More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2809 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012028  Hlac_2809  integrase family protein  100 
 
 		 205 aa  424  1e-118  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3588  integrase family protein  72.68 
 
 		 205 aa  322  4e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4294  integrase family protein  47.15 
 
 		 199 aa  167  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0264131  n/a   
 
 
-
 
NC_013749  Htur_5287  integrase family protein  47.06 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3658  phage integrase/site-specific recombinase  71.08 
 
 		 100 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0251  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.16 
 
 		 355 aa  63.2  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00631913  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  30.93 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  28.57 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2210  integrase family protein  32.12 
 
 		 295 aa  61.6  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241024 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2982  integrase family protein  33.13 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4696  integrase family protein  31.75 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1217  integrase family protein  33.13 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4359  integrase family protein  33.13 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4385  integrase family protein  33.13 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  31.12 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002113  tyrosine recombinase XerC  29.76 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  27.05 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0485  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.49 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.853028 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1142  tyrosine recombinase XerD  28.8 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.23 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1428  phage integrase  30.46 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.473602  normal  0.0585003 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2513  type 1 fimbriae regulatory protein  29.09 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  28 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2484  phage integrase  29.8 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.72317  normal  0.0269236 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  31.77 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00307  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.17 
 
 		 313 aa  55.5  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  29.9 
 
 		 292 aa  55.5  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  30.21 
 
 		 362 aa  55.5  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.93 
 
 		 296 aa  55.1  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  28.65 
 
 		 302 aa  55.1  0.0000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  29.17 
 
 		 346 aa  54.7  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2228  integrase family protein  27.81 
 
 		 330 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.763924 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1481  integrase family protein  30.41 
 
 		 308 aa  53.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.141471  normal  0.0727308 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.46 
 
 		 321 aa  53.9  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0772  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.29 
 
 		 324 aa  53.9  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  29.52 
 
 		 284 aa  53.5  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5348  integrase family protein  27.81 
 
 		 330 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464558 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  30.23 
 
 		 297 aa  53.5  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2471  tyrosine recombinase XerC subunit  29.03 
 
 		 308 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2008  integrase family protein  27.81 
 
 		 330 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.461761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0684  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.29 
 
 		 324 aa  52.8  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.631001  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  30.19 
 
 		 310 aa  52.8  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1148  phage integrase family site specific recombinase  23.2 
 
 		 328 aa  52.4  0.000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0281308  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  30.41 
 
 		 313 aa  52.4  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.06 
 
 		 298 aa  52.4  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11170  site-specific recombinase XerD  28.57 
 
 		 336 aa  52.8  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0225756  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  30.81 
 
 		 308 aa  52  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  28.65 
 
 		 295 aa  52.4  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3102  integrase family protein  26.56 
 
 		 301 aa  52.4  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000184896  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0039  tyrosine recombinase XerD  30.23 
 
 		 312 aa  52.4  0.000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  30.64 
 
 		 296 aa  52  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2391  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.81 
 
 		 311 aa  51.6  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.5 
 
 		 296 aa  51.6  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  24.23 
 
 		 305 aa  52  0.000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0335  phage integrase family protein  29.38 
 
 		 356 aa  52  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1720  tyrosine recombinase XerD  31.4 
 
 		 319 aa  51.6  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.514315 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  28.72 
 
 		 304 aa  51.6  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  26.94 
 
 		 294 aa  51.2  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0010  tyrosine recombinase XerC  26.74 
 
 		 299 aa  51.2  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  27.54 
 
 		 307 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2815  integrase/recombinase XerD  29.65 
 
 		 311 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0736  integrase/recombinase  26.67 
 
 		 337 aa  50.8  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3665  integrase family protein  31.29 
 
 		 313 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211751 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  27.54 
 
 		 307 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0465  integrase family protein  27.5 
 
 		 375 aa  51.2  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342818  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1611  tyrosine recombinase  27.68 
 
 		 308 aa  50.1  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  27.04 
 
 		 302 aa  50.1  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  27.04 
 
 		 302 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  28.18 
 
 		 310 aa  50.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1531  phage integrase family protein  28.81 
 
 		 311 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0201  tyrosine recombinase XerC subunit  28.65 
 
 		 345 aa  50.4  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000601095 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7458  integrase family protein  30.54 
 
 		 335 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1060  phage integrase  27.59 
 
 		 358 aa  50.1  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.219086  normal  0.572085 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.37 
 
 		 296 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.37 
 
 		 296 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3426  tyrosine recombinase XerD  27.84 
 
 		 299 aa  50.1  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3505  phage integrase family protein  26.51 
 
 		 330 aa  50.1  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.431904  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0728  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.82 
 
 		 330 aa  50.1  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442089  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1481  phage integrase family protein  29.07 
 
 		 311 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0281722  normal  0.205606 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  30.41 
 
 		 314 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0272  phage integrase family site specific recombinase  22.4 
 
 		 319 aa  49.7  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0295  phage integrase family site specific recombinase  22.4 
 
 		 319 aa  49.7  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0905  phage integrase family site specific recombinase  22.4 
 
 		 319 aa  49.7  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.64 
 
 		 300 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.9 
 
 		 296 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.59 
 
 		 296 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.59 
 
 		 296 aa  49.7  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.85 
 
 		 296 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0082  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.35 
 
 		 339 aa  49.7  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.472951  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2440  tyrosine recombinase XerD  35.62 
 
 		 332 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  25.39 
 
 		 301 aa  49.7  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.59 
 
 		 296 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  26.84 
 
 		 307 aa  49.7  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.91 
 
 		 318 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2260  integrase family protein  28.72 
 
 		 395 aa  50.1  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.46728  normal  0.0539974 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3266  phage integrase family protein  28.57 
 
 		 330 aa  49.7  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.119927  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.9 
 
 		 296 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.59 
 
 		 296 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  25.41 
 
 		 298 aa  49.7  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.91 
 
 		 318 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>