21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0059 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0059  IS240-type transposase (ISH102)  100 
 
 
206 aa  424  1e-118  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0254142  normal  0.2099 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0068  transposase  57.84 
 
 
211 aa  242  3e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0984567 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4218  Transposase and inactivated derivatives-like protein  49.51 
 
 
205 aa  197  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1494  transposase  44.12 
 
 
212 aa  176  1e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.913135  normal  0.873536 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1512  transposase  44.12 
 
 
212 aa  176  1e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0582203 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3528  transposase  44.12 
 
 
212 aa  176  1e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0923  transposase  42.46 
 
 
178 aa  144  9e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.134513  decreased coverage  0.0000447966 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3224  transposase  36.46 
 
 
226 aa  104  8e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4047  Integrase catalytic region  36.84 
 
 
225 aa  94.7  8e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4966  Integrase catalytic region  36.26 
 
 
225 aa  94.7  9e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3914  Integrase catalytic region  34.76 
 
 
225 aa  89  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.835776  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4863  Integrase catalytic region  33.33 
 
 
225 aa  88.2  7e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0858  transposase  34.92 
 
 
226 aa  87.4  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4959  Transposase and inactivated derivatives-like protein  35.25 
 
 
199 aa  68.6  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2554  transposase  38.71 
 
 
97 aa  63.5  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.191723 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5663  integrase catalytic region  25.6 
 
 
235 aa  48.1  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884972 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5614  integrase catalytic region  25.6 
 
 
235 aa  47.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5621  integrase catalytic region  25.6 
 
 
235 aa  47  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5656  integrase catalytic region  31.82 
 
 
235 aa  42.7  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.0204963 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0695  transposase  27.27 
 
 
117 aa  42.4  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117389  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4506  integrase catalytic region  25.89 
 
 
236 aa  42.4  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>