More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2227 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2227  MutL dimerisation  100 
 
 
584 aa  1110    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.000451621  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  33.82 
 
 
603 aa  312  9e-84  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1195  MutL/HexB family DNA mismatch repair protein  35.26 
 
 
566 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0321912  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_978  DNA mismatch repair protein, MutL/HexB family  34.92 
 
 
566 aa  304  3.0000000000000004e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  31.96 
 
 
586 aa  303  5.000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  32.42 
 
 
559 aa  302  9e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1006  DNA mismatch repair protein MutL  34.74 
 
 
566 aa  297  3e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  35.34 
 
 
612 aa  293  4e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  34.78 
 
 
605 aa  290  5.0000000000000004e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0554  DNA mismatch repair protein MutL  37.44 
 
 
565 aa  290  7e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  34.94 
 
 
605 aa  288  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0433  DNA mismatch repair protein MutL  36.75 
 
 
544 aa  286  5e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.397658  normal  0.543427 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  34.82 
 
 
611 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1538  DNA mismatch repair protein MutL  39.37 
 
 
549 aa  286  1.0000000000000001e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.186199  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  35.58 
 
 
585 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1521  DNA mismatch repair protein MutL  37.63 
 
 
540 aa  283  4.0000000000000003e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1478  DNA mismatch repair protein MutL  35.4 
 
 
557 aa  282  1e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.064699  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0934  DNA mismatch repair protein  34.56 
 
 
603 aa  280  6e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1078  DNA mismatch repair protein MutL  29.57 
 
 
572 aa  271  2e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0628  DNA mismatch repair protein MutL  37.52 
 
 
582 aa  270  4e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100256  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1924  DNA mismatch repair protein MutL  35.48 
 
 
560 aa  268  2.9999999999999995e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  35.98 
 
 
606 aa  267  4e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  33.12 
 
 
606 aa  266  8e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  32.37 
 
 
602 aa  265  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0993  DNA mismatch repair protein  33.61 
 
 
589 aa  266  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.139394  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  34.36 
 
 
611 aa  265  2e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  35.52 
 
 
602 aa  265  2e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  36.51 
 
 
607 aa  263  8e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  32.61 
 
 
575 aa  262  1e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0977  DNA mismatch repair ATPase  29.18 
 
 
584 aa  262  1e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0710055  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  32.61 
 
 
574 aa  261  2e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  36.67 
 
 
607 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  32.17 
 
 
622 aa  260  5.0000000000000005e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1168  DNA mismatch repair protein  33.39 
 
 
588 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.985109  normal  0.444607 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  32.8 
 
 
605 aa  254  3e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0293  DNA mismatch repair protein MutL  38.66 
 
 
532 aa  252  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7371  DNA mismatch repair protein MutL  34.38 
 
 
621 aa  251  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  34.93 
 
 
616 aa  251  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  35.79 
 
 
601 aa  249  1e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1217  DNA mismatch repair protein  30.91 
 
 
612 aa  248  2e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469734  normal  0.0661873 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1626  DNA mismatch repair protein  34.97 
 
 
603 aa  248  2e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.951242 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1499  DNA mismatch repair protein MutL  27.59 
 
 
589 aa  247  4.9999999999999997e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  33.82 
 
 
598 aa  246  8e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  32.32 
 
 
608 aa  244  3e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3225  DNA mismatch repair protein MutL  30.1 
 
 
599 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142793  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1331  DNA mismatch repair protein MutL  32.59 
 
 
579 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  29.12 
 
 
624 aa  241  2.9999999999999997e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  32.17 
 
 
605 aa  240  6.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0363  DNA mismatch repair protein  34.08 
 
 
621 aa  239  8e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127252  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0376  DNA mismatch repair protein MutL  45.43 
 
 
709 aa  238  2e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.13305  normal  0.32452 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  34.52 
 
 
597 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  34.09 
 
 
597 aa  237  4e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3169  DNA mismatch repair protein  34.13 
 
 
603 aa  236  6e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.484911  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2127  DNA mismatch repair protein  34.13 
 
 
603 aa  236  7e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4047  DNA mismatch repair protein  34.14 
 
 
610 aa  236  7e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0023  DNA mismatch repair protein MutL  27.1 
 
 
621 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000493473  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0072  DNA mismatch repair protein  37.04 
 
 
647 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  35.8 
 
 
649 aa  233  6e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1711  DNA mismatch repair protein MutL  26.83 
 
 
588 aa  233  9e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.619498  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  30.37 
 
 
626 aa  232  1e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2548  DNA mismatch repair protein  34.17 
 
 
603 aa  231  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17269  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  32.05 
 
 
600 aa  231  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  31.78 
 
 
600 aa  230  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  33.06 
 
 
595 aa  229  8e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2031  DNA mismatch repair protein MutL  32.26 
 
 
604 aa  229  1e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440642  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  41.55 
 
 
620 aa  229  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  28.46 
 
 
611 aa  229  1e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3509  DNA mismatch repair protein  35.14 
 
 
647 aa  228  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  33.01 
 
 
594 aa  228  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3802  DNA mismatch repair protein  35.14 
 
 
647 aa  228  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.618994  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3617  DNA mismatch repair protein  35.14 
 
 
626 aa  228  3e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.552847  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3904  DNA mismatch repair protein  35.14 
 
 
626 aa  228  3e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595251  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1432  DNA mismatch repair protein  35.14 
 
 
647 aa  228  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.980701 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3780  DNA mismatch repair protein  35.14 
 
 
647 aa  228  3e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0217989 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3867  DNA mismatch repair protein  35.14 
 
 
647 aa  227  4e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3527  DNA mismatch repair protein  35.14 
 
 
647 aa  227  4e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3815  DNA mismatch repair protein  35.14 
 
 
647 aa  227  4e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  37.78 
 
 
619 aa  227  6e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3539  DNA mismatch repair protein  35.14 
 
 
644 aa  226  7e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0267  DNA mismatch repair protein MutL  28.11 
 
 
622 aa  225  1e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000997696 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0007  DNA mismatch repair protein MutL  43.27 
 
 
709 aa  226  1e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.953905  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1927  mismatch repair protein MutL  32.17 
 
 
595 aa  225  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1599  DNA mismatch repair protein MutL  32.17 
 
 
595 aa  225  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.907039  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0413  DNA mismatch repair protein  33.68 
 
 
630 aa  225  2e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1289  DNA mismatch repair protein MutL  43.38 
 
 
765 aa  223  9e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  35.48 
 
 
659 aa  221  3e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  38.46 
 
 
639 aa  221  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0629  DNA mismatch repair protein MutL  46.06 
 
 
767 aa  216  5.9999999999999996e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0769  DNA mismatch repair protein MutL  28.4 
 
 
551 aa  216  9e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  32.23 
 
 
616 aa  216  9.999999999999999e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1937  DNA mismatch repair protein  29.18 
 
 
561 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0901  DNA mismatch repair protein MutL  30.48 
 
 
516 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0526  DNA mismatch repair protein  37.5 
 
 
668 aa  215  1.9999999999999998e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4780  DNA mismatch repair protein MutL  42.66 
 
 
671 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.131576  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1964  DNA mismatch repair protein  29.18 
 
 
561 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.176062 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3218  DNA mismatch repair protein MutL  42.46 
 
 
738 aa  214  4.9999999999999996e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  37.19 
 
 
647 aa  213  7.999999999999999e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4632  DNA mismatch repair protein MutL  43.2 
 
 
661 aa  212  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.56362  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1494  DNA mismatch repair protein MutL  36.12 
 
 
692 aa  211  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  41.62 
 
 
628 aa  212  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>