More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0027 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0027  tRNA synthetase class II (D K and N)  100 
 
 		 300 aa  608  1e-173  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0765  lysyl-tRNA synthetase  34.56 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000080763  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0685  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  29.29 
 
 		 314 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.572683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0273  putative lysyl-tRNA synthetase, class II  27.1 
 
 		 342 aa  120  3e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4013  putative lysyl-tRNA synthetase (lysine--tRNA ligase)  29.7 
 
 		 351 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0299  lysine--tRNA ligase  28.2 
 
 		 340 aa  116  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.631971 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0597  Lysine--tRNA ligase  30.72 
 
 		 356 aa  116  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0744336  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2207  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  29.11 
 
 		 330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2375  lysine--tRNA ligase  31.8 
 
 		 329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1740  lysine--tRNA ligase  30.71 
 
 		 324 aa  109  7.000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1642  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  28.62 
 
 		 347 aa  107  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.576369  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2793  tRNA synthetase class II (D K and N)  27.45 
 
 		 351 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0477928  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3798  Lysine--tRNA ligase  29.19 
 
 		 353 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00227981  normal  0.497071 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4127  Lysine--tRNA ligase  28.52 
 
 		 353 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.271818 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2301  lysine--tRNA ligase  26.69 
 
 		 345 aa  105  7e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.275563  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1978  lysine--tRNA ligase  28.97 
 
 		 316 aa  105  9e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0949  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  25.68 
 
 		 317 aa  103  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000776878  decreased coverage  0.000118121 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2148  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  29.45 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000938384  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3229  tRNA synthetase class II (D K and N)  29.08 
 
 		 352 aa  101  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.504113 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1319  hypothetical protein  27.01 
 
 		 329 aa  100  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0642  hypothetical protein  29.31 
 
 		 317 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3004  tRNA synthetase class II (D K and N)  29.44 
 
 		 352 aa  100  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0405088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3854  tRNA synthetase class II (D K and N)  29.27 
 
 		 390 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.64996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3193  tRNA synthetase class II (D K and N)  26.8 
 
 		 352 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0913  lysyl-tRNA synthetase-related protein GenX  29.37 
 
 		 320 aa  99.8  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1753  lysyl-tRNA synthetase-related protein  28.33 
 
 		 307 aa  99.4  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.032171  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2808  lysine--tRNA ligase  25.88 
 
 		 350 aa  99  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133874  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0658  hypothetical protein  32.26 
 
 		 317 aa  99  9e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2530  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  24.53 
 
 		 324 aa  99  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115251  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1498  tRNA synthetase class II (D K and N)  26.67 
 
 		 340 aa  98.6  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.205908  normal  0.591538 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0787  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  30.56 
 
 		 309 aa  98.2  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3867  tRNA synthetase class II (D K and N)  27.18 
 
 		 339 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0762  lysine--tRNA ligase  28.62 
 
 		 349 aa  96.7  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756358  normal  0.385882 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0472  lysyl-tRNA synthetase  27.59 
 
 		 325 aa  96.3  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2955  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  26.06 
 
 		 351 aa  96.3  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2581  Lysine--tRNA ligase  28.51 
 
 		 318 aa  94.7  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2625  lysyl-tRNA synthetase-related protein  28.06 
 
 		 356 aa  94.4  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0869  lysyl-tRNA synthetase-related protein  28.03 
 
 		 309 aa  93.6  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.584702  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0046  hypothetical protein  27.69 
 
 		 343 aa  92.8  6e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2016  lysyl-tRNA synthetase homolog GenX  28.16 
 
 		 321 aa  92.8  6e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1839  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  27.74 
 
 		 307 aa  92.4  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000593972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0454  Lysine--tRNA ligase  25.67 
 
 		 351 aa  92.4  9e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.444787 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0383  lysyl-tRNA synthetase  27.59 
 
 		 325 aa  91.7  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3783  tRNA synthetase class II (D K and N)  26.45 
 
 		 339 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0076  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  27.12 
 
 		 308 aa  91.7  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211286 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_772  lysyl-tRNA synthetase, truncated  29.76 
 
 		 309 aa  92  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2781  lysyl-tRNA synthetase-related protein GenX  27.06 
 
 		 322 aa  92  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0442  lysyl-tRNA synthetase-related protein GenX  30.83 
 
 		 327 aa  91.3  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1233  tRNA synthetase class II (D K and N)  26.74 
 
 		 299 aa  91.3  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.685644  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6025  lysyl-tRNA synthetase  27.76 
 
 		 357 aa  90.5  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.858577  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0478  putative lysyl-tRNA synthetase  27.31 
 
 		 345 aa  90.5  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.181681  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3757  lysyl-tRNA synthetase  26.55 
 
 		 325 aa  90.1  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00737  tRNA synthetases class II (D, K and N) subfamily  25.65 
 
 		 320 aa  90.1  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.885463  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3935  lysyl-tRNA synthetase  25.52 
 
 		 325 aa  90.1  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2130  lysine--tRNA ligase  27.31 
 
 		 375 aa  90.1  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.679405 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2505  lysine--tRNA ligase  25.16 
 
 		 351 aa  89.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.418111  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4741  lysyl-tRNA synthetase  26.9 
 
 		 325 aa  89.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4614  lysyl-tRNA synthetase  26.55 
 
 		 325 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.594866  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4763  hypothetical protein  28.52 
 
 		 325 aa  89.4  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4705  lysyl-tRNA synthetase  26.55 
 
 		 325 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2403  lysine--tRNA ligase  30.12 
 
 		 380 aa  89.7  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.550576 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4622  lysyl-tRNA synthetase  26.55 
 
 		 325 aa  89.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4762  lysyl-tRNA synthetase  26.55 
 
 		 325 aa  89.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.827317 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3665  lysyl-tRNA synthetase  28.99 
 
 		 325 aa  89  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3812  lysyl-tRNA synthetase  28.99 
 
 		 325 aa  89  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0712  lysyl-tRNA synthetase  28.99 
 
 		 325 aa  89  8e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.292044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3224  lysine--tRNA ligase  28 
 
 		 361 aa  89  8e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.428603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2162  tRNA synthetase class II (D K and N)  26.16 
 
 		 305 aa  89  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2739  lysine--tRNA ligase  26.14 
 
 		 351 aa  89  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.525407 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0378  lysine--tRNA ligase  25.59 
 
 		 350 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.682721 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2490  hypothetical protein  27.56 
 
 		 304 aa  88.6  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0466  Lysine--tRNA ligase  24.74 
 
 		 321 aa  87.8  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.828924 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0420  lysyl-tRNA synthetase  26.8 
 
 		 325 aa  88.2  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000643447 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2054  tRNA synthetase class II (D K and N)  26.16 
 
 		 302 aa  86.7  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03677  lysyl-tRNA synthetase  28.74 
 
 		 322 aa  86.3  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0547578  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0588  lysyl-tRNA synthetase-like GenX  29.12 
 
 		 327 aa  86.3  6e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  decreased coverage  0.00871089  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2787  lysyl-tRNA synthetase  29.21 
 
 		 328 aa  86.3  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.638173  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2229  lysyl-tRNA synthetase  27.4 
 
 		 349 aa  85.9  7e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.188508  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2530  lysine--tRNA ligase  26.15 
 
 		 363 aa  85.9  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.83  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2045  tRNA synthetase class II (D K and N)  24.42 
 
 		 316 aa  85.5  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1764  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  25.51 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.076019  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1276  lysyl-tRNA synthetase  29.15 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3855  lysyl-tRNA synthetase  29.58 
 
 		 325 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00133285 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04027  lysyl-tRNA synthetase  29.58 
 
 		 325 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3835  lysyl-tRNA synthetase-related protein GenX  29.58 
 
 		 325 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03989  hypothetical protein  29.58 
 
 		 325 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4170  tRNA synthetase class II (D K and N)  24.32 
 
 		 416 aa  84  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.555556  normal  0.90101 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4714  lysyl-tRNA synthetase  29.58 
 
 		 325 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.791182  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4626  lysyl-tRNA synthetase  29.58 
 
 		 325 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0839984 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5673  lysyl-tRNA synthetase  29.58 
 
 		 325 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.17046 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4687  lysyl-tRNA synthetase  29.58 
 
 		 325 aa  84  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.981409  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4399  lysyl-tRNA synthetase  29.58 
 
 		 325 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0344  lysyl-tRNA synthetase  28.33 
 
 		 325 aa  84  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000187091 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3726  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  24.51 
 
 		 340 aa  83.2  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3164  tRNA synthetase class II (D K and N)  26.17 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0465087  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1885  tRNA synthetase class II (D K and N)  25.98 
 
 		 350 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.70209  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1078  tRNA synthetase, class II (D, K and N)  25.98 
 
 		 358 aa  82.4  0.000000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1083  serine/threonine protein kinase  28.85 
 
 		 325 aa  82  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.712957  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002238  lysyl-tRNA synthetase  28.08 
 
 		 323 aa  80.5  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2126  lysine--tRNA ligase  24.59 
 
 		 316 aa  80.1  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.840396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>