More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0651 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0651  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 449 aa  884    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0589  DNA repair protein RadA  70.73 
 
 		 451 aa  618  1e-176  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.268839  hitchhiker  1.37134e-16 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0423  DNA repair protein RadA  65.56 
 
 		 448 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0841  DNA repair protein RadA  64.77 
 
 		 457 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4275  DNA repair protein RadA  63 
 
 		 455 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783093  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4640  DNA repair protein RadA  62.56 
 
 		 455 aa  570  1e-161  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4885  DNA repair protein RadA  62.33 
 
 		 455 aa  569  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0756  DNA repair protein RadA  63.05 
 
 		 453 aa  565  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4506  DNA repair protein RadA  62.2 
 
 		 456 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4644  DNA repair protein RadA  62.2 
 
 		 456 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.592741 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0794  DNA repair protein RadA  62.33 
 
 		 477 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5249  DNA repair protein RadA  62.83 
 
 		 453 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60990  DNA repair protein RadA  62.78 
 
 		 453 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41070  DNA repair protein RadA  63.44 
 
 		 453 aa  561  1.0000000000000001e-159  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.51547  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4638  DNA repair protein RadA  62.2 
 
 		 456 aa  561  1e-158  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.854791  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1385  DNA repair protein RadA  63.15 
 
 		 447 aa  555  1e-157  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.674348  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2274  DNA repair protein RadA  59.02 
 
 		 450 aa  543  1e-153  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2246  DNA repair protein RadA  59.02 
 
 		 450 aa  544  1e-153  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0839  DNA repair protein RadA  57.8 
 
 		 458 aa  539  9.999999999999999e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01540  DNA repair protein RadA  60.7 
 
 		 464 aa  539  9.999999999999999e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.850923  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0575  DNA repair protein RadA  58.26 
 
 		 451 aa  536  1e-151  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0225  DNA repair protein RadA  61.84 
 
 		 456 aa  536  1e-151  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1582  DNA repair protein RadA  58.04 
 
 		 451 aa  536  1e-151  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655938  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0406  DNA repair protein RadA  58.37 
 
 		 454 aa  536  1e-151  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.509389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02991  DNA repair protein RadA  56.83 
 
 		 455 aa  536  1e-151  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04265  predicted repair protein  56.09 
 
 		 460 aa  530  1e-149  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4938  DNA repair protein RadA  56.09 
 
 		 460 aa  530  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.664332 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0827  DNA repair protein RadA  56.81 
 
 		 482 aa  530  1e-149  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3667  DNA repair protein RadA  56.09 
 
 		 460 aa  530  1e-149  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.696085 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1145  DNA repair protein RadA  60.61 
 
 		 458 aa  528  1e-149  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04230  hypothetical protein  56.09 
 
 		 460 aa  530  1e-149  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0548  DNA repair protein RadA  55.87 
 
 		 461 aa  528  1e-149  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4624  DNA repair protein RadA  56.09 
 
 		 460 aa  530  1e-149  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0646  DNA repair protein RadA  58.68 
 
 		 463 aa  530  1e-149  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4988  DNA repair protein RadA  56.09 
 
 		 460 aa  530  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0731  DNA repair protein RadA  58.68 
 
 		 463 aa  530  1e-149  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5903  DNA repair protein RadA  56.09 
 
 		 460 aa  530  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4936  DNA repair protein RadA  56.09 
 
 		 460 aa  530  1e-149  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3609  DNA repair protein RadA  56.46 
 
 		 460 aa  528  1e-148  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0626  DNA repair protein RadA  53.73 
 
 		 459 aa  525  1e-148  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0825  DNA repair protein RadA  55.58 
 
 		 460 aa  527  1e-148  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03370  DNA repair protein RadA  55.56 
 
 		 459 aa  525  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002636  DNA repair protein RadA  55.56 
 
 		 459 aa  526  1e-148  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00949545  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1778  DNA repair protein RadA  61.3 
 
 		 460 aa  526  1e-148  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0510  DNA repair protein RadA  57.21 
 
 		 458 aa  526  1e-148  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.150975  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3621  DNA repair protein RadA  55.58 
 
 		 460 aa  527  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3492  DNA repair protein RadA  55.58 
 
 		 460 aa  527  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4830  DNA repair protein RadA  55.22 
 
 		 460 aa  521  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0667  DNA repair protein RadA  54.92 
 
 		 461 aa  522  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4937  DNA repair protein RadA  55.22 
 
 		 460 aa  521  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4991  DNA repair protein RadA  55.22 
 
 		 460 aa  521  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4903  DNA repair protein RadA  55.22 
 
 		 460 aa  521  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4989  DNA repair protein RadA  55.22 
 
 		 460 aa  519  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.541639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  58.17 
 
 		 453 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3470  DNA repair protein RadA  56.77 
 
 		 461 aa  514  1.0000000000000001e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1188  DNA repair protein RadA  55.26 
 
 		 458 aa  516  1.0000000000000001e-145  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1148  DNA repair protein RadA  55.29 
 
 		 454 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0384904 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3358  DNA repair protein RadA  55.29 
 
 		 454 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.918494 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2814  DNA repair protein RadA  55.07 
 
 		 454 aa  512  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  58.33 
 
 		 462 aa  514  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1487  DNA repair protein RadA  55.23 
 
 		 481 aa  512  1e-144  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.652724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1045  DNA repair protein RadA  55.95 
 
 		 454 aa  513  1e-144  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.665867  normal  0.0445974 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1110  DNA repair protein RadA  55.95 
 
 		 454 aa  513  1e-144  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3219  DNA repair protein RadA  55.29 
 
 		 454 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1049  DNA repair protein RadA  55.95 
 
 		 454 aa  513  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.357607 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3219  DNA repair protein RadA  55.29 
 
 		 454 aa  514  1e-144  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1226  DNA repair protein RadA  55.73 
 
 		 454 aa  511  1e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0449  DNA repair protein RadA  55.36 
 
 		 460 aa  511  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0204936  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0994  DNA repair protein RadA  54.32 
 
 		 457 aa  508  1e-143  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2476  DNA repair protein RadA  58.98 
 
 		 458 aa  508  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409258  hitchhiker  0.0000251063 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0546  DNA repair protein RadA  54.92 
 
 		 460 aa  509  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0927  DNA repair protein RadA  54.91 
 
 		 482 aa  507  9.999999999999999e-143  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5347  DNA repair protein RadA  59.42 
 
 		 458 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1280  DNA repair protein RadA  53.96 
 
 		 454 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2077  DNA repair protein RadA  58.15 
 
 		 458 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0646051  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1574  DNA repair protein RadA  58.15 
 
 		 458 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.700761  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2057  DNA repair protein RadA  59.2 
 
 		 458 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.168969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2602  DNA repair protein RadA  58.15 
 
 		 458 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0200982  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1349  DNA repair protein RadA  58.15 
 
 		 458 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517323  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2008  DNA repair protein RadA  58.15 
 
 		 458 aa  503  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480875  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1239  DNA repair protein RadA  58.11 
 
 		 458 aa  502  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.873439 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1661  DNA repair protein RadA  58.54 
 
 		 458 aa  502  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0578663  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1401  DNA repair protein RadA  59.15 
 
 		 455 aa  503  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.227517  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3659  DNA repair protein RadA  56.52 
 
 		 462 aa  501  1e-141  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.217436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6039  DNA repair protein RadA  58.98 
 
 		 458 aa  501  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.667951  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2457  DNA repair protein RadA  58.15 
 
 		 458 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108981  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2513  DNA repair protein RadA  58.15 
 
 		 458 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167746  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3235  DNA repair protein RadA  58.15 
 
 		 458 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.150478  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2038  DNA repair protein RadA  59.2 
 
 		 458 aa  504  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3589  DNA repair protein RadA  54.59 
 
 		 461 aa  499  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36569  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1922  DNA repair protein RadA  54.59 
 
 		 459 aa  499  1e-140  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000667281  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1245  DNA repair protein RadA  58.48 
 
 		 456 aa  499  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.579553 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2070  DNA repair protein RadA  58.76 
 
 		 458 aa  501  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1939  DNA repair protein RadA  58.76 
 
 		 458 aa  500  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.763295 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0965  DNA repair protein RadA  59.33 
 
 		 450 aa  495  1e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1311  DNA repair protein RadA  58.26 
 
 		 456 aa  496  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1358  DNA repair protein RadA  57.43 
 
 		 458 aa  495  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156859  normal  0.874233 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1035  DNA repair protein RadA  54.59 
 
 		 458 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3556  DNA repair protein RadA  58.09 
 
 		 457 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1372  DNA repair protein RadA  58.59 
 
 		 456 aa  490  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232721  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>