16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0068 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0068  transposase  100 
 
 
211 aa  436  1e-121  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0984567 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4218  Transposase and inactivated derivatives-like protein  63.73 
 
 
205 aa  265  5e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0059  IS240-type transposase (ISH102)  57.84 
 
 
206 aa  242  3.9999999999999997e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0254142  normal  0.2099 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1494  transposase  54.55 
 
 
212 aa  234  7e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.913135  normal  0.873536 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1512  transposase  54.55 
 
 
212 aa  234  7e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0582203 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3528  transposase  54.55 
 
 
212 aa  234  7e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0923  transposase  47.75 
 
 
178 aa  178  7e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.134513  decreased coverage  0.0000447966 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3224  transposase  39.29 
 
 
226 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4863  Integrase catalytic region  36.65 
 
 
225 aa  107  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4047  Integrase catalytic region  36.65 
 
 
225 aa  106  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4966  Integrase catalytic region  36.65 
 
 
225 aa  106  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3914  Integrase catalytic region  36.13 
 
 
225 aa  105  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.835776  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0858  transposase  35.41 
 
 
226 aa  92  6e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4959  Transposase and inactivated derivatives-like protein  36.07 
 
 
199 aa  68.2  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2554  transposase  37.04 
 
 
97 aa  52.4  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.191723 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4506  integrase catalytic region  30.17 
 
 
236 aa  43.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>