28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2533 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2533  50S ribosomal protein L12P  100 
 
 
112 aa  195  1.0000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.386824  normal  0.269455 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1519  ribosomal protein 60S  88.89 
 
 
116 aa  92.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0256  50S ribosomal protein L12P  94 
 
 
114 aa  90.1  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3520  ribosomal protein 60S  87.04 
 
 
113 aa  89  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.107265  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2184  ribosomal protein 60S  90 
 
 
116 aa  85.9  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.603129  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0878  50S ribosomal protein L12P  60.94 
 
 
108 aa  79  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1699  50S ribosomal protein L12P  55.38 
 
 
110 aa  79  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0899103 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0415  50S ribosomal protein L12P  68.52 
 
 
105 aa  77  0.00000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.18162  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0654  50S ribosomal protein L12P  48.21 
 
 
103 aa  75.1  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00068543  normal  0.300749 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0187  50S ribosomal protein L12P  68.52 
 
 
99 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0720  50S ribosomal protein L12P  58.93 
 
 
107 aa  71.6  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0612  50S ribosomal protein L12P  68 
 
 
106 aa  71.2  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000227092  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1709  50S ribosomal protein L12P  57.14 
 
 
108 aa  71.2  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.49137  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1948  50S ribosomal protein L12P  67.31 
 
 
100 aa  70.9  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0442001  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0165  50S ribosomal protein L12P  61.11 
 
 
102 aa  70.5  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0552714  normal  0.589504 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0784  50S ribosomal protein L12P  55.36 
 
 
109 aa  68.6  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2249  50S ribosomal protein L12P  58.18 
 
 
103 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  unclonable  0.0000000000341588  normal  0.119729 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0621  50S ribosomal protein L12P  53.57 
 
 
108 aa  66.2  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0860  ribosomal protein 60S  54.55 
 
 
105 aa  66.2  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1579  50S ribosomal protein L12P  56.36 
 
 
103 aa  64.7  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00723578  hitchhiker  0.00569921 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1419  50S ribosomal protein L12P  55.56 
 
 
105 aa  64.3  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.893644  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1637  50S ribosomal protein L12P  56.36 
 
 
102 aa  63.9  0.0000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.461477  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1261  50S ribosomal protein L12P  65.31 
 
 
99 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0732344  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0695  50S ribosomal protein L12P  65.31 
 
 
99 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1415  50S ribosomal protein L12P  65.31 
 
 
99 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0374  50S ribosomal protein L12P  60 
 
 
105 aa  62.4  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1314  ribosomal protein 60S  50.91 
 
 
106 aa  61.2  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1271  50S ribosomal protein L12P  57.14 
 
 
99 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>