More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0707 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0707  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  100 
 
 		 357 aa  691    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.000356542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1114  NADH dehydrogenase (quinone)  67.96 
 
 		 364 aa  469  1.0000000000000001e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3252  NADH dehydrogenase (quinone)  68.17 
 
 		 371 aa  462  1e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1920  NADH dehydrogenase (quinone)  65.44 
 
 		 351 aa  450  1e-125  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.179258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  69.06 
 
 		 355 aa  431  1e-119  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  40.86 
 
 		 353 aa  225  8e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0203  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  38.27 
 
 		 329 aa  224  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.746542  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  41.53 
 
 		 353 aa  224  2e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_798  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)  41.53 
 
 		 353 aa  224  2e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  41.72 
 
 		 341 aa  219  5e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0981  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  40 
 
 		 348 aa  218  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1626  NADH dehydrogenase (quinone)  39.17 
 
 		 440 aa  215  9e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0675277 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2042  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  37.03 
 
 		 349 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268939  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1666  NADH dehydrogenase subunit H  37.89 
 
 		 372 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3409  NADH dehydrogenase subunit H  39.68 
 
 		 333 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0370  NADH dehydrogenase (quinone)  38.41 
 
 		 420 aa  213  5.999999999999999e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.455618  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5533  NADH dehydrogenase subunit H  39.68 
 
 		 333 aa  212  9e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5417  NADH dehydrogenase subunit H  39.68 
 
 		 333 aa  212  9e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1353  NADH dehydrogenase subunit H  40.72 
 
 		 316 aa  211  1e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5421  NADH dehydrogenase subunit H  39.68 
 
 		 333 aa  211  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5146  NADH dehydrogenase subunit H  39.68 
 
 		 333 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4996  NADH dehydrogenase subunit H  39.68 
 
 		 333 aa  211  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5538  NADH dehydrogenase subunit H  39.68 
 
 		 333 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5472  NADH dehydrogenase subunit H  39.68 
 
 		 333 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5387  NADH dehydrogenase subunit H  39.68 
 
 		 333 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14052e-18 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4978  NADH dehydrogenase subunit H  39.68 
 
 		 333 aa  211  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5094  NADH dehydrogenase subunit H  39.68 
 
 		 333 aa  211  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01891  NADH dehydrogenase subunit H  38.51 
 
 		 372 aa  208  9e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  38.34 
 
 		 337 aa  208  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  39.54 
 
 		 329 aa  207  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3815  NADH dehydrogenase subunit H  38.06 
 
 		 333 aa  206  4e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  36.73 
 
 		 348 aa  205  9e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1597  NADH dehydrogenase subunit H  37.34 
 
 		 416 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1573  NADH dehydrogenase subunit H  37.34 
 
 		 416 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1543  NADH dehydrogenase subunit H  37.34 
 
 		 416 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671965  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2866  NADH dehydrogenase (quinone)  38.68 
 
 		 317 aa  204  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.473976  normal  0.0334094 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01801  NADH dehydrogenase subunit H  37.58 
 
 		 372 aa  203  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.624846  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01781  NADH dehydrogenase subunit H  37.58 
 
 		 372 aa  203  3e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.236332  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0161  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  39.68 
 
 		 329 aa  203  4e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0162  NADH dehydrogenase subunit H  37.58 
 
 		 372 aa  203  4e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01771  NADH dehydrogenase subunit H  36.96 
 
 		 384 aa  203  4e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0970603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1878  NADH dehydrogenase subunit H  37.66 
 
 		 411 aa  203  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.349775  normal  0.979867 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4488  NADH dehydrogenase subunit H  37.58 
 
 		 410 aa  202  5e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0439887 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0402  NADH dehydrogenase  36.59 
 
 		 372 aa  202  6e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1343  NADH dehydrogenase subunit H  37.04 
 
 		 372 aa  202  9e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0591  NADH dehydrogenase (quinone)  37.13 
 
 		 448 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  38.44 
 
 		 330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1019  NADH dehydrogenase subunit H  37.77 
 
 		 317 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2714  NADH dehydrogenase subunit H  37.22 
 
 		 372 aa  200  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.834243  normal  0.483082 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1121  NADH dehydrogenase subunit H  39.8 
 
 		 319 aa  200  3e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.308781  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1209  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  35.39 
 
 		 349 aa  200  3e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000168928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4551  NADH dehydrogenase (quinone)  36.53 
 
 		 486 aa  200  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1527  NADH dehydrogenase subunit H  37.12 
 
 		 372 aa  199  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.732572  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4985  NADH dehydrogenase (quinone)  36.36 
 
 		 413 aa  200  3.9999999999999996e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.101143  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0174  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  39.34 
 
 		 330 aa  199  5e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.76533  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0325  NADH dehydrogenase (quinone)  38.56 
 
 		 329 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4411  NADH dehydrogenase (quinone)  35.1 
 
 		 438 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02331  NADH dehydrogenase subunit H  36.81 
 
 		 372 aa  198  9e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.896857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0156  NADH dehydrogenase (quinone)  39.02 
 
 		 330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.615758 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26911  NADH dehydrogenase subunit H  35.49 
 
 		 384 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1281  NADH dehydrogenase (quinone)  37.92 
 
 		 447 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.522555 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  39.02 
 
 		 331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1579  NADH dehydrogenase subunit H  35.65 
 
 		 372 aa  197  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  36.41 
 
 		 349 aa  196  6e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0395  NADH dehydrogenase (quinone)  37.46 
 
 		 433 aa  196  7e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  35.85 
 
 		 349 aa  194  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  35.96 
 
 		 349 aa  194  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3747  NADH dehydrogenase (quinone)  38.95 
 
 		 351 aa  194  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000186465  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0288  NADH dehydrogenase  38.01 
 
 		 452 aa  193  5e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.957088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1053  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  36.14 
 
 		 350 aa  192  6e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  36.07 
 
 		 322 aa  192  9e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2093  NADH dehydrogenase (quinone)  34.56 
 
 		 452 aa  191  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3088  NADH dehydrogenase (quinone)  37.28 
 
 		 357 aa  191  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93742  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2529  NADH dehydrogenase subunit H  35.96 
 
 		 372 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  34.78 
 
 		 364 aa  191  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1010  NADH dehydrogenase subunit H  36.59 
 
 		 372 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1039  NADH dehydrogenase subunit H  36.59 
 
 		 372 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000216191 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1308  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  35.35 
 
 		 354 aa  190  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0928  NADH dehydrogenase (quinone)  36.66 
 
 		 338 aa  190  4e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546214  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3175  NADH dehydrogenase (quinone)  37.12 
 
 		 430 aa  190  4e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.616165  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4125  NADH dehydrogenase subunit H  37.38 
 
 		 335 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3697  NADH dehydrogenase subunit H  37.05 
 
 		 335 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.116468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3819  NADH dehydrogenase (quinone)  36.51 
 
 		 318 aa  188  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.128045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1867  NADH dehydrogenase subunit H  37.05 
 
 		 335 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0487349 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1740  NADH dehydrogenase subunit H  37.38 
 
 		 335 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0467697  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1375  NADH dehydrogenase I chain H  35.1 
 
 		 342 aa  188  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00938294  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1276  NADH dehydrogenase (quinone)  37.34 
 
 		 415 aa  188  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.815883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  34.91 
 
 		 451 aa  188  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0981  NADH dehydrogenase (quinone)  36.1 
 
 		 466 aa  188  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4075  NADH dehydrogenase (quinone)  32.01 
 
 		 345 aa  186  4e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.329571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3126  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  39.4 
 
 		 328 aa  186  4e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1015  NADH dehydrogenase subunit H  36.22 
 
 		 322 aa  186  6e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  37.91 
 
 		 337 aa  186  6e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3609  NADH dehydrogenase subunit H  35.19 
 
 		 335 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.339444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1998  NADH dehydrogenase subunit H  38.49 
 
 		 345 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.222188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7012  NADH dehydrogenase (quinone)  32.15 
 
 		 345 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3371  NADH dehydrogenase I, H subunit  35.53 
 
 		 335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.606059  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3203  NADH dehydrogenase subunit H  35.53 
 
 		 335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0243703  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0280  NADH dehydrogenase subunit H  36.69 
 
 		 373 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2412  NADH dehydrogenase subunit H  37.01 
 
 		 373 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>