42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0923 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0923  transposase  100 
 
 		 178 aa  372  1e-102  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.134513  decreased coverage  0.0000447966 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3528  transposase  85.39 
 
 		 212 aa  323  7e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1512  transposase  85.39 
 
 		 212 aa  323  7e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0582203 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1494  transposase  85.39 
 
 		 212 aa  323  7e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.913135  normal  0.873536 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0068  transposase  47.75 
 
 		 211 aa  178  4.999999999999999e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0984567 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4218  Transposase and inactivated derivatives-like protein  41.01 
 
 		 205 aa  149  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0059  IS240-type transposase (ISH102)  42.46 
 
 		 206 aa  144  6e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0254142  normal  0.2099 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4966  Integrase catalytic region  35.67 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3224  transposase  33.72 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4047  Integrase catalytic region  35.03 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4863  Integrase catalytic region  34.39 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0858  transposase  35.67 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3914  Integrase catalytic region  31.85 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.835776  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4959  Transposase and inactivated derivatives-like protein  37.21 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2554  transposase  39.74 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.191723 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4519  putative transposase  27.46 
 
 		 233 aa  51.2  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00999598  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5656  integrase catalytic region  33.64 
 
 		 235 aa  48.1  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204963 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4457  putative transposase  26.76 
 
 		 233 aa  48.1  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4459  putative transposase  26.76 
 
 		 233 aa  48.1  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4618  putative transposase  26.76 
 
 		 233 aa  48.1  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0617811  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4632  putative transposase  26.76 
 
 		 233 aa  48.1  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223023  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3336  IS240 transposase  30.43 
 
 		 202 aa  47  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1619  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5663  integrase catalytic region  27.94 
 
 		 235 aa  46.6  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884972 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5621  integrase catalytic region  27.41 
 
 		 235 aa  46.6  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7500  transposase  32.35 
 
 		 255 aa  45.8  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5614  integrase catalytic region  27.21 
 
 		 235 aa  45.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2422  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 353 aa  43.9  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2640  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 353 aa  43.9  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1944  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 353 aa  43.9  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.704589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0674  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 353 aa  43.9  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3209  transposase  30.69 
 
 		 218 aa  43.9  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262352  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3268  integrase catalytic region  30.21 
 
 		 212 aa  43.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2243  Integrase catalytic region  32.29 
 
 		 353 aa  42.7  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.781166 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0561  transposase protein  25.41 
 
 		 233 aa  42.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2409  Integrase catalytic region  32.29 
 
 		 353 aa  42.7  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2179  Integrase catalytic region  32.29 
 
 		 353 aa  42.7  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000521095  hitchhiker  1.88153e-16 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1912  Integrase catalytic region  32.29 
 
 		 353 aa  42.7  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1065  Integrase catalytic region  32.29 
 
 		 353 aa  42.7  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.106559 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0243  Integrase catalytic region  32.29 
 
 		 353 aa  42.7  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0037  Integrase catalytic region  32.29 
 
 		 353 aa  42.7  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4167  putative transposase  32.18 
 
 		 237 aa  42  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4083  transposase  32.18 
 
 		 236 aa  42  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>