27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2011 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2011  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  321  3e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.79325 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0048  hypothetical protein  55.15 
 
 
166 aa  147  8e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.232482 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0063  hypothetical protein  54.41 
 
 
165 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.445728  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0047  hypothetical protein  54.41 
 
 
165 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0051  hypothetical protein  53.68 
 
 
165 aa  143  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1332  hypothetical protein  38.36 
 
 
161 aa  87.4  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00673232 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3341  hypothetical protein  37.23 
 
 
154 aa  85.9  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0539  hypothetical protein  39.55 
 
 
154 aa  80.9  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000030974  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0552  hypothetical protein  38.81 
 
 
154 aa  80.9  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000878259 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2921  hypothetical protein  38.85 
 
 
154 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000773857 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2202  hypothetical protein  37.01 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.666334  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4260  hypothetical protein  33.54 
 
 
162 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4586  hypothetical protein  32.91 
 
 
185 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.148651  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1997  hypothetical protein  34.9 
 
 
148 aa  75.1  0.0000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00184769  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60960  hypothetical protein  38.57 
 
 
168 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.775512  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60570  hypothetical protein  35.82 
 
 
162 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.672607 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5218  hypothetical protein  35.82 
 
 
162 aa  71.2  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2383  hypothetical protein  30.63 
 
 
157 aa  71.2  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000028196  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5247  hypothetical protein  37.86 
 
 
168 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40870  hypothetical protein  29.56 
 
 
168 aa  67  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.317722  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4870  hypothetical protein  30.77 
 
 
162 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.351623  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0710  hypothetical protein  29.75 
 
 
162 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.824983  normal  0.0453993 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4506  hypothetical protein  29.75 
 
 
162 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.256668  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0679  hypothetical protein  29.75 
 
 
171 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.80583  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0711  hypothetical protein  29.75 
 
 
162 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.19701  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0758  hypothetical protein  35.07 
 
 
168 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2798  hypothetical protein  30.19 
 
 
159 aa  63.9  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.822855  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>