273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0081 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0081  protein of unknown function DUF558  100 
 
 
219 aa  441  1e-123  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1497  protein of unknown function DUF558  32.77 
 
 
236 aa  91.7  8e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4065  protein of unknown function DUF558  28.74 
 
 
234 aa  80.9  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl303  hypothetical protein  31.71 
 
 
238 aa  77.4  0.0000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  7.40714e-31  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0337  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  29.27 
 
 
247 aa  74.3  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03291  hypothetical protein  28.19 
 
 
242 aa  73.9  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0585  hypothetical protein  30.62 
 
 
253 aa  73.9  0.000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000651764  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf387  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  28.64 
 
 
220 aa  72  0.000000000007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.312887  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1016  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  27.73 
 
 
258 aa  72  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1998  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  28.4 
 
 
250 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2434  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  28.39 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000454475  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1646  protein of unknown function DUF558  27.15 
 
 
291 aa  70.5  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.600892  hitchhiker  0.00800846 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4594  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  29.91 
 
 
235 aa  70.5  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.246782  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2283  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  28.4 
 
 
250 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0298  RNA methyltransferase, RsmE family  28.7 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1352  protein of unknown function DUF558  28.57 
 
 
239 aa  69.7  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.13252  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3037  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  29.36 
 
 
249 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000274607  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1572  hypothetical protein  26.35 
 
 
227 aa  69.3  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000828981  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1319  hypothetical protein  28.94 
 
 
247 aa  68.6  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.681076  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4321  hypothetical protein  26.58 
 
 
248 aa  67  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.333132  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3241  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  28.19 
 
 
234 aa  67  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.108692 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1513  hypothetical protein  25.35 
 
 
242 aa  67  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.680118  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0838  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  37.25 
 
 
230 aa  66.6  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.083399 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2303  hypothetical protein  29.61 
 
 
246 aa  66.2  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1288  hypothetical protein  31.29 
 
 
242 aa  65.1  0.0000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.690176  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0201  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  26.51 
 
 
247 aa  65.1  0.0000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5042  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  26.85 
 
 
235 aa  64.3  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.319742  normal  0.272315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3469  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  24.74 
 
 
248 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00733732 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1254  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  25.75 
 
 
244 aa  63.5  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.029573  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1732  hypothetical protein  27.1 
 
 
245 aa  63.9  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.127797  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2076  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  32.43 
 
 
245 aa  63.5  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3458  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  24.74 
 
 
248 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.40759  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12770  conserved hypothetical protein TIGR00046  28.42 
 
 
249 aa  63.5  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000425435  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3521  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  24.74 
 
 
248 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.270155 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0519  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  30.37 
 
 
240 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13143  hypothetical protein  27.78 
 
 
235 aa  63.2  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0147396  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2370  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  29.37 
 
 
248 aa  63.2  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00405719  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0625  protein of unknown function DUF558  25.14 
 
 
239 aa  62.8  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.679741  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1587  hypothetical protein  28.21 
 
 
232 aa  62.8  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.721814  normal  0.561066 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05450  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  31.62 
 
 
240 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689901  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1573  protein of unknown function DUF558  25.16 
 
 
259 aa  62.8  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.475919  normal  0.0145737 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1841  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  28.31 
 
 
246 aa  62.4  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.110015  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2013  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  26.95 
 
 
245 aa  62  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.551557 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0610  protein of unknown function DUF558  27.06 
 
 
251 aa  62  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0806  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  37.96 
 
 
249 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000483246  decreased coverage  9.34554e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4210  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  37.04 
 
 
249 aa  61.6  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0876638  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4048  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  37.04 
 
 
249 aa  61.6  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.702448  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4058  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  37.04 
 
 
249 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0577638  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4536  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  37.04 
 
 
249 aa  61.6  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1795  protein of unknown function DUF558  28.57 
 
 
245 aa  61.6  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4333  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  37.04 
 
 
249 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.98604e-48 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1997  protein of unknown function DUF558  26.18 
 
 
232 aa  60.8  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0412  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  31.11 
 
 
241 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4176  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  23.11 
 
 
243 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4392  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  27.47 
 
 
249 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0158003  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5288  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  27.43 
 
 
239 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3079  hypothetical protein  24.05 
 
 
244 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4444  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  27.47 
 
 
249 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000243025  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0837  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  24.03 
 
 
243 aa  59.7  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0839  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  24.03 
 
 
243 aa  59.7  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000711088  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3343  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  24.03 
 
 
243 aa  59.7  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0467  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 
241 aa  60.1  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4162  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  26.61 
 
 
249 aa  60.1  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00520295  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0866  RNA methyltransferase, RsmE family  30.46 
 
 
265 aa  59.7  0.00000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07411  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  26.13 
 
 
259 aa  58.9  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.54697  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4859  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  31.11 
 
 
239 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.771335  normal  0.0487283 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4430  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  27.47 
 
 
249 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2703  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  29.2 
 
 
251 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1575  hypothetical protein  26.97 
 
 
248 aa  59.3  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0110049  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07670  conserved hypothetical protein TIGR00046  24.89 
 
 
260 aa  58.9  0.00000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.437211 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0933  hypothetical protein  25.87 
 
 
240 aa  58.9  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00678152  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3004  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  25 
 
 
244 aa  58.5  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5035  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  30.37 
 
 
239 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3224  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  26.99 
 
 
243 aa  58.5  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000433897  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4985  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  31.11 
 
 
239 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0506786  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0420  protein of unknown function DUF558  28.48 
 
 
244 aa  58.5  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1575  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  26.32 
 
 
245 aa  58.5  0.00000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.214687  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0090  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  27.88 
 
 
250 aa  58.5  0.00000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0765  hypothetical protein  26.49 
 
 
235 aa  58.2  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.417208  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5076  conserved hypothetical protein TIGR00046  31.62 
 
 
239 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2865  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  25.78 
 
 
244 aa  57.8  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1088  protein of unknown function DUF558  30.87 
 
 
233 aa  57.8  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2161  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  30.56 
 
 
244 aa  57.4  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6037  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  24.47 
 
 
250 aa  57.8  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3378  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  24.43 
 
 
243 aa  57.8  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3110  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  29.55 
 
 
247 aa  57.8  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00328118  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1549  hypothetical protein  26.59 
 
 
259 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0600  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  32.64 
 
 
243 aa  57.4  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.604988  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3218  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  26.51 
 
 
257 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000318733  hitchhiker  0.0000151601 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1635  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  29.52 
 
 
250 aa  57  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.404818  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3088  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  23.98 
 
 
243 aa  57  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00138853  hitchhiker  0.0000146734 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1669  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  29.52 
 
 
250 aa  57  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3334  hypothetical protein  28.08 
 
 
242 aa  56.6  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2493  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  32.37 
 
 
247 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0419762  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0162  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  28.66 
 
 
244 aa  57.4  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1925  protein of unknown function DUF558  25.43 
 
 
239 aa  57.4  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0289082  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1332  protein of unknown function DUF558  27.19 
 
 
246 aa  57.4  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000369372  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0749  protein of unknown function DUF558  23.98 
 
 
243 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.115865  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3104  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  23.98 
 
 
243 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02739  hypothetical protein  23.98 
 
 
243 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.379942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>