56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2877 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012028  Hlac_3203  transposase (ISH3)  89.95 
 
 
388 aa  706    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2904  transposase (ISH3)  89.95 
 
 
388 aa  706    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2913  transposase (ISH3)  89.95 
 
 
388 aa  706    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2939  transposase (ISH3)  89.95 
 
 
388 aa  706    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2978  transposase (ISH3)  89.95 
 
 
388 aa  706    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2983  transposase (ISH3)  89.95 
 
 
388 aa  706    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3324  transposase (ISH3)  89.95 
 
 
388 aa  706    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3067  transposase (ISH3)  89.95 
 
 
388 aa  706    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3107  transposase (ISH3)  89.95 
 
 
388 aa  706    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2877  transposase (ISH3)  100 
 
 
388 aa  804    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3210  transposase (ISH3)  89.95 
 
 
388 aa  706    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3214  transposase (ISH3)  89.95 
 
 
388 aa  706    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3317  transposase (ISH3)  89.95 
 
 
388 aa  706    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3300  transposase (ISH3)  89.95 
 
 
388 aa  706    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2092  transposase (ISH3)  89.95 
 
 
388 aa  706    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0981749  normal  0.0159333 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1757  transposase (ISH3)  89.95 
 
 
388 aa  706    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0120341  normal  0.0106496 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1759  transposase (ISH3)  89.95 
 
 
388 aa  706    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00951972  normal  0.0115894 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3398  transposase (ISH3)  89.95 
 
 
388 aa  706    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1460  transposase (ISH3)  86.63 
 
 
389 aa  655    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3628  transposase (ISH3)  89.95 
 
 
388 aa  706    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3599  transposase (ISH3)  89.95 
 
 
388 aa  706    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3595  transposase (ISH3)  89.95 
 
 
388 aa  706    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3590  transposase (ISH3)  89.95 
 
 
388 aa  706    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3562  transposase (ISH3)  89.95 
 
 
388 aa  706    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3509  transposase (ISH3)  89.95 
 
 
388 aa  706    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3434  transposase (ISH3)  89.95 
 
 
388 aa  706    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3351  transposase (ISH3)  89.95 
 
 
388 aa  706    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3362  transposase (ISH3)  89.95 
 
 
388 aa  706    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2748  transposase (ISH3)  89.95 
 
 
388 aa  706    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2781  transposase (ISH3)  89.95 
 
 
388 aa  706    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2819  transposase (ISH3)  89.69 
 
 
388 aa  704    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2826  transposase (ISH3)  89.95 
 
 
388 aa  706    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2855  transposase (ISH3)  89.95 
 
 
388 aa  706    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2799  transposase (ISH3)  65.89 
 
 
381 aa  481  1e-135  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3110  transposase (ISH3)  65.63 
 
 
381 aa  478  1e-134  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3021  transposase (ISH3)  65.63 
 
 
381 aa  478  1e-134  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0001  transposase IS4  30.14 
 
 
379 aa  175  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.127623  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3516  transposase IS4 family protein  31.08 
 
 
390 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0417  hypothetical protein  27.11 
 
 
363 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0458  hypothetical protein  26.67 
 
 
374 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1606  transposase IS4 family protein  31.34 
 
 
390 aa  140  3e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.207123 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3439  transposase IS4 family protein  31.34 
 
 
390 aa  140  3e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2857  transposase IS4 family protein  31.34 
 
 
390 aa  140  3e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0054  transposase IS4 family protein  31.34 
 
 
390 aa  140  3e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00175854 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1024  transposase IS4 family protein  31.34 
 
 
390 aa  140  3e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.765298  normal  0.715821 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1840  transposase IS4 family protein  31.34 
 
 
390 aa  140  3e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.156024  normal  0.289357 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0795  transposase  26.98 
 
 
374 aa  138  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0638  transposase  26.98 
 
 
374 aa  138  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0161  hypothetical protein  25.38 
 
 
331 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0893  hypothetical protein  23.96 
 
 
332 aa  108  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0718  transposase, IS4 family protein  25.86 
 
 
415 aa  88.6  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0553723  normal  0.0430259 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0717  hypothetical protein  25 
 
 
369 aa  79.7  0.00000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.137739  normal  0.0455939 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1353  transposase IS4 family protein  25.54 
 
 
370 aa  54.3  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3062  transposase IS4 family protein  21.86 
 
 
584 aa  53.1  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1909  hypothetical protein  26.67 
 
 
209 aa  51.2  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.231883  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0678  hypothetical protein  24.11 
 
 
150 aa  49.7  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>