11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0012 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0012  hypothetical protein  100 
 
 
94 aa  191  3e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1114  hypothetical protein  42.11 
 
 
95 aa  82.4  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.0000910124  normal  0.0243823 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0195  hypothetical protein  43.16 
 
 
95 aa  78.6  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2026  hypothetical protein  44.21 
 
 
95 aa  77.4  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0850  hypothetical protein  35.62 
 
 
118 aa  59.3  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1446  hypothetical protein  37.5 
 
 
106 aa  49.3  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1466  hypothetical protein  31.25 
 
 
85 aa  45.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2243  hypothetical protein  25.93 
 
 
114 aa  45.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1045  hypothetical protein  26.6 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0440  hypothetical protein  26.58 
 
 
114 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2829  hypothetical protein  34.69 
 
 
128 aa  40.4  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>