17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1908 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1908  proteasome Rpn11 subunit JAMM motif protein  100 
 
 		 163 aa  328  2e-89  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.117708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0716  proteasome Rpn11 subunit JAMM motif protein  73.33 
 
 		 169 aa  235  2e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2405  hypothetical protein  67.9 
 
 		 173 aa  230  8.000000000000001e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.600019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2117  metal-dependent protease of the PAD1/JAB1 superfamily-like protein  67.92 
 
 		 164 aa  226  7e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0620  hypothetical protein  66.46 
 
 		 164 aa  225  2e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0623  JAMM-like protein. metallo peptidase. MEROPS family M67B  44.37 
 
 		 135 aa  121  4e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.64489  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3046  JAMM-like protein. metallo peptidase. MEROPS family M67B  42.86 
 
 		 131 aa  107  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.208196  normal  0.597749 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2403  hypothetical protein  41.04 
 
 		 149 aa  103  9e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2297  hypothetical protein  40.15 
 
 		 123 aa  97.8  6e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0210  hypothetical protein  40.77 
 
 		 123 aa  92.4  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0311  hypothetical protein  37.69 
 
 		 123 aa  90.5  9e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.734999  normal  0.454808 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0077  hypothetical protein  34.62 
 
 		 123 aa  89.4  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.825117  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0407  hypothetical protein  37.72 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.167584  hitchhiker  0.00520945 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0792  Mov34 family protein  34.35 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0715  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  34.43 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0658  hypothetical protein  37.68 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.125511  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1397  hypothetical protein  40.91 
 
 		 138 aa  41.6  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>