More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0001 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  100 
 
 		 444 aa  899    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  35.06 
 
 		 443 aa  253  6e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  33.41 
 
 		 450 aa  249  5e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.71 
 
 		 444 aa  247  3e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.64 
 
 		 463 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  33.86 
 
 		 450 aa  243  5e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  33.79 
 
 		 446 aa  242  9e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0001  chromosomal replication initiation protein  35.26 
 
 		 459 aa  241  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000386226  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  34.02 
 
 		 446 aa  241  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.79 
 
 		 449 aa  241  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141272  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  38.76 
 
 		 451 aa  240  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  33.79 
 
 		 446 aa  240  5e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  33.79 
 
 		 446 aa  240  5e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  33.11 
 
 		 446 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 		 446 aa  239  9e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 		 446 aa  239  9e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 		 446 aa  239  9e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 		 446 aa  239  9e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 		 446 aa  239  9e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  37.5 
 
 		 446 aa  238  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.64 
 
 		 459 aa  238  1e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  34.67 
 
 		 450 aa  238  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0001  chromosomal replication initiation protein  33.8 
 
 		 487 aa  238  2e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00605191  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.51 
 
 		 439 aa  238  2e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00780596  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.9 
 
 		 456 aa  237  3e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  37.99 
 
 		 445 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  35.75 
 
 		 449 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0001  chromosomal replication initiation protein  33.63 
 
 		 490 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.06 
 
 		 446 aa  233  6e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000208181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.7 
 
 		 454 aa  233  6e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0001  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 		 492 aa  232  8.000000000000001e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.943807  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  32.2 
 
 		 442 aa  232  8.000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  32.28 
 
 		 441 aa  232  8.000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32 
 
 		 439 aa  229  5e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000109214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  37.84 
 
 		 460 aa  229  6e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  37.79 
 
 		 457 aa  229  6e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  37.84 
 
 		 458 aa  229  7e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000304436  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  37.57 
 
 		 453 aa  228  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  37.57 
 
 		 453 aa  228  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.61 
 
 		 453 aa  228  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  32.67 
 
 		 445 aa  228  2e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  37.5 
 
 		 457 aa  228  2e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0001  chromosomal replication initiation protein  31.89 
 
 		 491 aa  227  3e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.96301  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.65 
 
 		 453 aa  227  4e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2133  chromosomal replication initiation protein  32.8 
 
 		 489 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000845727  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.24 
 
 		 454 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000331762  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.96 
 
 		 443 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0003  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.08 
 
 		 441 aa  225  1e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00105638  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0001  chromosomal replication initiation protein  34.81 
 
 		 450 aa  225  1e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000322878  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0001  chromosomal replication initiation protein  32.18 
 
 		 492 aa  224  2e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.983579  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  35.29 
 
 		 436 aa  224  2e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0001  chromosomal replication initiation protein  31.22 
 
 		 477 aa  224  3e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0001  chromosomal replication initiation protein  34.99 
 
 		 509 aa  223  4e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.31 
 
 		 587 aa  223  6e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000000718914  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.61 
 
 		 447 aa  223  6e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.35 
 
 		 480 aa  222  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0206444  normal  0.0774659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.01 
 
 		 591 aa  220  3e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000633656  unclonable  0.0000000292755 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0001  chromosomal replication initiation protein  34.82 
 
 		 469 aa  220  3e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  33.11 
 
 		 443 aa  221  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0270  chromosomal replication initiation protein  34.29 
 
 		 452 aa  220  3e-56  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.43885  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0001  chromosomal replication initiation protein  31.64 
 
 		 491 aa  220  5e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  35.52 
 
 		 440 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000118947  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0001  chromosomal replication initiation protein  33.7 
 
 		 440 aa  217  4e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.203604  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0809  chromosomal replication initiation protein  33.51 
 
 		 464 aa  216  5e-55  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.54082  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0001  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 		 524 aa  216  5e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0237228  normal  0.131634 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.83 
 
 		 461 aa  216  5.9999999999999996e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000704659  normal  0.0525005 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0001  chromosomal replication initiation protein  32.69 
 
 		 470 aa  214  2.9999999999999995e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000177247  normal  0.980205 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.46 
 
 		 469 aa  214  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280164  normal  0.937405 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0002  chromosomal replication initiation protein  27.85 
 
 		 461 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.020385  hitchhiker  0.000000603983 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.51 
 
 		 459 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0161542  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05681  chromosomal replication initiation protein  31.53 
 
 		 454 aa  213  5.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.263255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.98 
 
 		 448 aa  213  5.999999999999999e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.43 
 
 		 503 aa  213  7.999999999999999e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0001  chromosomal replication initiation protein  32.37 
 
 		 464 aa  213  7.999999999999999e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000013935  decreased coverage  1.67388e-26 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.5 
 
 		 506 aa  212  9e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  35.24 
 
 		 452 aa  212  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0001  chromosomal replication initiation protein  33.92 
 
 		 480 aa  211  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000170377  unclonable  0.000000000650471 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0827  chromosomal replication initiation protein  31.44 
 
 		 492 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0001  chromosomal replication initiation protein  33.63 
 
 		 481 aa  211  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000056365  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1227  chromosomal replication initiation protein  29.98 
 
 		 449 aa  211  3e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.174697  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4117  chromosomal replication initiation protein  36.47 
 
 		 465 aa  210  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000931933  normal  0.0270955 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0001  chromosomal replication initiation protein  35.71 
 
 		 453 aa  210  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.755155  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0001  chromosomal replication initiation protein  33.05 
 
 		 440 aa  209  5e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.879571  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0027  chromosomal replication initiation protein  33.05 
 
 		 440 aa  210  5e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.984359  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0003  chromosomal replication initiation protein  35.71 
 
 		 453 aa  209  6e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0001  chromosomal replication initiation protein  34.05 
 
 		 465 aa  209  8e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00429077  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.26 
 
 		 468 aa  209  8e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00010  chromosomal replication initiation protein  34.69 
 
 		 597 aa  209  8e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000000278732  normal  0.616682 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1100  chromosomal replication initiation protein  30.57 
 
 		 482 aa  209  9e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.018395 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0001  chromosomal replication initiation protein  37.32 
 
 		 436 aa  209  9e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.76217  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.81 
 
 		 516 aa  209  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000003522  unclonable  0.00000000000722922 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1342  chromosomal replication initiation protein  32.32 
 
 		 455 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0001  chromosomal replication initiation protein  32.76 
 
 		 440 aa  208  1e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.31 
 
 		 509 aa  208  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0011  chromosomal replication initiation protein  32.32 
 
 		 455 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0001  chromosomal replication initiation protein  30.79 
 
 		 460 aa  208  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000179736  unclonable  0.0000000000313535 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0001  chromosomal replication initiation protein  31.11 
 
 		 477 aa  208  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.839498  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.88 
 
 		 527 aa  207  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0861644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0001  chromosomal replication initiation protein  33.53 
 
 		 460 aa  207  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.831436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.76 
 
 		 447 aa  207  3e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>