194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1129 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1129  ribosomal protein S20  100 
 
 		 93 aa  183  7e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0094  ribosomal protein S20  44.44 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  8.25858e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1106  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 93 aa  65.1  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00644283  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1587  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  42.7 
 
 		 89 aa  61.6  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 		 86 aa  60.8  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  40.45 
 
 		 89 aa  60.5  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  46.07 
 
 		 91 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503412 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  43.53 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0950  30S ribosomal protein S20  48.1 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  38.82 
 
 		 87 aa  57.4  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40720  30S ribosomal protein S20  44.94 
 
 		 91 aa  57  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0700  ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 92 aa  57  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000536683  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4855  30S ribosomal protein S20  46.84 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  41.49 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134662  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  41.67 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0600  30S ribosomal protein S20  45.57 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218047  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0802  ribosomal protein S20  45.57 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0707  30S ribosomal protein S20  45.57 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4562  30S ribosomal protein S20  45.57 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0646  30S ribosomal protein S20  45.57 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  38.1 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000204078  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0641  30S ribosomal protein S20  45.57 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647122  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1919  30S ribosomal protein S20  39.56 
 
 		 99 aa  53.5  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000179184  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1179  ribosomal protein S20  41.77 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  40.48 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0741  30S ribosomal protein S20  38.1 
 
 		 89 aa  53.5  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1013  30S ribosomal protein S20  41.77 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000773203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5203  30S ribosomal protein S20  44.94 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.614694  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  40.48 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1755  30S ribosomal protein S20  39.33 
 
 		 91 aa  51.6  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00299182  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  39.29 
 
 		 85 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  39.29 
 
 		 85 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  39.29 
 
 		 85 aa  50.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  39.29 
 
 		 85 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  39.29 
 
 		 85 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1037  ribosomal protein S20  42.05 
 
 		 87 aa  50.8  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  39.29 
 
 		 85 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  39.29 
 
 		 85 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153456 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  39.29 
 
 		 85 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3802  SSU ribosomal protein S20P  32.5 
 
 		 88 aa  50.4  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.042204  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0500  30S ribosomal protein S20  39.51 
 
 		 90 aa  50.4  0.000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.166841  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1667  30S ribosomal protein S20  37.5 
 
 		 88 aa  50.1  0.000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00940932  normal  0.076211 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1678  30S ribosomal protein S20  39.51 
 
 		 90 aa  50.4  0.000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  38.1 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  0.0000000000117943 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0696  ribosomal protein S20  39.29 
 
 		 86 aa  50.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207001  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  38.82 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3371  30S ribosomal protein S20  37.08 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1774  30S ribosomal protein S20  36.36 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058734  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  38.82 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  37.65 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  38.82 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4886  30S ribosomal protein S20  39.51 
 
 		 87 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.222256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1487  30S ribosomal protein S20  37.35 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.422821  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1854  SSU ribosomal protein S20P  42.5 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3546  30S ribosomal protein S20  36.25 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4514  30S ribosomal protein S20  38.2 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  39.29 
 
 		 87 aa  48.9  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1806  30S ribosomal protein S20  36.9 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0293621  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3922  30S ribosomal protein S20  37.5 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0771  30S ribosomal protein S20  39.29 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3551  30S ribosomal protein S20  34.83 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  38.82 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  38.82 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0756  30S ribosomal protein S20  39.29 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000125202  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2689  30S ribosomal protein S20  40.45 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2561  30S ribosomal protein S20  40.45 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  40.96 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2031  30S ribosomal protein S20  34.52 
 
 		 87 aa  47.8  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0513769  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3262  ribosomal protein S20  39.51 
 
 		 90 aa  47.8  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521997  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6963  30S ribosomal protein S20  39.29 
 
 		 88 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_002936  DET1639  30S ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 88 aa  47  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000663879  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4315  30S ribosomal protein S20  38.64 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000159944  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1521  ribosomal protein S20  38.37 
 
 		 88 aa  47  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000787873  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3424  SSU ribosomal protein S20P  34.18 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  36.47 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1889  30S ribosomal protein S20  37.04 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1039  ribosomal protein S20  37.93 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000562255  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  37.66 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0075  ribosomal protein S20  36.9 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  37.65 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2188  30S ribosomal protein S20  37.5 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220995  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0492  ribosomal protein S20  39.24 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.131868  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4212  30S ribosomal protein S20  39.33 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0577  30S ribosomal protein S20  42.5 
 
 		 86 aa  45.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000729927  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3188  30S ribosomal protein S20  35.71 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0921444 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0947  ribosomal protein S20  37.04 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1846  30S ribosomal protein S20  37.5 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  37.65 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  36.26 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0546  30S ribosomal protein S20  38.1 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0947  30S ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000396831  normal  0.19884 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0126  30S ribosomal protein S20  36.56 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000563837  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0292  30S ribosomal protein S20  32.14 
 
 		 87 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3238  30S ribosomal protein S20  36.71 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000254037  normal  0.534831 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2211  30S ribosomal protein S20  42.05 
 
 		 87 aa  45.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.829407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1152  30S ribosomal protein S20  36.71 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000294185  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1056  30S ribosomal protein S20  36.71 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134446  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12440  30S ribosomal protein S20  38.82 
 
 		 86 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1118  30S ribosomal protein S20  36.71 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000408096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>