More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0264 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0264  30S ribosomal protein S10  100 
 
 
104 aa  209  1e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000005821  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0292  30S ribosomal protein S10  71 
 
 
102 aa  151  4e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0377689  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4322  ribosomal protein S10  57.84 
 
 
102 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0687  30S ribosomal protein S10  56.86 
 
 
102 aa  134  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.38034 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1484  30S ribosomal protein S10  58.82 
 
 
102 aa  134  5e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000272811  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4316  30S ribosomal protein S10  57.84 
 
 
102 aa  134  5e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318544 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3924  30S ribosomal protein S10  57.84 
 
 
102 aa  134  5e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2647  30S ribosomal protein S10  56.86 
 
 
102 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186933  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1184  30S ribosomal protein S10  56.86 
 
 
102 aa  134  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0592971 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5123  ribosomal protein S10  56.86 
 
 
102 aa  134  6.0000000000000005e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.971498 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6050  30S ribosomal protein S10  56.86 
 
 
102 aa  133  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0825788  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1525  ribosomal protein S10  60.78 
 
 
102 aa  133  7.000000000000001e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.651999  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0581  30S ribosomal protein S10  56.86 
 
 
102 aa  133  9e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0930  30S ribosomal protein S10  57.84 
 
 
102 aa  133  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243784  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1933  30S ribosomal protein S10  62.38 
 
 
101 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1946  30S ribosomal protein S10  62.38 
 
 
101 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1085  30S ribosomal protein S10  56.86 
 
 
102 aa  132  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1911  30S ribosomal protein S10  62.38 
 
 
101 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.253834 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2018  30S ribosomal protein S10  62.38 
 
 
101 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0110  30S ribosomal protein S10  57.84 
 
 
102 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000437851  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0105  30S ribosomal protein S10  56.86 
 
 
102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.602740000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0103  30S ribosomal protein S10  56.86 
 
 
102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000504345  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0106  30S ribosomal protein S10  56.86 
 
 
102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0103  30S ribosomal protein S10  56.86 
 
 
102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0140  30S ribosomal protein S10  56.86 
 
 
102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000306915  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2712  ribosomal protein S10  56.86 
 
 
102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000160608  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0130  30S ribosomal protein S10  56.86 
 
 
102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000826776  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0121  30S ribosomal protein S10  56.86 
 
 
102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5859e-62 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3906  30S ribosomal protein S10  55.88 
 
 
102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0109  30S ribosomal protein S10  56.86 
 
 
102 aa  131  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000428723  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5196  30S ribosomal protein S10  56.86 
 
 
102 aa  131  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000324324  unclonable  1.19812e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0109  30S ribosomal protein S10  56.86 
 
 
102 aa  131  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000209715  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0104  30S ribosomal protein S10  56.86 
 
 
102 aa  131  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000227261  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0224  ribosomal protein S10  56.86 
 
 
102 aa  131  3.9999999999999996e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0285  ribosomal protein S10  58.82 
 
 
102 aa  131  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0119984  hitchhiker  0.00531479 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0305  30S ribosomal protein S10  56.86 
 
 
102 aa  130  6e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170298 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0561  30S ribosomal protein S10  55.88 
 
 
102 aa  130  7.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1706  30S ribosomal protein S10  56.86 
 
 
102 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00186428  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1746  30S ribosomal protein S10  57.58 
 
 
106 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000231589  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0109  30S ribosomal protein S10  55.88 
 
 
102 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000877818  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0404  30S ribosomal protein S10  57.84 
 
 
102 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000016581  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1225  30S ribosomal protein S10  55.88 
 
 
123 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00268366  unclonable  0.00000899576 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0846  SSU ribosomal protein S10P  55.88 
 
 
103 aa  128  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000264723  decreased coverage  0.00000947215 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0866  30S ribosomal protein S10  55.88 
 
 
102 aa  128  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000610931  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0707  30S ribosomal protein S10  57.84 
 
 
105 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.282417  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2902  30S ribosomal protein S10  55.45 
 
 
103 aa  127  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945352  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2951  30S ribosomal protein S10  56.31 
 
 
103 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00000133875  hitchhiker  0.000000722255 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3298  30S ribosomal protein S10  56.31 
 
 
103 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000231204  hitchhiker  0.000170279 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1868  30S ribosomal protein S10  58.65 
 
 
107 aa  127  4.0000000000000003e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0207865  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1796  SSU ribosomal protein S10P  56.86 
 
 
104 aa  127  4.0000000000000003e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.13057  normal  0.040484 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3865  30S ribosomal protein S10  55.34 
 
 
103 aa  127  4.0000000000000003e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0337  30S ribosomal protein S10  55.34 
 
 
103 aa  127  6e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012954  decreased coverage  0.000295628 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0390  30S ribosomal protein S10  55.34 
 
 
103 aa  127  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000705562  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0272  30S ribosomal protein S10  55.34 
 
 
103 aa  127  6e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.0000000000156586  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1291  30S ribosomal protein S10  59.8 
 
 
102 aa  127  6e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000123252  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0277  30S ribosomal protein S10  55.34 
 
 
103 aa  127  6e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0000127009  decreased coverage  0.000000000926134 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1395  30S ribosomal protein S10  59.8 
 
 
102 aa  127  6e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00721101  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5050  30S ribosomal protein S10  54.46 
 
 
101 aa  127  8.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.38543 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3444  30S ribosomal protein S10  55.34 
 
 
103 aa  126  8.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.000018475  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1304  30S ribosomal protein S10  54.46 
 
 
101 aa  127  8.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.155802  normal  0.101468 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03970  30S ribosomal protein S10  54.46 
 
 
101 aa  127  8.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.914635 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1012  30S ribosomal protein S10  54.46 
 
 
101 aa  127  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0626  ribosomal protein S10  54.9 
 
 
102 aa  127  8.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1039  30S ribosomal protein S10  54.46 
 
 
101 aa  127  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1029  30S ribosomal protein S10  54.46 
 
 
101 aa  127  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.632906 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10714  30S ribosomal protein S10  54.46 
 
 
101 aa  126  9.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.193361 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0193  SSU ribosomal protein S10P  56.12 
 
 
103 aa  126  9.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000113928  normal  0.060255 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3020  30S ribosomal protein S10  56.73 
 
 
104 aa  125  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000044729  hitchhiker  0.00550197 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0952  30S ribosomal protein S10  58.82 
 
 
102 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000292109  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2689  30S ribosomal protein S10  56.86 
 
 
102 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.283235  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2965  30S ribosomal protein S10  55.88 
 
 
102 aa  126  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118126  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0757  30S ribosomal protein S10  54.46 
 
 
103 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515165  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1947  30S ribosomal protein S10  55.88 
 
 
102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2660  ribosomal protein S10  53.92 
 
 
102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20880  SSU ribosomal protein S10P  53.92 
 
 
102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0503549  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0700  30S ribosomal protein S10  57.84 
 
 
102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000505972  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2688  30S ribosomal protein S10  53.92 
 
 
102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.832571 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0290  30S ribosomal protein S10  54.9 
 
 
102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153979  unclonable  7.221610000000001e-29 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2976  30S ribosomal protein S10  53.92 
 
 
102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.430962  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0214  ribosomal protein S10  53.92 
 
 
102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114911  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1263  30S ribosomal protein S10  54.37 
 
 
103 aa  125  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0110329  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0586  ribosomal protein S10  52.94 
 
 
102 aa  124  3e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114557  normal  0.306746 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1832  30S ribosomal protein S10  52.94 
 
 
102 aa  125  3e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000860395  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29750  SSU ribosomal protein S10P  52.94 
 
 
102 aa  124  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.2403 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0318  30S ribosomal protein S10  53.4 
 
 
103 aa  124  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.1858999999999998e-21  hitchhiker  0.0000342143 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3181  30S ribosomal protein S10  54.9 
 
 
102 aa  125  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000486821  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2278  30S ribosomal protein S10  52.94 
 
 
102 aa  125  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000204136  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2319  30S ribosomal protein S10  52.94 
 
 
102 aa  125  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000523033  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3796  30S ribosomal protein S10  56.57 
 
 
104 aa  125  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000453996  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3323  30S ribosomal protein S10  54.9 
 
 
102 aa  125  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.434875  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0195  30S ribosomal protein S10  54.9 
 
 
102 aa  124  3e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00451174  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17170  30S ribosomal protein S10  52.94 
 
 
102 aa  124  4.0000000000000003e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0484484  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0278  30S ribosomal protein S10  55.88 
 
 
102 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078248  unclonable  0.0000000940306 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6615  30S ribosomal protein S10  53.47 
 
 
101 aa  124  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1835  ribosomal protein S10  56.44 
 
 
101 aa  124  4.0000000000000003e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0022795  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3759  ribosomal protein S10  53.47 
 
 
101 aa  124  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3436  ribosomal protein S10  53.47 
 
 
101 aa  124  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3777  30S ribosomal protein S10  53.4 
 
 
103 aa  124  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000424797  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0275  30S ribosomal protein S10  53.4 
 
 
103 aa  124  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000312385  normal  0.114579 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1923  30S ribosomal protein S10  53.4 
 
 
103 aa  124  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000013045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>