59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1827 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1827  hypothetical protein  100 
 
 
114 aa  219  9.999999999999999e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.447916  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0292  conserved hypothetical protein-like protein  57.58 
 
 
177 aa  118  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2133  hypothetical protein  56.14 
 
 
190 aa  115  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.670614  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4122  hypothetical protein  35.45 
 
 
116 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2895  hypothetical protein  42.31 
 
 
123 aa  77.8  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0282  hypothetical protein  41.18 
 
 
118 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.844677  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0274  hypothetical protein  41.18 
 
 
118 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0278  hypothetical protein  41.18 
 
 
118 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0281  hypothetical protein  41.18 
 
 
118 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.083962  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4455  hypothetical protein  40 
 
 
118 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2891  hypothetical protein  39.05 
 
 
116 aa  73.9  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2511  hypothetical protein  39.05 
 
 
116 aa  73.9  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0271  hypothetical protein  40 
 
 
118 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0335891  hitchhiker  0.000000928921 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3751  hypothetical protein  40 
 
 
118 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.855057  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0270  hypothetical protein  40 
 
 
118 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.280793  hitchhiker  0.0000338917 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0084  hypothetical protein  39.8 
 
 
106 aa  72  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00233464  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4796  hypothetical protein  34.55 
 
 
130 aa  72  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000986952 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2286  hypothetical protein  38.24 
 
 
249 aa  71.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0386  hypothetical protein  38.82 
 
 
118 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.955149  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4405  hypothetical protein  33.64 
 
 
122 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.062557 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2185  hypothetical protein  37.38 
 
 
186 aa  68.6  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000358474  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1187  putative acyltransferase  30.07 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0796  putative acyltransferase  30.07 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01895  hypothetical protein  35 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.841581  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0007  hypothetical protein  34.45 
 
 
127 aa  62.4  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146803  normal  0.457829 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1684  hypothetical protein  38.82 
 
 
149 aa  61.6  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.43716  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4034  hypothetical protein  38.82 
 
 
103 aa  61.6  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.714126  normal  0.124652 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6109  hypothetical protein  31.97 
 
 
123 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.240856  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4385  hypothetical protein  35.85 
 
 
123 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0079  hypothetical protein  40 
 
 
119 aa  60.1  0.000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70400  hypothetical protein  31.97 
 
 
123 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4452  hypothetical protein  32 
 
 
113 aa  58.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02323  hypothetical protein  36.47 
 
 
121 aa  58.9  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000435159  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17320  hypothetical protein  40.19 
 
 
243 aa  58.5  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.755634  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0149  hypothetical protein  30.77 
 
 
113 aa  57.8  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.162646 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5293  hypothetical protein  38.75 
 
 
122 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.44714 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5201  hypothetical protein  38.75 
 
 
122 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.402389  normal  0.38056 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0836  hypothetical protein  30.48 
 
 
172 aa  57  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5546  hypothetical protein  35.45 
 
 
122 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02860  hypothetical protein  31.53 
 
 
122 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3457  hypothetical protein  37.93 
 
 
113 aa  54.3  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.442595 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2369  hypothetical protein  27.94 
 
 
140 aa  53.9  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.602721  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2326  hypothetical protein  27.94 
 
 
140 aa  53.9  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3837  hypothetical protein  36.78 
 
 
225 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.120142  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0699  hypothetical protein  32.79 
 
 
442 aa  51.6  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1883  hypothetical protein  26.52 
 
 
164 aa  50.8  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2606  hypothetical protein  28.16 
 
 
113 aa  50.4  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.209325  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2587  hypothetical protein  40.22 
 
 
116 aa  50.4  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000426932  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4462  hypothetical protein  37.5 
 
 
111 aa  50.1  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.973626  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3082  hypothetical protein  33.02 
 
 
162 aa  48.9  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000976095  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0698  hypothetical protein  32.04 
 
 
210 aa  47.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.677149 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0263  hypothetical protein  33.64 
 
 
108 aa  46.2  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232942  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0078  hypothetical protein  32.08 
 
 
123 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11670  hypothetical protein  30.4 
 
 
179 aa  41.2  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0590799  normal  0.654149 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2134  hypothetical protein  33.33 
 
 
133 aa  41.2  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.412049  normal  0.374692 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3071  hypothetical protein  30.77 
 
 
186 aa  40.8  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0214  hypothetical protein  32.65 
 
 
122 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06540  hypothetical protein  28.43 
 
 
127 aa  40.8  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0931941  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2816  hypothetical protein  35.14 
 
 
148 aa  40.8  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>