136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0508 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0508  BioY protein  100 
 
 
194 aa  367  1e-101  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2735  BioY protein  43.23 
 
 
195 aa  109  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0498  BioY protein  43.09 
 
 
193 aa  108  4.0000000000000004e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.583343 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0886  BioY protein  39.49 
 
 
235 aa  86.3  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.452064  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  37.65 
 
 
187 aa  84.7  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  35.43 
 
 
184 aa  84.7  8e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0230  BioY protein  40 
 
 
204 aa  81.3  0.000000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.949273  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  33.7 
 
 
197 aa  77.4  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3097  BioY protein  39.13 
 
 
187 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4627  biotin synthesis BioY protein  38.26 
 
 
197 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.33055e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5028  bioY family protein  38.26 
 
 
197 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4649  biotin synthesis BioY protein  38.26 
 
 
197 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000112597  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4787  bioY family protein  38.26 
 
 
197 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000360294  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5150  bioY family protein  38.26 
 
 
197 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.85197  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_967  biotin biosynthesis protein BioY  33.53 
 
 
215 aa  75.1  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000844147  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5056  bioY family protein  38.26 
 
 
197 aa  74.7  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.745684  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0995  BioY protein  34.71 
 
 
215 aa  74.7  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5061  bioY family protein  38.26 
 
 
197 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5049  bioY family protein  38.26 
 
 
197 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.925565  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  31.82 
 
 
182 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000303529  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4739  BioY protein  38.53 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000101818  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0185  bioY family protein  38.26 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  33.52 
 
 
187 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3528  BioY protein  35.78 
 
 
198 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  32.22 
 
 
184 aa  73.2  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  35.12 
 
 
210 aa  72.4  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  36.53 
 
 
169 aa  72.4  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  36.53 
 
 
169 aa  72.4  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4131  BioY protein  35.47 
 
 
189 aa  72.4  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  33.73 
 
 
178 aa  72  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0243  BioY protein  40.56 
 
 
190 aa  71.6  0.000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00131705  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  37.21 
 
 
182 aa  69.3  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  29.47 
 
 
199 aa  68.6  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1515  bioY family protein  38.46 
 
 
184 aa  67  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00248245  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1647  BioY protein  38.41 
 
 
169 aa  67.4  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0169  BioY protein  33.71 
 
 
187 aa  67.4  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000989963  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  36.47 
 
 
203 aa  66.6  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  37.11 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2330  BioY protein  35.98 
 
 
196 aa  65.5  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  33.72 
 
 
182 aa  64.7  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2544  BioY protein  35 
 
 
192 aa  64.7  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269732  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  35.54 
 
 
192 aa  64.3  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4207  BioY protein  36.64 
 
 
195 aa  63.2  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  36.77 
 
 
189 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  29.89 
 
 
184 aa  63.2  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000266759  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0991  BioY protein  32.76 
 
 
199 aa  62.8  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0659  BioY protein  30.52 
 
 
171 aa  62.8  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.728186  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2947  BioY protein  36.43 
 
 
187 aa  63.2  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000305792  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4638  BioY protein  35.97 
 
 
203 aa  62  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2901  BioY protein  43.62 
 
 
208 aa  62  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000326686  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1184  BioY family protein  34.12 
 
 
215 aa  61.2  0.000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000330178  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5281  BioY protein  36.24 
 
 
202 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.170405  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0996  BioY protein  35.06 
 
 
191 aa  61.2  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2113  BioY protein  34.36 
 
 
224 aa  61.2  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0646325  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5370  BioY protein  36.24 
 
 
202 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5660  BioY protein  36.24 
 
 
202 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1924  BioY family protein  36.3 
 
 
145 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  33.91 
 
 
189 aa  59.7  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21370  hypothetical protein  39.34 
 
 
205 aa  60.1  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.283174  normal  0.337859 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3020  BioY protein  36.7 
 
 
201 aa  59.3  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  30.86 
 
 
182 aa  59.7  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012911  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3228  BioY protein  32.61 
 
 
201 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0575  BioY protein  36.3 
 
 
185 aa  59.3  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  41 
 
 
189 aa  58.9  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3659  BioY protein  34.42 
 
 
179 aa  58.2  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2307  BioY protein  31.36 
 
 
184 aa  58.2  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.366824  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2349  BioY protein  31.36 
 
 
184 aa  58.2  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3005  BioY protein  32.74 
 
 
200 aa  57.8  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.312874  normal  0.884214 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0539  BioY protein  39.08 
 
 
193 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.252714  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  30.41 
 
 
187 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07160  hypothetical protein  35.33 
 
 
205 aa  56.6  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1671  BioY protein  33.96 
 
 
207 aa  57  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998664 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3464  BioY protein  35.12 
 
 
205 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  33.54 
 
 
205 aa  56.6  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1004  biotin synthesis BioY protein  31.36 
 
 
187 aa  57  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3349  BioY protein  35.17 
 
 
207 aa  56.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  33.54 
 
 
206 aa  56.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0132  hypothetical protein  30.46 
 
 
176 aa  55.5  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1681  BioY protein  39.24 
 
 
225 aa  55.1  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  29.59 
 
 
231 aa  54.7  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1732  BioY protein  34.9 
 
 
208 aa  54.7  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  33.9 
 
 
169 aa  54.7  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0243  BioY protein  32.62 
 
 
182 aa  53.9  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.360915  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2320  BioY protein  32.2 
 
 
180 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21840  hypothetical protein  36.31 
 
 
212 aa  54.3  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1123  BioY protein  33.33 
 
 
197 aa  53.5  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.432616  normal  0.483731 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0998  BioY protein  32.21 
 
 
182 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000197008  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  29.7 
 
 
187 aa  52  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2875  BioY protein  34.86 
 
 
202 aa  52  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000912957  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4329  BioY protein  39.05 
 
 
212 aa  51.6  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.373185 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02210  hypothetical protein  30.53 
 
 
194 aa  51.2  0.000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0568  BioY protein  40.23 
 
 
193 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.936427  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1651  BioY family protein  42.86 
 
 
203 aa  50.1  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000463296  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  28.87 
 
 
191 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0501  BioY protein  35.4 
 
 
187 aa  50.1  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0382459  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2911  BioY protein  39.02 
 
 
202 aa  50.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  28.99 
 
 
191 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000166456  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8405  BioY family protein  32.87 
 
 
189 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1432  BioY protein  34.93 
 
 
185 aa  49.7  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1529  BioY protein  36.88 
 
 
188 aa  49.3  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>