0004  tRNA-Ile  91.84 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0009  tRNA-Ile  91.84 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.425741  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0009  tRNA-Ile  91.84 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00618734  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0004  tRNA-Ile  91.84 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.147077  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6014  tRNA-Ile  89.29 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6007  tRNA-Ile  89.29 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.358731 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0050  tRNA-Ile  89.29 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.303318 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>