19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2905 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2905  hypothetical protein  100 
 
 
357 aa  722    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000828177  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0790  hypothetical protein  25.57 
 
 
343 aa  78.2  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6131  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.89 
 
 
667 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0466  amidohydrolase  24.34 
 
 
1113 aa  50.4  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.83396  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1154  WD40-like beta propeller protein  38.46 
 
 
416 aa  49.7  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  26.83 
 
 
432 aa  49.3  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336659  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  26.7 
 
 
1097 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6416  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  26.9 
 
 
362 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31 
 
 
695 aa  46.6  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.232589 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  28.48 
 
 
440 aa  46.2  0.0008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  27.88 
 
 
1060 aa  46.2  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  28.48 
 
 
437 aa  46.2  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3021  hypothetical protein  40 
 
 
499 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0380667  normal  0.511265 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2150  hypothetical protein  29.82 
 
 
344 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.251795  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1114  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.62 
 
 
701 aa  44.3  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.131603 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  26.17 
 
 
1081 aa  43.5  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  26.67 
 
 
1065 aa  43.5  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  27.59 
 
 
316 aa  43.5  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1708  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.4 
 
 
652 aa  42.7  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.948007 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>