35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3528 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1494  transposase  100 
 
 		 212 aa  439  9.999999999999999e-123  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.913135  normal  0.873536 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1512  transposase  100 
 
 		 212 aa  439  9.999999999999999e-123  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0582203 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3528  transposase  100 
 
 		 212 aa  439  9.999999999999999e-123  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0923  transposase  85.39 
 
 		 178 aa  323  1e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.134513  decreased coverage  0.0000447966 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0068  transposase  54.55 
 
 		 211 aa  234  7e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0984567 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4218  Transposase and inactivated derivatives-like protein  45.37 
 
 		 205 aa  185  4e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0059  IS240-type transposase (ISH102)  44.12 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0254142  normal  0.2099 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3224  transposase  33.81 
 
 		 226 aa  94.7  8e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4047  Integrase catalytic region  33.51 
 
 		 225 aa  92.8  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4966  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 225 aa  92.4  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4863  Integrase catalytic region  32.99 
 
 		 225 aa  90.9  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0858  transposase  35.08 
 
 		 226 aa  87.4  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3914  Integrase catalytic region  30.93 
 
 		 225 aa  87  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.835776  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4959  Transposase and inactivated derivatives-like protein  36.36 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2554  transposase  43.59 
 
 		 97 aa  62  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.191723 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4519  putative transposase  27.27 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00999598  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0674  Integrase catalytic region  32.98 
 
 		 353 aa  45.1  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1944  Integrase catalytic region  32.98 
 
 		 353 aa  45.1  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.704589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2422  Integrase catalytic region  32.98 
 
 		 353 aa  45.1  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2640  Integrase catalytic region  32.98 
 
 		 353 aa  45.1  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2409  Integrase catalytic region  31.91 
 
 		 353 aa  43.9  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4457  putative transposase  26.45 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2243  Integrase catalytic region  31.91 
 
 		 353 aa  43.9  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.781166 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2179  Integrase catalytic region  31.91 
 
 		 353 aa  43.9  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000521095  hitchhiker  1.88153e-16 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1912  Integrase catalytic region  31.91 
 
 		 353 aa  43.9  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1065  Integrase catalytic region  31.91 
 
 		 353 aa  43.9  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.106559 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0243  Integrase catalytic region  31.91 
 
 		 353 aa  43.9  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0037  Integrase catalytic region  31.91 
 
 		 353 aa  43.9  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5663  integrase catalytic region  24.46 
 
 		 235 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884972 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4632  putative transposase  26.45 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223023  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4618  putative transposase  26.45 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0617811  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4459  putative transposase  26.45 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5656  integrase catalytic region  25.93 
 
 		 235 aa  42.4  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204963 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3268  integrase catalytic region  27.87 
 
 		 212 aa  42.4  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5614  integrase catalytic region  23.91 
 
 		 235 aa  41.6  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>