More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1508 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1508  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
319 aa  644    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.000000484572  decreased coverage  0.000000495585 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0728  serine/threonine protein kinase  35.09 
 
 
683 aa  135  8e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  34.3 
 
 
662 aa  132  5e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  35.8 
 
 
1053 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  33.1 
 
 
651 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1158  serine/threonine protein kinase  34.44 
 
 
647 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.429913  normal  0.143954 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1383  serine/threonine protein kinase  33.97 
 
 
678 aa  128  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0132851 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.33 
 
 
667 aa  128  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0038  serine/threonine protein kinase  41.12 
 
 
700 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  29.57 
 
 
634 aa  128  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2879  Serine/threonine protein kinase-related protein  38.61 
 
 
224 aa  127  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264905  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  36.76 
 
 
666 aa  127  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  38.39 
 
 
625 aa  126  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2811  serine/threonine kinase protein  38.25 
 
 
1057 aa  125  8.000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3036  Serine/threonine protein kinase-related protein  36.22 
 
 
406 aa  125  9e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4042  Serine/threonine protein kinase-related protein  38.16 
 
 
528 aa  125  9e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4665  protein kinase  42.06 
 
 
307 aa  125  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3384  Serine/threonine protein kinase  38.81 
 
 
520 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.904774  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  34.85 
 
 
612 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  36.97 
 
 
621 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1279  protein kinase  34.62 
 
 
664 aa  123  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1304  protein kinase  34.62 
 
 
664 aa  123  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.16 
 
 
551 aa  123  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  36.19 
 
 
703 aa  123  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3450  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  40.74 
 
 
1076 aa  123  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.88473  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  34.66 
 
 
604 aa  123  5e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.15 
 
 
650 aa  123  5e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  34.76 
 
 
651 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  39.63 
 
 
1100 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  32.32 
 
 
614 aa  122  9.999999999999999e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.07 
 
 
598 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  40.28 
 
 
1072 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  40.28 
 
 
1072 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3685  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.41 
 
 
657 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.210183  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1102  serine/threonine protein kinase  30.14 
 
 
484 aa  120  3e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1670  protein kinase  40.28 
 
 
1073 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.375386 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2810  serine/threonine kinase protein  42.03 
 
 
1034 aa  119  6e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.855533  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0099  serine/threonine protein kinase  36.07 
 
 
456 aa  119  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.951692  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  30 
 
 
638 aa  119  7e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  33.81 
 
 
625 aa  119  7e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  33.1 
 
 
593 aa  119  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1535  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.65 
 
 
627 aa  119  9e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3883  serine/threonine protein kinase  37.91 
 
 
344 aa  119  9e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27070  protein kinase family protein with PASTA domain  33.21 
 
 
692 aa  118  9.999999999999999e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93249  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  35.27 
 
 
692 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  35.75 
 
 
691 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0054  serine/threonine protein kinase  35.41 
 
 
468 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0845441  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2514  protein kinase  32.94 
 
 
656 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0149457  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1172  serine/threonine protein kinase  33.45 
 
 
396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000010841 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2809  serine/threonine kinase protein  33.58 
 
 
618 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.21 
 
 
602 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  37.04 
 
 
625 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2487  serine/threonine protein kinase  41.55 
 
 
377 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000035224  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.71 
 
 
584 aa  117  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0087  serine/threonine protein kinase  35.97 
 
 
700 aa  117  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0027  serine/threonine protein kinase  35.19 
 
 
473 aa  117  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3904  serine/threonine protein kinase  36.41 
 
 
657 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.331218  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0056  serine/threonine protein kinase  32.26 
 
 
483 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0129993 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2182  Serine/threonine protein kinase-related protein  36.94 
 
 
1060 aa  116  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1282  serine/threonine protein kinase  36.41 
 
 
657 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00711344 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3961  serine/threonine protein kinase  36.41 
 
 
657 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.95648  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3713  serine/threonine protein kinase  36.41 
 
 
657 aa  116  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.465838  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3603  serine/threonine protein kinase  36.41 
 
 
657 aa  116  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3621  serine/threonine protein kinase  36.41 
 
 
657 aa  116  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4000  serine/threonine protein kinase  36.41 
 
 
657 aa  116  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3910  serine/threonine protein kinase  36.41 
 
 
657 aa  116  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106725  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.5 
 
 
668 aa  116  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3876  serine/threonine protein kinase  36.41 
 
 
657 aa  116  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95559e-22 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.37 
 
 
653 aa  116  6e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0754  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.03 
 
 
757 aa  115  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3967  serine/threonine protein kinase  37.78 
 
 
533 aa  115  7.999999999999999e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.220626  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0786  serine/threonine protein kinase, putative  27.24 
 
 
666 aa  115  8.999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  36.23 
 
 
468 aa  115  8.999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.56 
 
 
591 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2132  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.23 
 
 
499 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0346111  normal  0.376131 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4862  Serine/threonine protein kinase  39.73 
 
 
508 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000403484  unclonable  0.000000197931 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1346  serine/threonine protein kinase  36.12 
 
 
517 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5304  serine/threonine protein kinase  37.65 
 
 
763 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1587  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  35.68 
 
 
825 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  34.63 
 
 
642 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1096  serine/threonine protein kinase  34.04 
 
 
413 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.1 
 
 
627 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1041  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase:PASTA  38.46 
 
 
672 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.513032  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1342  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  38.02 
 
 
528 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.572002  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.09 
 
 
676 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  34.53 
 
 
646 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  33.33 
 
 
623 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0115  serine/threonine protein kinase  37.5 
 
 
585 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0109927  normal  0.0245304 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3539  protein kinase  36.02 
 
 
403 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0867944  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2237  serine/threonine protein kinase  32.64 
 
 
512 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2291  serine/threonine protein kinase  32.64 
 
 
512 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.76151  normal  0.0202903 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10014  transmembrane serine/threonine-protein kinase B pknB  40.28 
 
 
626 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5188  serine/threonine protein kinase  39.17 
 
 
625 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2079  serine/threonine protein kinase  36.68 
 
 
503 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.161295  normal  0.708532 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0018  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.19 
 
 
693 aa  114  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  37.8 
 
 
666 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0642  serine/threonine protein kinase  33.81 
 
 
519 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174048  normal  0.37866 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2215  serine/threonine protein kinase  35.99 
 
 
1152 aa  113  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.62111 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0026  serine/threonine protein kinase  32.97 
 
 
444 aa  114  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0021  serine/threonine protein kinase  34.83 
 
 
581 aa  114  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000813832 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>