More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3158 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0652  adenylosuccinate lyase  75.98 
 
 
460 aa  691    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.550161  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2736  adenylosuccinate lyase  74.13 
 
 
465 aa  667    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286756  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0786  adenylosuccinate lyase  77.17 
 
 
461 aa  697    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3158  adenylosuccinate lyase  100 
 
 
460 aa  937    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.764466 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0924  adenylosuccinate lyase  70.75 
 
 
486 aa  619  1e-176  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000172429 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2720  adenylosuccinate lyase  48.5 
 
 
457 aa  409  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.382764 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2576  adenylosuccinate lyase  48.83 
 
 
462 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000542791 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1673  adenylosuccinate lyase  50.54 
 
 
465 aa  410  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3246  adenylosuccinate lyase  50.22 
 
 
458 aa  406  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.164872  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2554  adenylosuccinate lyase  48.71 
 
 
457 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.660215 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2964  adenylosuccinate lyase  48.5 
 
 
457 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.989167  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3366  adenylosuccinate lyase  47.77 
 
 
462 aa  403  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000111293 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3402  adenylosuccinate lyase  47.35 
 
 
462 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2442  adenylosuccinate lyase  47.35 
 
 
462 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4199  adenylosuccinate lyase  50.54 
 
 
451 aa  401  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225542  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0593  adenylosuccinate lyase  47.98 
 
 
462 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1216  adenylosuccinate lyase  47.35 
 
 
462 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0633  adenylosuccinate lyase  46.92 
 
 
462 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2627  adenylosuccinate lyase  47.35 
 
 
462 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0157894  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0358  adenylosuccinate lyase  47.35 
 
 
462 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0043  adenylosuccinate lyase  49.78 
 
 
451 aa  398  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2819  adenylosuccinate lyase  47.94 
 
 
458 aa  395  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3752  adenylosuccinate lyase  46.92 
 
 
482 aa  396  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1221  adenylosuccinate lyase  47.13 
 
 
483 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0183  adenylosuccinate lyase  46.92 
 
 
462 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31796  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0666  adenylosuccinate lyase  46.92 
 
 
462 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.600757  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2956  adenylosuccinate lyase  46.85 
 
 
458 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1273  adenylosuccinate lyase  47.28 
 
 
455 aa  391  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2853  adenylosuccinate lyase  44.78 
 
 
456 aa  387  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3438  adenylosuccinate lyase  47.35 
 
 
483 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1718  adenylosuccinate lyase  44.78 
 
 
456 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1610  adenylosuccinate lyase  44.78 
 
 
456 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3436  adenylosuccinate lyase  47.35 
 
 
462 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.587084  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1511  adenylosuccinate lyase  47.16 
 
 
483 aa  385  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.411987 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5167  adenylosuccinate lyase  45.38 
 
 
459 aa  382  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.518617  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1123  adenylosuccinate lyase  45.15 
 
 
447 aa  379  1e-104  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2717  adenylosuccinate lyase  47.35 
 
 
482 aa  381  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.882341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0852  adenylosuccinate lyase  45.16 
 
 
481 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.697977 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3858  adenylosuccinate lyase  42.17 
 
 
460 aa  381  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0805  adenylosuccinate lyase  44.37 
 
 
455 aa  377  1e-103  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0892  adenylosuccinate lyase  44.37 
 
 
465 aa  375  1e-103  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0715045  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1867  adenylosuccinate lyase  44.78 
 
 
456 aa  376  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3288  adenylosuccinate lyase  45.81 
 
 
455 aa  377  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.650237  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06215  adenylosuccinate lyase  45.7 
 
 
445 aa  377  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.232812  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2707  adenylosuccinate lyase  44.13 
 
 
456 aa  377  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0624698 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1558  adenylosuccinate lyase  44.59 
 
 
456 aa  378  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0115488  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0587  adenylosuccinate lyase  46.92 
 
 
462 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0893212  normal  0.36652 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1032  adenylosuccinate lyase  45.49 
 
 
458 aa  376  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.423861  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0561  adenylosuccinate lyase  46.92 
 
 
462 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2152  adenylosuccinate lyase  44.35 
 
 
456 aa  376  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0629713  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3376  adenylosuccinate lyase  44.52 
 
 
459 aa  373  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2540  adenylosuccinate lyase  43.7 
 
 
456 aa  374  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0889  adenylosuccinate lyase  43.68 
 
 
461 aa  374  1e-102  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5015  adenylosuccinate lyase  45.43 
 
 
448 aa  374  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1879  adenylosuccinate lyase  43.72 
 
 
455 aa  373  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000162136 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4026  adenylosuccinate lyase  44.52 
 
 
459 aa  373  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2627  adenylosuccinate lyase  45.3 
 
 
455 aa  374  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108718  normal  0.687472 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1819  adenylosuccinate lyase  43.84 
 
 
456 aa  375  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.558507  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02370  adenylosuccinate lyase  45.43 
 
 
455 aa  372  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.718136  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1794  adenylosuccinate lyase  46.39 
 
 
459 aa  374  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0813752  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2381  adenylosuccinate lyase  43.7 
 
 
455 aa  372  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.701794  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1593  adenylosuccinate lyase  43.17 
 
 
455 aa  375  1e-102  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1126  adenylosuccinate lyase  43.47 
 
 
461 aa  373  1e-102  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0961  adenylosuccinate lyase  45 
 
 
457 aa  374  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.118587 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2902  adenylosuccinate lyase  44.35 
 
 
456 aa  370  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451735  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2635  adenylosuccinate lyase  43.99 
 
 
456 aa  371  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4037  adenylosuccinate lyase  43.78 
 
 
446 aa  372  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.499217  normal  0.07553 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0834  adenylosuccinate lyase  41.76 
 
 
456 aa  370  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2106  adenylosuccinate lyase  44.16 
 
 
455 aa  370  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2480  adenylosuccinate lyase  44.18 
 
 
456 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.866176  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1940  adenylosuccinate lyase  43.7 
 
 
455 aa  370  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1238  adenylosuccinate lyase  46.68 
 
 
443 aa  372  1e-101  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01205  adenylosuccinate lyase  44.4 
 
 
455 aa  369  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1675  adenylosuccinate lyase  43.84 
 
 
459 aa  369  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2065  adenylosuccinate lyase  44.13 
 
 
455 aa  369  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1871  adenylosuccinate lyase  44.18 
 
 
456 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0121528  hitchhiker  0.00000377009 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2593  adenylosuccinate lyase  44.18 
 
 
456 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.138176  normal  0.0552843 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1601  adenylosuccinate lyase  44.21 
 
 
456 aa  371  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1676  adenylosuccinate lyase  44.21 
 
 
456 aa  372  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.167323  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1358  adenylosuccinate lyase  44.35 
 
 
455 aa  369  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5955  adenylosuccinate lyase  45.03 
 
 
446 aa  369  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.676724  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29392  predicted protein  44.25 
 
 
505 aa  371  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.881924 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2473  adenylosuccinate lyase  44.18 
 
 
456 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00166519  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1065  adenylosuccinate lyase  44.08 
 
 
458 aa  369  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.403225  normal  0.751482 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1745  adenylosuccinate lyase  44.21 
 
 
456 aa  370  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2235  adenylosuccinate lyase  44.09 
 
 
456 aa  371  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0334521  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2516  adenylosuccinate lyase  43.91 
 
 
456 aa  365  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00611502  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3621  adenylosuccinate lyase  45.15 
 
 
472 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1952  adenylosuccinate lyase  43.7 
 
 
456 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0863  adenylosuccinate lyase  41.76 
 
 
456 aa  368  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0518  adenylosuccinate lyase  45.77 
 
 
456 aa  366  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.448433 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0960  adenylosuccinate lyase  45.06 
 
 
469 aa  367  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000552742 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1251  adenylosuccinate lyase  43.91 
 
 
456 aa  365  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1311  adenylosuccinate lyase  43.48 
 
 
456 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.634296  normal  0.266567 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1349  adenylosuccinate lyase  43.7 
 
 
456 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1360  adenylosuccinate lyase  42.54 
 
 
463 aa  367  1e-100  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1333  adenylosuccinate lyase  43.7 
 
 
456 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.887926  normal  0.184863 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2134  adenylosuccinate lyase  43.7 
 
 
456 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0323604 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1644  adenylosuccinate lyase  43.48 
 
 
456 aa  368  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2472  adenylosuccinate lyase  43.91 
 
 
456 aa  365  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>