12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1909 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1909  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  500  1e-141  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.928728  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0969  hypothetical protein  64.61 
 
 
253 aa  299  3e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.637317  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0220  hypothetical protein  70.97 
 
 
226 aa  284  1.0000000000000001e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0568109  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2115  hypothetical protein  83.23 
 
 
241 aa  279  3e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0390  hypothetical protein  81.25 
 
 
216 aa  256  2e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0757  hypothetical protein  65.48 
 
 
190 aa  228  5e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.016863  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1198  hypothetical protein  66.89 
 
 
202 aa  224  7e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.666429  normal  0.0400405 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0487  hypothetical protein  64.29 
 
 
186 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0716  hypothetical protein  64.38 
 
 
271 aa  206  2e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0592782  normal  0.0503342 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2022  hypothetical protein  63.12 
 
 
185 aa  206  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0786  hypothetical protein  65.31 
 
 
201 aa  203  2e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00417642  unclonable  0.0000000000000881752 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1474  hypothetical protein  39.61 
 
 
153 aa  119  6e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000625179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>