28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_R0039 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_R0039  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0040  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0036  tRNA-Val  93.62 
 
 		 72 bp  69.9  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.552883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0025  tRNA-Val  93.62 
 
 		 72 bp  69.9  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0239971 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0038  tRNA-Val  90 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.290735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0040  tRNA-Val  90 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000348872 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0005  tRNA-Val  92.31 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.642292 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14023  tRNA-Val  94.12 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0056  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0058  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.340534  normal  0.330008 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0037  tRNA-Val  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00626142  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0013  tRNA-Phe  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0018  tRNA-Val  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00275689  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0015  tRNA-Val  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0041  tRNA-Val  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0072  tRNA-Val  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0021  tRNA-Phe  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0045  tRNA-Phe  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0114  tRNA-Val  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000145742  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0064  tRNA-Val  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0147303  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0035  tRNA-Val  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_R0056  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000288017  normal  0.0354601 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0017  tRNA-Phe  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.847509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0044  tRNA-Phe  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0050  tRNA-Phe  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0031  tRNA-Val  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0045  tRNA-Phe  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0048  tRNA-Phe  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>