16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0057 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0057  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  288  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1231  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  288  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1849  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  288  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2068  hypothetical protein  50.39 
 
 
138 aa  119  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.370761  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5039  hypothetical protein  52.07 
 
 
135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3169  hypothetical protein  48.82 
 
 
169 aa  110  8.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2990  hypothetical protein  47.54 
 
 
140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146534  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0786  hypothetical protein  39.82 
 
 
127 aa  65.1  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.795214  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1991  transposase IS3/IS911 family protein  45.83 
 
 
137 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0108852 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2003  hypothetical protein  34.38 
 
 
183 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.415801 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13467  hypothetical protein  50 
 
 
54 aa  47  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000672353  hitchhiker  0.000200716 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1992  transposase IS3/IS911  31.91 
 
 
133 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.135346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2557  transposase IS3/IS911  31.91 
 
 
133 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.221495 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2606  transposase IS3/IS911 family protein  29.79 
 
 
133 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0565  transposase IS3/IS911 family protein  33.8 
 
 
178 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151149  normal  0.231454 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2351  transposase IS3/IS911 family protein  33.8 
 
 
178 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.201839 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>