15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2014 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2014  DoxX family protein  100 
 
 		 179 aa  346  9e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2944  DoxX  42.34 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  31.36 
 
 		 148 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  29.93 
 
 		 139 aa  50.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  28.12 
 
 		 144 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3003  DoxX family protein  30.25 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015102 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2947  DoxX family protein  35.16 
 
 		 131 aa  45.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209298  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6404  DoxX  31.4 
 
 		 143 aa  45.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.0305648 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  28.16 
 
 		 144 aa  45.1  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  28.36 
 
 		 151 aa  45.1  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  28.12 
 
 		 144 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  28.68 
 
 		 147 aa  43.5  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1056  DoxX family protein  30.63 
 
 		 133 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2898  DoxX  31.58 
 
 		 155 aa  42.4  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  28.23 
 
 		 133 aa  40.8  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>