15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4897 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4897  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  281  3.0000000000000004e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2119  hypothetical protein  56.03 
 
 
131 aa  137  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00484605  normal  0.512855 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2660  hypothetical protein  51.13 
 
 
132 aa  133  8e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0103319  normal  0.112319 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6680  hypothetical protein  47.73 
 
 
131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.510357  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4192  hypothetical protein  45.52 
 
 
135 aa  124  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0238677  normal  0.861573 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4532  hypothetical protein  42.4 
 
 
132 aa  96.3  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.172276  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6682  hypothetical protein  33.33 
 
 
134 aa  72  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2118  hypothetical protein  31.36 
 
 
119 aa  66.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00513034  normal  0.484844 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0463  hypothetical protein  30.77 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.31296 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2661  hypothetical protein  30.88 
 
 
134 aa  61.6  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00125374  normal  0.0694453 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4898  hypothetical protein  28.83 
 
 
126 aa  58.9  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4531  hypothetical protein  28 
 
 
136 aa  58.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.992615  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2658  hypothetical protein  32.74 
 
 
133 aa  54.7  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00808599  normal  0.0815243 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4193  hypothetical protein  27.78 
 
 
136 aa  54.3  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0461884  normal  0.865041 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0465  hypothetical protein  31.82 
 
 
95 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.425671 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>