17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6086 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6086  FHA domain containing protein  100 
 
 
429 aa  820    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.561977  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0429  diguanylate cyclase  45.33 
 
 
338 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0457  diguanylate cyclase  44 
 
 
326 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0458  diguanylate cyclase  44 
 
 
326 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00240  FHA domain-containing protein  28.85 
 
 
402 aa  49.7  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5913  diguanylate cyclase  40.28 
 
 
364 aa  46.6  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0132  diguanylate cyclase  47.37 
 
 
289 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0508624  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1709  FHA domain-containing protein  42.31 
 
 
268 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0907  FHA domain-containing protein  42.11 
 
 
252 aa  44.3  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000610253  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4620  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  47.5 
 
 
479 aa  44.3  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.997468  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3040  FHA domain containing protein  34.12 
 
 
137 aa  44.3  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0139  diguanylate cyclase  48.05 
 
 
289 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4645  adenylate/guanylate cyclase  39.71 
 
 
546 aa  44.3  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.98897  normal  0.0884819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0117  FHA domain-containing protein-like protein  50 
 
 
246 aa  43.9  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.332756  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0150  diguanylate cyclase  48.05 
 
 
289 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  34.48 
 
 
566 aa  43.9  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03330  FHA domain-containing protein  33.33 
 
 
138 aa  43.1  0.009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0536542  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>