17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0078 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6361  hypothetical protein  45.42 
 
 		 1014 aa  807    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1912  hypothetical protein  45.52 
 
 		 1005 aa  817    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0078  hypothetical protein  100 
 
 		 1023 aa  2069    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1669  hypothetical protein  42.67 
 
 		 397 aa  156  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.045841 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1670  hypothetical protein  34.98 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.655235  normal  0.0410842 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  24.52 
 
 		 1094 aa  57.4  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.03 
 
 		 689 aa  55.8  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  24.88 
 
 		 1667 aa  55.5  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  25 
 
 		 391 aa  50.8  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1859  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.53 
 
 		 329 aa  46.6  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.981734  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.07 
 
 		 328 aa  45.4  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.804553 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2259  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.81 
 
 		 326 aa  45.4  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.669403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  23.6 
 
 		 335 aa  45.4  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1241  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.8 
 
 		 320 aa  45.1  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0330167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2892  cytochrome-c peroxidase  29.41 
 
 		 399 aa  45.1  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411121 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2583  hypothetical protein  22.8 
 
 		 312 aa  44.7  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  24.57 
 
 		 580 aa  44.7  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>