14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2660 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2660  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  271  3e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0103319  normal  0.112319 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6680  hypothetical protein  46.21 
 
 
131 aa  141  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.510357  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2119  hypothetical protein  55.36 
 
 
131 aa  137  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00484605  normal  0.512855 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4897  hypothetical protein  51.13 
 
 
135 aa  133  8e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4192  hypothetical protein  38.35 
 
 
135 aa  96.7  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0238677  normal  0.861573 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4532  hypothetical protein  39.09 
 
 
132 aa  92  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.172276  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4898  hypothetical protein  33.33 
 
 
126 aa  67.4  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4531  hypothetical protein  33.93 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.992615  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6682  hypothetical protein  36.11 
 
 
134 aa  65.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2658  hypothetical protein  37.74 
 
 
133 aa  63.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00808599  normal  0.0815243 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0463  hypothetical protein  34.31 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.31296 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2118  hypothetical protein  35.45 
 
 
119 aa  62.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00513034  normal  0.484844 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2661  hypothetical protein  28.89 
 
 
134 aa  60.1  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00125374  normal  0.0694453 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4193  hypothetical protein  28.97 
 
 
136 aa  54.7  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0461884  normal  0.865041 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>