More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0069 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0069  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
633 aa  1290    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.884442 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2491  extracellular solute-binding protein family 5  42.77 
 
 
592 aa  259  8e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640933  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0116  extracellular solute-binding protein family 5  39.59 
 
 
640 aa  214  4.9999999999999996e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.151425  normal  0.623621 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  28.17 
 
 
532 aa  103  7e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  27.38 
 
 
520 aa  101  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  27.91 
 
 
544 aa  94.7  5e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  28.81 
 
 
538 aa  92.8  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  28.49 
 
 
540 aa  90.5  9e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  26.63 
 
 
544 aa  89.7  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  28.49 
 
 
540 aa  89.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  26.41 
 
 
534 aa  88.2  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  23.82 
 
 
535 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  27.76 
 
 
540 aa  87  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  23.82 
 
 
535 aa  86.3  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  23.82 
 
 
535 aa  86.3  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  23.82 
 
 
535 aa  86.3  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  23.82 
 
 
535 aa  86.3  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  23.82 
 
 
535 aa  86.3  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  25.76 
 
 
531 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  23.82 
 
 
535 aa  86.3  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  23.55 
 
 
535 aa  85.1  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  25.52 
 
 
535 aa  85.1  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0138  extracellular solute-binding protein  23.27 
 
 
535 aa  82.8  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3355  extracellular solute-binding protein  26.88 
 
 
551 aa  82.8  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.188345  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0821  periplasmic oligopeptide-binding  26.15 
 
 
533 aa  81.6  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  26.84 
 
 
528 aa  81.3  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
528 aa  79.7  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  21.88 
 
 
535 aa  78.2  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0212  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 
538 aa  77.4  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0260102  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  22.71 
 
 
535 aa  76.6  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  22.71 
 
 
535 aa  76.6  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  22.71 
 
 
535 aa  76.6  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70200  putative binding protein component of ABC dipeptide transporter  24 
 
 
526 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  25.96 
 
 
538 aa  75.5  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0049  extracellular solute-binding protein family 5  21.61 
 
 
535 aa  75.1  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.46848  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3994  extracellular solute-binding protein family 5  23.88 
 
 
541 aa  75.1  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000169157 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  25.14 
 
 
513 aa  74.7  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  21.43 
 
 
535 aa  74.3  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0038  extracellular solute-binding protein  24.61 
 
 
532 aa  74.3  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.216937  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3040  extracellular solute-binding protein  23.23 
 
 
542 aa  74.3  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.607327 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4268  extracellular solute-binding protein family 5  25.84 
 
 
551 aa  73.6  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0187  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 
529 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000120375 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  23.27 
 
 
526 aa  73.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  23.27 
 
 
526 aa  73.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  21.78 
 
 
535 aa  73.2  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  23.27 
 
 
526 aa  73.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  23.27 
 
 
526 aa  73.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1582  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 
531 aa  73.2  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264898  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4328  extracellular solute-binding protein family 5  25.84 
 
 
551 aa  73.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.310509  normal  0.0771259 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  23.27 
 
 
526 aa  73.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  25.15 
 
 
520 aa  72.8  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  24.57 
 
 
513 aa  73.2  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.23 
 
 
538 aa  72  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3231  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  23.64 
 
 
532 aa  71.6  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.704667  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6676  extracellular solute-binding protein family 5  26.01 
 
 
539 aa  71.6  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.479975  normal  0.420932 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3969  extracellular solute-binding protein  23.64 
 
 
532 aa  71.6  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0329  extracellular solute-binding protein  23.32 
 
 
531 aa  71.2  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.0616043 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1671  extracellular solute-binding protein  22.49 
 
 
538 aa  71.2  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4118  family 1 extracellular solute-binding protein  25.61 
 
 
543 aa  70.9  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.794373  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  23.05 
 
 
512 aa  70.9  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2914  extracellular solute-binding protein  21.14 
 
 
543 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1253  extracellular solute-binding protein family 5  22.4 
 
 
517 aa  70.5  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.245274  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5334  extracellular solute-binding protein  23.99 
 
 
535 aa  70.5  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805263 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0223  extracellular solute-binding protein  24.68 
 
 
528 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0927  extracellular solute-binding protein  23.19 
 
 
530 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  23.17 
 
 
512 aa  70.5  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0554  extracellular solute-binding protein  29.1 
 
 
581 aa  70.1  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2505  extracellular solute-binding protein family 5  22.42 
 
 
531 aa  70.5  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  22.73 
 
 
539 aa  70.1  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1224  extracellular solute-binding protein family 5  25.53 
 
 
544 aa  69.3  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0137957 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2654  extracellular solute-binding protein family 5  23.3 
 
 
544 aa  69.3  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.411058  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0923  extracellular solute-binding protein  23.65 
 
 
530 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  23.69 
 
 
535 aa  69.3  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2956  extracellular solute-binding protein  22.58 
 
 
542 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0067  extracellular solute-binding protein  22.6 
 
 
542 aa  68.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6093  putative dipeptide ABC transporter binding protein subunit  23.67 
 
 
526 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.500432  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  22.87 
 
 
512 aa  68.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3301  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  22.26 
 
 
542 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  22.32 
 
 
512 aa  68.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0437  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  22.26 
 
 
574 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.217985  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0807  ABC dipeptide transporter, substrate-binding subunit DdpA  25.15 
 
 
538 aa  68.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123514  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.48 
 
 
510 aa  68.9  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  22.87 
 
 
512 aa  68.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 
512 aa  68.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 
512 aa  68.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2969  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  22.26 
 
 
542 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2465  extracellular solute-binding protein  24.85 
 
 
529 aa  68.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.352303 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  22.87 
 
 
512 aa  68.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 
512 aa  68.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3378  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  22.26 
 
 
542 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4639  extracellular solute-binding protein family 5  24.79 
 
 
532 aa  68.6  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  24.7 
 
 
540 aa  68.2  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0220  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  22.26 
 
 
542 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63568  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2431  extracellular solute-binding protein  22.9 
 
 
542 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3528  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 
564 aa  68.6  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.61993  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3045  extracellular solute-binding protein  22.9 
 
 
542 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.31 
 
 
540 aa  68.2  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00232176  normal  0.206883 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  26.35 
 
 
515 aa  68.2  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2121  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  22.26 
 
 
536 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443402  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0243  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein DppA  22.26 
 
 
542 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>