More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1895 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1895  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents ATPase component-like protein  100 
 
 		 219 aa  443  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000374045  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1855  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents ATPase component-like protein  27.94 
 
 		 223 aa  102  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000195986  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0472  ABC transporter related  27.07 
 
 		 293 aa  98.6  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0139008  hitchhiker  0.0000833455 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0855  ABC transporter related protein  29.14 
 
 		 273 aa  97.8  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.795905 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0448  ABC-type transport system, ATPase component  27.35 
 
 		 266 aa  89.7  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392883  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0700  ABC transporter related  26.49 
 
 		 333 aa  89.4  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03690  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, ATPase component  26.95 
 
 		 378 aa  87.8  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.839011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0685  ABC transporter related  28.28 
 
 		 293 aa  87.8  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0386  ABC transporter related protein  28.18 
 
 		 277 aa  87  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1173  ABC transporter, ATP-binding protein  27.49 
 
 		 264 aa  85.9  4e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  32.92 
 
 		 268 aa  85.9  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  26.94 
 
 		 248 aa  85.9  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0752  ABC transporter related protein  26.71 
 
 		 397 aa  85.5  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  26.7 
 
 		 247 aa  85.5  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2303  ABC transporter related protein  27.5 
 
 		 246 aa  85.5  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000265903  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4315  ABC transporter related  25.48 
 
 		 259 aa  85.5  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.696843  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2935  ABC transporter related  28.57 
 
 		 271 aa  85.5  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1775  ABC transporter related  25.79 
 
 		 298 aa  85.5  6e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0401  ABC transporter related  27.81 
 
 		 262 aa  85.1  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186175  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1040  ABC transporter related  26.04 
 
 		 248 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2413  ABC transporter related  25.69 
 
 		 266 aa  84.7  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1254  ABC transporter-related protein  24.84 
 
 		 357 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0999833 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  24.88 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1074  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents ATPase component-like protein  23.6 
 
 		 333 aa  82.8  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1811  ABC transporter related protein  26.95 
 
 		 251 aa  82  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3402  ABC transporter related  27.22 
 
 		 270 aa  82  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5099  ABC transporter related  24.22 
 
 		 362 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0528619 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10668  ribonucleotide transport ATP-binding protein ABC transporter mkl  24.84 
 
 		 359 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.139977  normal  0.579373 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  26.62 
 
 		 255 aa  82  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6635  ABC transporter related  25.47 
 
 		 363 aa  81.6  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1127  ABC transporter related protein  23.6 
 
 		 421 aa  81.6  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4536  ABC transporter, ATP-binding protein  24.15 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2709  ABC transporter related  24.75 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1817  ABC transporter related  25.51 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4349  ABC transporter related protein  22.98 
 
 		 359 aa  80.1  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0997  ABC transporter related  25.82 
 
 		 269 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3484  ABC transporter related  25.64 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1610  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  27.69 
 
 		 368 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0968  ABC transporter related  24.03 
 
 		 361 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51873  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2017  ABC transporter related  27.55 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.661997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0986  ABC transporter related  24.03 
 
 		 361 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.401008 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  25 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0996  ABC transporter related  24.22 
 
 		 361 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  24.68 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0958  toluene tolerance ABC efflux transporter, ATP-binding protein  25.27 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  25.45 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2886  ABC transporter, ATPase subunit  27.04 
 
 		 275 aa  79  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.21978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  27.14 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  25.25 
 
 		 250 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0205  ABC transporter related  26.6 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4174  cell division ATP-binding protein FtsE  32.03 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00105133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1321  ABC transporter related protein  26.44 
 
 		 259 aa  78.6  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2786  ABC transporter, ATPase subunit  24.4 
 
 		 294 aa  78.6  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000312244  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03211  ABC transporter ATP-binding protein  28.14 
 
 		 264 aa  78.2  0.00000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2298  ATPase  25.97 
 
 		 273 aa  78.2  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102276  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0965  ABC transporter related  29.22 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0236  ABC transporter-like  27.38 
 
 		 374 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2343  ABC transporter related protein  26.09 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0039  ABC transporter related  30.25 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0624  cell division ATP-binding protein FtsE  29.41 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2887  ABC transporter ATP-binding protein  24.88 
 
 		 269 aa  77.8  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.220334  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1969  ABC transporter, ATP-binding protein  26.35 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.309748  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0853  ABC transporter related  25.27 
 
 		 273 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0785068 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0872  hypothetical protein  27.22 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0096  ABC transporter related  30.82 
 
 		 282 aa  77.4  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.568034  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0022  ATPase  26.11 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3101  putative ABC transporter ATP-binding subunit  27.62 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3704  ABC transporter related  30.11 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307132  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0903  hypothetical protein  27.22 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1656  ABC transporter related  27.75 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00836866  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  24.24 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4177  ABC transporter related  25.98 
 
 		 561 aa  76.6  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5390  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  28.22 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.695996  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  28.39 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5114  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  25.29 
 
 		 335 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.182422  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  24.24 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0876  ABC transporter related  24.44 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.930987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3394  ABC transporter-related protein  26.42 
 
 		 278 aa  76.6  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1748  ABC transporter related  27.78 
 
 		 264 aa  76.6  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.751418  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7234  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  27.98 
 
 		 384 aa  75.9  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.235387  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2985  ABC-type organic solvent transporter, ATP-binding protein  25.16 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.444132  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1601  ABC transporter, ATP-binding protein  24.24 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190075  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  27.13 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0979  ABC transporter related  26.32 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0748  ABC transporter related  27.27 
 
 		 286 aa  75.5  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3259  ABC transporter-related protein  28.57 
 
 		 283 aa  75.5  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3498  ABC transporter related  24.43 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.552315 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1533  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  27.46 
 
 		 345 aa  75.9  0.0000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0757943  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3212  cyclic nucleotide-binding protein  23.23 
 
 		 388 aa  75.5  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  27.27 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0716  ABC transporter related  27.27 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1712  ABC transporter-related protein  26.9 
 
 		 252 aa  75.5  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000576973 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2542  ABC transporter-related protein  25.26 
 
 		 262 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120611  hitchhiker  0.000000000000186562 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0793  ABC transporter related  26.62 
 
 		 282 aa  75.5  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.215167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2973  ABC transporter related  27.45 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1154  ABC transporter related  26.37 
 
 		 286 aa  75.1  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0114  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  25.29 
 
 		 335 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.867435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1229  ABC transporter related  30.82 
 
 		 264 aa  75.1  0.0000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.380088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12850  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, ATP binding component  24.73 
 
 		 269 aa  75.1  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0561  ABC transporter related  22.34 
 
 		 248 aa  75.1  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000384868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>