More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4441 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5524  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  77.2 
 
 
447 aa  684    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148438  normal  0.115697 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34200  glutamate dehydrogenase (NADP)  75.57 
 
 
446 aa  677    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.255605 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3219  glutamate dehydrogenase  69.49 
 
 
449 aa  665    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1305  glutamate dehydrogenase  71.91 
 
 
450 aa  670    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0418  glutamate dehydrogenase  70.25 
 
 
449 aa  656    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549997  normal  0.391683 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2296  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  73.59 
 
 
445 aa  667    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2911  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  71.95 
 
 
445 aa  643    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.755434 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3577  glutamate dehydrogenase  74.27 
 
 
445 aa  655    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2125  glutamate dehydrogenase  75.45 
 
 
447 aa  681    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0411981  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2359  glutamate dehydrogenase  72.6 
 
 
444 aa  660    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.394461  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1371  glutamate dehydrogenase  70.58 
 
 
452 aa  668    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.209216  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32600  glutamate dehydrogenase  72.17 
 
 
447 aa  660    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.163596  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14650  glutamate dehydrogenase  72.17 
 
 
451 aa  638    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.972486  normal  0.287682 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3000  glutamate dehydrogenase  70.59 
 
 
448 aa  654    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.741284  normal  0.619757 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0864  glutamate dehydrogenase  69.66 
 
 
448 aa  650    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.342064  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1186  glutamate dehydrogenase  69.44 
 
 
450 aa  652    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1929  glutamate dehydrogenase  72.01 
 
 
449 aa  659    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0573  glutamate dehydrogenase  70.88 
 
 
448 aa  660    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4646  glutamate dehydrogenase  71.78 
 
 
448 aa  671    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3019  glutamate dehydrogenase  69.93 
 
 
449 aa  667    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30790  glutamate dehydrogenase  74.21 
 
 
447 aa  664    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4441  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  100 
 
 
449 aa  919    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.542579  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2800  glutamate dehydrogenase  71.78 
 
 
449 aa  669    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00630068  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0996  glutamate dehydrogenase  69.04 
 
 
451 aa  639    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.150602  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4667  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  71.88 
 
 
449 aa  652    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0193  glutamate dehydrogenase  71.05 
 
 
449 aa  674    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0396  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  74.32 
 
 
447 aa  667    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4267  glutamate dehydrogenase  71.78 
 
 
448 aa  671    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.292709  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2123  glutamate dehydrogenase  69.49 
 
 
449 aa  660    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.286272 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5321  glutamate dehydrogenase  71.75 
 
 
449 aa  652    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0761219 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3505  glutamate dehydrogenase  72.91 
 
 
445 aa  653    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3118  glutamate dehydrogenase  69.71 
 
 
449 aa  666    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.690861  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0175  glutamate dehydrogenase  71.05 
 
 
449 aa  674    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000304056 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3497  glutamate dehydrogenase  67.71 
 
 
451 aa  639    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3872  glutamate dehydrogenase  71.43 
 
 
453 aa  654    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.582275 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1658  glutamate dehydrogenase  70.32 
 
 
458 aa  640    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4353  glutamate dehydrogenase  71.78 
 
 
448 aa  671    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal  0.0129009 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4804  glutamate dehydrogenase  73.87 
 
 
449 aa  659    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323984  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0302  glutamate dehydrogenase  69.04 
 
 
449 aa  648    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0060  glutamate dehydrogenase  68.15 
 
 
449 aa  646    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.742683  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0346  glutamate dehydrogenase  72.3 
 
 
445 aa  645    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2044  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  72.4 
 
 
456 aa  627  1e-178  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.859407  normal  0.109712 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2782  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  64.79 
 
 
446 aa  623  1e-177  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000238369  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04440  glutamate dehydrogenase  69.23 
 
 
446 aa  595  1e-169  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1813  glutamate dehydrogenase  60.63 
 
 
454 aa  573  1.0000000000000001e-162  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.181539  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0374  glutamate dehydrogenase  63.57 
 
 
444 aa  573  1.0000000000000001e-162  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000129016  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1556  glutamate dehydrogenase  61.26 
 
 
445 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.240563  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4852  glutamate dehydrogenase  63.57 
 
 
444 aa  569  1e-161  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2430  glutamate dehydrogenase  62.36 
 
 
445 aa  565  1e-160  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07080  glutamate dehydrogenase  60.54 
 
 
443 aa  565  1e-160  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.813 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1770  glutamate dehydrogenase  59.19 
 
 
448 aa  562  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1499  glutamate dehydrogenase  58.97 
 
 
448 aa  562  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.981406  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0818  glutamate dehydrogenase  61 
 
 
447 aa  562  1.0000000000000001e-159  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.274961 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0467  glutamate dehydrogenase  60.81 
 
 
450 aa  555  1e-157  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000753679  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0942  glutamate dehydrogenase  58.47 
 
 
466 aa  553  1e-156  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.156047 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1510  glutamate dehydrogenase  58.48 
 
 
450 aa  550  1e-155  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.299473  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1335  glutamate dehydrogenase  61.4 
 
 
449 aa  546  1e-154  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.26176  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1801  glutamate dehydrogenase  58.28 
 
 
443 aa  545  1e-154  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.250235  normal  0.676275 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0271  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  60.05 
 
 
445 aa  539  9.999999999999999e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1427  glutamate dehydrogenase  58.69 
 
 
448 aa  536  1e-151  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0286  glutamate dehydrogenase  59.45 
 
 
450 aa  536  1e-151  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000707094  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1895  glutamate dehydrogenase  59.05 
 
 
450 aa  537  1e-151  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1152  glutamate dehydrogenase  58.61 
 
 
449 aa  534  1e-150  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000352  NADP-specific glutamate dehydrogenase  59.08 
 
 
450 aa  531  1e-149  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10490  glutamate dehydrogenase  58.52 
 
 
451 aa  530  1e-149  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000302045 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0610  glutamate dehydrogenase  59.3 
 
 
443 aa  530  1e-149  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0929396 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2214  glutamate dehydrogenase  57.67 
 
 
438 aa  526  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.171409  normal  0.223248 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1647  glutamate dehydrogenase  56.44 
 
 
451 aa  527  1e-148  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02515  glutamate dehydrogenase  56.53 
 
 
447 aa  522  1e-147  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0527  glutamate dehydrogenase  55.56 
 
 
450 aa  521  1e-147  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000275062  normal  0.153307 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0826  glutamate dehydrogenase  56.66 
 
 
444 aa  520  1e-146  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0743965  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5228  glutamate dehydrogenase  56.76 
 
 
445 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2051  glutamate dehydrogenase  56.28 
 
 
451 aa  511  1e-143  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.553496 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0675  glutamate dehydrogenase  56.09 
 
 
449 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4874  glutamate dehydrogenase  56.08 
 
 
445 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.443754  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4509  glutamate dehydrogenase  55.18 
 
 
446 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2189  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  55.3 
 
 
451 aa  505  9.999999999999999e-143  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3443  glutamate dehydrogenase  55.48 
 
 
450 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60710  glutamate dehydrogenase  56.31 
 
 
445 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1815  glutamate dehydrogenase  54.98 
 
 
452 aa  508  9.999999999999999e-143  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0707  glutamate dehydrogenase  56.09 
 
 
446 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.469869  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0706  glutamate dehydrogenase  56.09 
 
 
446 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0916886 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1286  glutamate dehydrogenase  57.67 
 
 
447 aa  503  1e-141  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000501948  hitchhiker  0.000436028 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1459  glutamate dehydrogenase  56.04 
 
 
447 aa  499  1e-140  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1771  glutamate dehydrogenase  56.65 
 
 
445 aa  500  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.89155  normal  0.439156 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0886  glutamate dehydrogenase  53.67 
 
 
452 aa  501  1e-140  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0452  glutamate dehydrogenase  58.35 
 
 
447 aa  500  1e-140  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1290  glutamate dehydrogenase  53.94 
 
 
455 aa  496  1e-139  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0977  glutamate dehydrogenase  55.81 
 
 
447 aa  495  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0965022  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0892  glutamate dehydrogenase  55.35 
 
 
447 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5140  glutamate dehydrogenase  55.58 
 
 
447 aa  494  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.299774  normal  0.273528 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1984  glutamate dehydrogenase  55.41 
 
 
447 aa  489  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000158842  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2481  glutamate dehydrogenase  55.41 
 
 
447 aa  489  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.231621  normal  0.944687 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4200  glutamate dehydrogenase  56.04 
 
 
447 aa  489  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1339  glutamate dehydrogenase  56.62 
 
 
449 aa  491  1e-137  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.852226  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1429  glutamate dehydrogenase  55.18 
 
 
447 aa  488  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00746713  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1410  glutamate dehydrogenase  55.93 
 
 
447 aa  488  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.666126  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2014  glutamate dehydrogenase  55.41 
 
 
447 aa  489  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1876  glutamate dehydrogenase  55.7 
 
 
447 aa  488  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0272489  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1871  glutamate dehydrogenase  54.95 
 
 
447 aa  488  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.598381  hitchhiker  0.000134113 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>