28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5869 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5869  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  100 
 
 
283 aa  575  1.0000000000000001e-163  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.618301 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2084  hypothetical protein  27.65 
 
 
313 aa  105  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.194643  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  41 
 
 
1148 aa  59.7  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.37 
 
 
1343 aa  59.7  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.07 
 
 
510 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  30 
 
 
1133 aa  55.8  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.73 
 
 
1139 aa  55.8  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.6 
 
 
524 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  50.85 
 
 
546 aa  53.1  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  33.04 
 
 
1094 aa  52.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  33.33 
 
 
1224 aa  52.4  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.52 
 
 
192 aa  48.5  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  41.33 
 
 
838 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2934  HEAT repeat-containing PBS lyase  47.69 
 
 
276 aa  46.2  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.79 
 
 
1438 aa  46.2  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3485  PBS lyase HEAT domain-containing protein repeat-containing protein  43.28 
 
 
276 aa  45.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.315582  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.46 
 
 
180 aa  44.3  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2744  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.37 
 
 
121 aa  44.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2742  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.21 
 
 
121 aa  44.3  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  37.62 
 
 
501 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.39 
 
 
176 aa  43.5  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1875  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.13 
 
 
302 aa  44.3  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  32.38 
 
 
958 aa  43.9  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3079  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  46.77 
 
 
284 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3041  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  46.77 
 
 
284 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  41.94 
 
 
395 aa  43.1  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5047  HEAT repeat-containing PBS lyase  41.27 
 
 
289 aa  42.4  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1823  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.9 
 
 
219 aa  42.4  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.565572 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>