46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0376 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0376  protein of unknown function DUF302  100 
 
 
148 aa  307  4e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0949  hypothetical protein  46 
 
 
150 aa  152  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.811465  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2075  hypothetical protein  49.61 
 
 
150 aa  132  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1896  hypothetical protein  54.05 
 
 
135 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1823  hypothetical protein  49.24 
 
 
131 aa  126  9.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2735  hypothetical protein  46.15 
 
 
131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1673  hypothetical protein  47.5 
 
 
172 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00536019  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3845  protein of unknown function DUF302  51.79 
 
 
133 aa  125  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0744952 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1260  hypothetical protein  48.03 
 
 
157 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2096  hypothetical protein  49.57 
 
 
150 aa  122  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001057  putative inner membrane or exported protein  42.19 
 
 
148 aa  120  5e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0512  hypothetical protein  42.76 
 
 
152 aa  120  7e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.915743  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1941  hypothetical protein  48.18 
 
 
172 aa  119  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2556  hypothetical protein  42 
 
 
150 aa  115  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.299096  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6375  protein of unknown function DUF302  45.24 
 
 
165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1764  protein of unknown function DUF302  44.86 
 
 
154 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1369  crcB family protein  42.73 
 
 
254 aa  110  6e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1325  camphor resistance protein CrcB  42.73 
 
 
270 aa  110  6e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3395  hypothetical protein  43.38 
 
 
160 aa  107  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614366  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4835  hypothetical protein  41.94 
 
 
197 aa  102  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1380  protein of unknown function DUF302  43.64 
 
 
179 aa  102  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1779  hypothetical protein  35.16 
 
 
151 aa  93.6  8e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8087  protein of unknown function DUF302  36.28 
 
 
163 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05960  hypothetical protein  38.74 
 
 
306 aa  91.7  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0678707  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2874  hypothetical protein  39.05 
 
 
143 aa  90.9  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4759  hypothetical protein  36.8 
 
 
122 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61827  normal  0.706872 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4906  hypothetical protein  36.8 
 
 
122 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0532643 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8650  protein of unknown function DUF302  40.78 
 
 
132 aa  89.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997368  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5867  hypothetical protein  43.12 
 
 
202 aa  89  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.244323  normal  0.372797 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4859  hypothetical protein  36.8 
 
 
122 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.103571 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4835  hypothetical protein  36.8 
 
 
122 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.770482  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1665  hypothetical protein  38.69 
 
 
149 aa  87.8  5e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4909  domain of unknown function superfamily  36.8 
 
 
122 aa  87.8  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0349  periplasmic protein  34.78 
 
 
168 aa  87  7e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.112084  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5442  hypothetical protein  46.59 
 
 
138 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821645  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1272  hypothetical protein  35.54 
 
 
121 aa  82.4  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2794  hypothetical protein  39.53 
 
 
147 aa  74.3  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.4262  normal  0.709682 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1972  protein of unknown function DUF302  34.62 
 
 
123 aa  73.6  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1559  protein of unknown function DUF302  40 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.874349  normal  0.0163758 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2704  hypothetical protein  37.36 
 
 
132 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.556991  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0007  protein of unknown function DUF302  35.9 
 
 
135 aa  65.5  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.120765 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0543  protein of unknown function DUF302  37.04 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3562  hypothetical protein  34.78 
 
 
150 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3413  hypothetical protein  36.36 
 
 
80 aa  46.2  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2383  hypothetical protein  28.18 
 
 
175 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0971  protein of unknown function DUF302  29.55 
 
 
126 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.294774 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>