11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0064 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012028  Hlac_3073  transposase IS4 family protein  82.38 
 
 		 1275 bp  739    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3567  transposase IS4 family protein  84.48 
 
 		 1275 bp  950    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3569  transposase IS4 family protein  84.48 
 
 		 1275 bp  950    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0064    100 
 
 		 1272 bp  2522    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.126319 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0081  transposase IS4 family protein  88.34 
 
 		 1275 bp  1338    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.985684  normal  0.077965 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4813    80.98 
 
 		 787 bp  347  5e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.973563  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3633    82.76 
 
 		 2388 bp  323  7e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4287  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 2136 bp  48.1  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.717547  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4192  phospholipase C  100 
 
 		 2145 bp  48.1  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.81751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21110  non-hemolytic phospholipase C precursor  100 
 
 		 2079 bp  48.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1494  phospholipase C, phosphocholine-specific  100 
 
 		 2109 bp  48.1  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>