More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3992 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3992  ribosomal protein S14  100 
 
 		 59 aa  121  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116963  normal  0.878683 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0714  30S ribosomal protein S14  78 
 
 		 61 aa  87.8  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000170249  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1239  SSU ribosomal protein S14P  76 
 
 		 78 aa  86.3  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.362958  hitchhiker  0.000818098 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0639  30S ribosomal protein S14  79.17 
 
 		 61 aa  85.5  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000559173  hitchhiker  0.00000000926519 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2844  30S ribosomal protein S14  79.17 
 
 		 61 aa  85.1  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0517993  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1079  30S ribosomal protein S14  79.17 
 
 		 61 aa  85.1  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0153689  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1924  30S ribosomal protein S14  65.57 
 
 		 61 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.416936 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0092  30S ribosomal protein S14  72 
 
 		 61 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0813012 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2031  30S ribosomal protein S14  63.93 
 
 		 61 aa  84  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.42292  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1933  30S ribosomal protein S14  63.93 
 
 		 61 aa  84  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1946  30S ribosomal protein S14  63.93 
 
 		 61 aa  84  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1752  30S ribosomal protein S14  70 
 
 		 61 aa  83.6  9e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.159228  normal  0.597021 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1849  ribosomal protein S14  62.3 
 
 		 61 aa  82.8  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.94553e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1568  30S ribosomal protein S14  70.21 
 
 		 61 aa  82.8  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.837036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1171  ribosomal protein S14  72 
 
 		 61 aa  82.4  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0923192  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2244  30S ribosomal protein S14  68 
 
 		 61 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00320341  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2761  ribosomal protein S14  68 
 
 		 61 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000281664  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0946  30S ribosomal protein S14  75 
 
 		 61 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0139949  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3315  30S ribosomal protein S14  75 
 
 		 61 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000449399 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0673  30S ribosomal protein S14  68 
 
 		 61 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.676771  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1172  30S ribosomal protein S14  75 
 
 		 61 aa  80.5  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992885  normal  0.180837 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2320  ribosomal protein S14  72.34 
 
 		 61 aa  80.5  0.000000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000205328  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1359  30S ribosomal protein S14  72.34 
 
 		 61 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000205599  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0728  ribosomal protein S14  72.34 
 
 		 61 aa  79  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0994  30S ribosomal protein S14  63.79 
 
 		 61 aa  79  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.106756  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0228  ribosomal protein S14  70.83 
 
 		 61 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000229015  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0299  ribosomal protein S14  70.21 
 
 		 61 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000407212  normal  0.0939197 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0860  SSU ribosomal protein S14P  71.43 
 
 		 61 aa  78.2  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00017465  hitchhiker  0.00181207 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0278  30S ribosomal protein S14  62.5 
 
 		 62 aa  77.4  0.00000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00090484  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0780  30S ribosomal protein S14  57.38 
 
 		 61 aa  77  0.00000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000313998  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0487  30S ribosomal protein S14  55.74 
 
 		 61 aa  76.6  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000160451  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0464  30S ribosomal protein S14  55.74 
 
 		 61 aa  76.6  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000329078  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0721  30S ribosomal protein S14  62 
 
 		 61 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.152627  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_429a  30S ribosomal protein S14  55.74 
 
 		 61 aa  76.6  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000656242  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4013  30S ribosomal protein S14  70.83 
 
 		 61 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000290289  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0238  ribosomal protein S14  71.74 
 
 		 61 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.267646  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3900  30S ribosomal protein S14  70.21 
 
 		 61 aa  75.5  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.119779  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2916  30S ribosomal protein S14  66 
 
 		 61 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224414  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1511  ribosomal protein S14  72.34 
 
 		 61 aa  75.1  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.371922  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2447  SSU ribosomal protein S14P  62.5 
 
 		 61 aa  74.7  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.583376 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1732  30S ribosomal protein S14  57.38 
 
 		 61 aa  74.7  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000129581  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0435  30S ribosomal protein S14  65.96 
 
 		 61 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000657507  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0693  30S ribosomal protein S14  66 
 
 		 61 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.180319  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3654  ribosomal protein S14  60 
 
 		 56 aa  73.6  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000678184  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09870  SSU ribosomal protein S14P  63.83 
 
 		 61 aa  72.8  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000893021  hitchhiker  0.0000177439 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0771  30S ribosomal protein S14  65.96 
 
 		 61 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000576242  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2165  ribosomal protein S14  63.83 
 
 		 61 aa  73.2  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0123488  normal  0.748284 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0278  30S ribosomal protein S14  55.17 
 
 		 62 aa  73.6  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000593233  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2052  ribosomal protein S14  60 
 
 		 61 aa  73.2  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0017138  normal  0.052251 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4927  ribosomal protein S14  68.09 
 
 		 61 aa  72.8  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000000398171  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01300  ribosomal protein S14  58.93 
 
 		 61 aa  72.4  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.295143  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1099  ribosomal protein S14  58.82 
 
 		 61 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.128598 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0880  30S ribosomal protein S14  54.1 
 
 		 61 aa  72  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.234445  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2633  SSU ribosomal protein S14P  60 
 
 		 61 aa  70.5  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0670776  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0502  30S ribosomal protein S14  64 
 
 		 61 aa  70.5  0.000000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5137  ribosomal protein S14  60 
 
 		 61 aa  70.1  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.410721 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0575  30S ribosomal protein S14  60 
 
 		 61 aa  70.1  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0207  SSU ribosomal protein S14P  62 
 
 		 61 aa  70.1  0.000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00665329  normal  0.463134 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1818  30S ribosomal protein S14  60 
 
 		 61 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.21292  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0510  30S ribosomal protein S14  63.83 
 
 		 61 aa  69.7  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0183715  hitchhiker  0.000000000349266 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1561  ribosomal protein S14  58 
 
 		 61 aa  70.1  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000971035  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1405  ribosomal protein S14  59.62 
 
 		 61 aa  69.7  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0340  30S ribosomal protein S14  63.83 
 
 		 61 aa  69.7  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0490  ribosomal protein S14  68.09 
 
 		 61 aa  70.1  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0863269  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0170  30S ribosomal protein S14  67.44 
 
 		 101 aa  68.9  0.00000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0625334  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2264  30S ribosomal protein S14  58 
 
 		 61 aa  68.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00143207  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2305  30S ribosomal protein S14  58 
 
 		 61 aa  68.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00385731  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4308  ribosomal protein S14  61.7 
 
 		 61 aa  68.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.442038  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1305  30S ribosomal protein S14  60 
 
 		 61 aa  68.6  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431164  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2142  SSU ribosomal protein S14P  58 
 
 		 61 aa  68.6  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.21315  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1381  30S ribosomal protein S14  60 
 
 		 61 aa  68.6  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000700015  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1854  30S ribosomal protein S14  49.18 
 
 		 61 aa  67.8  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.459394  normal  0.875605 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3892  SSU ribosomal protein S14P  58 
 
 		 61 aa  67.4  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0123  30S ribosomal protein S14  59.57 
 
 		 61 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000176609  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0144  30S ribosomal protein S14  59.57 
 
 		 61 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000518552  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0123  30S ribosomal protein S14  59.57 
 
 		 61 aa  67  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515303  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0119  30S ribosomal protein S14  59.57 
 
 		 61 aa  67  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.6855200000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0117  30S ribosomal protein S14  59.57 
 
 		 61 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000493701  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5182  30S ribosomal protein S14  59.57 
 
 		 61 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000220128  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0777  ribosomal protein S14  57.45 
 
 		 61 aa  67  0.00000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0118  30S ribosomal protein S14  59.57 
 
 		 61 aa  67  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000039135  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0123  30S ribosomal protein S14  59.57 
 
 		 61 aa  67  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000064934  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0154  30S ribosomal protein S14  59.57 
 
 		 61 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000846277  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0117  30S ribosomal protein S14  59.57 
 
 		 61 aa  67  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000649674  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0135  30S ribosomal protein S14  59.57 
 
 		 61 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.93198e-62 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf429  ribosomal protein S14  61.7 
 
 		 61 aa  67  0.00000000009  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0239  30S ribosomal protein S14  60 
 
 		 61 aa  66.2  0.0000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1720  30S ribosomal protein S14  59.18 
 
 		 61 aa  66.6  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0600  ribosomal protein S14  59.18 
 
 		 61 aa  66.2  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.516663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3130  ribosomal protein S14  59.18 
 
 		 61 aa  66.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0264a  30S ribosomal protein S14  59.18 
 
 		 61 aa  66.6  0.0000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0124  30S ribosomal protein S14  57.45 
 
 		 61 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6601  ribosomal protein S14  59.18 
 
 		 61 aa  65.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0683  30S ribosomal protein S14  54.9 
 
 		 61 aa  65.5  0.0000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1057  30S ribosomal protein S14  60 
 
 		 61 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.0000711569  normal  0.350916 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1628  ribosomal protein S14  68.18 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0120  30S ribosomal protein S14  57.45 
 
 		 61 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0319  30S ribosomal protein S14  58 
 
 		 61 aa  65.5  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0032985 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0213  ribosomal protein S14  61.22 
 
 		 101 aa  65.5  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1045  30S ribosomal protein S14  60 
 
 		 61 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000910706  normal  0.188139 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>