63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_R0002 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_R0002  tRNA-Pro  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768997  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0050  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09860  tRNA-Pro  87.84 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.513474  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt08  tRNA-Pro  87.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt08  tRNA-Pro  87.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0034  tRNA-Pro  87.1 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000221471  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0060  tRNA-Pro  86.49 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000216222  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0491  tRNA-Pro  86.49 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000930823  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1688  tRNA-Pro  86.49 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0559093  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0037  tRNA-Pro  85.51 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  1.47899e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0057  tRNA-Pro  87.72 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0012  tRNA-Pro  96.77 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.488167  normal  0.183255 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0048  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0197037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09510  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.500506  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0108  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0054  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0066  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  5.89097e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03900  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.319325  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0033  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.520451  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0071  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0705665  normal  0.183777 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0005  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.240002  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14026  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0031  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0030  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0036  tRNA-Pro  83.56 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000203357  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0034  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0742287  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0030  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.419312  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0030  tRNA-Gly  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.121021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0021  tRNA-His  83.82 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.203803 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0051  tRNA-Trp  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0029  tRNA-Pro  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0030  tRNA-Pro  93.55 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.640007  normal  0.447016 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0009  tRNA-Trp  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0050  tRNA-Trp  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0034  tRNA-Pro  93.55 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0052  tRNA-Trp  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1949  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0249  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04840  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.51586 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0057  tRNA-Pro  84.29 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0010  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0030  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000233844  normal  0.0418304 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0063  tRNA-Pro  86 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0042  tRNA-His  83.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443699  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0057  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0007  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.929508 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0030  tRNA-Pro  83.78 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0012  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0032  tRNA-Pro  83.78 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0043  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0225474  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0013  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.793081  normal  0.281432 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26300  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0029  tRNA-Pro  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00564676  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25920  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11950  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.883276 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0015  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11205  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0027  tRNA-Pro  88.1 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000011857  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  83.78 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.630554  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0010  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0035  tRNA-Pro  83.78 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.211477  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0012  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.189557  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0094  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0016  tRNA-Pro  83.78 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319335  normal  0.075677 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>