155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1035 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1035  UspA domain protein  100 
 
 
293 aa  582  1.0000000000000001e-165  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  26.69 
 
 
274 aa  82  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  23.33 
 
 
283 aa  72.8  0.000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1774  universal stress protein  29.73 
 
 
142 aa  70.5  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  28.1 
 
 
164 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  25.17 
 
 
289 aa  66.2  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  21.96 
 
 
276 aa  63.5  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  28 
 
 
152 aa  62  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  30.57 
 
 
150 aa  61.6  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  25.66 
 
 
164 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  21.64 
 
 
449 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  22.03 
 
 
288 aa  57.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  28 
 
 
153 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  21.48 
 
 
296 aa  57  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  22.52 
 
 
304 aa  57  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  22.01 
 
 
320 aa  56.6  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  25 
 
 
164 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  31.03 
 
 
142 aa  56.2  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  25.66 
 
 
154 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  22.92 
 
 
291 aa  56.2  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  28.38 
 
 
153 aa  56.2  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3858  hypothetical protein  24.07 
 
 
297 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  27.16 
 
 
156 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  26.44 
 
 
305 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  23.71 
 
 
309 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  26.45 
 
 
155 aa  53.5  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  27.33 
 
 
153 aa  53.5  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0245  universal stress protein  21.21 
 
 
370 aa  53.1  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_580  universal stress protein family  23.53 
 
 
287 aa  53.1  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  25.33 
 
 
147 aa  53.1  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2338  UspA domain protein  21.09 
 
 
277 aa  53.1  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  29.58 
 
 
150 aa  52.8  0.000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2314  UspA domain protein  26.32 
 
 
153 aa  52.8  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  25.85 
 
 
149 aa  52.4  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  25.49 
 
 
153 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  24.83 
 
 
147 aa  52  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0538  UspA domain protein  26.9 
 
 
159 aa  52  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  26.03 
 
 
153 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  27.1 
 
 
151 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  25.33 
 
 
152 aa  50.8  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  25.85 
 
 
151 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  30.26 
 
 
172 aa  51.6  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 
148 aa  50.8  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  25.33 
 
 
147 aa  50.8  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  19.59 
 
 
275 aa  50.1  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  29.8 
 
 
145 aa  50.4  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  24.87 
 
 
294 aa  50.1  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  28.67 
 
 
152 aa  49.7  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  25 
 
 
288 aa  49.3  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  30.82 
 
 
138 aa  49.7  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1847  UspA domain protein  21.61 
 
 
293 aa  49.3  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000811482 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1135  universal stress protein  22.18 
 
 
281 aa  49.3  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00245865  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  24.67 
 
 
151 aa  48.9  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  24.49 
 
 
145 aa  48.9  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4016  UspA domain protein  26.67 
 
 
142 aa  48.5  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6657  UspA domain protein  27.67 
 
 
311 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  25.34 
 
 
153 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2551  UspA domain-containing protein  22.52 
 
 
278 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000359822  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  22.07 
 
 
162 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  23.08 
 
 
289 aa  48.5  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  25.16 
 
 
212 aa  48.5  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  25.48 
 
 
146 aa  48.1  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  28 
 
 
166 aa  48.1  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2941  hypothetical protein  21.94 
 
 
296 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99893  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2081  UspA domain-containing protein  22.38 
 
 
144 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  24.59 
 
 
298 aa  48.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  23 
 
 
280 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0554  UspA domain-containing protein  22.09 
 
 
265 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000788361 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1228  UspA domain-containing protein  23.08 
 
 
144 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.156365 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1951  UspA domain-containing protein  22.38 
 
 
144 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0142  universal stress protein  25.32 
 
 
151 aa  47.4  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0115208  normal  0.579477 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  25.97 
 
 
150 aa  47.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2846  hypothetical protein  29.53 
 
 
145 aa  47  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  24.32 
 
 
149 aa  46.6  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  25.13 
 
 
291 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1112  hypothetical protein  26.03 
 
 
144 aa  45.8  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619921  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  29.41 
 
 
140 aa  46.2  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2142  hypothetical protein  25 
 
 
145 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  26.8 
 
 
149 aa  45.8  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  34.51 
 
 
145 aa  45.8  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1453  UspA domain protein  28.1 
 
 
301 aa  45.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.870406  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1776  UspA domain protein  27.7 
 
 
140 aa  45.8  0.0009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.257254  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1578  UspA domain-containing protein  25 
 
 
149 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  23.87 
 
 
148 aa  45.8  0.0009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1407  universal stress protein  27.85 
 
 
161 aa  45.4  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  45.65 
 
 
150 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  22.22 
 
 
155 aa  45.8  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  25.83 
 
 
145 aa  45.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  23.47 
 
 
295 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  24.84 
 
 
301 aa  45.4  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  23.84 
 
 
161 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  26.21 
 
 
180 aa  45.4  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  33.63 
 
 
145 aa  45.8  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  26.53 
 
 
162 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0071  UspA domain protein  28.28 
 
 
156 aa  45.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.041598  normal  0.631556 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  24.67 
 
 
151 aa  45.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1733  universal stress protein  26.97 
 
 
150 aa  44.3  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00331996  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1997  universal stress protein  22.38 
 
 
144 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0827286  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  26.53 
 
 
162 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  26.03 
 
 
147 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>