More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3892 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3892  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
511 aa  951    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.741716  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4981  major facilitator superfamily MFS_1  50.87 
 
 
518 aa  343  5.999999999999999e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.547375  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.39 
 
 
763 aa  309  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  44.17 
 
 
497 aa  294  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.31 
 
 
498 aa  284  2.0000000000000002e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.98 
 
 
527 aa  283  4.0000000000000003e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  43.28 
 
 
492 aa  270  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.1 
 
 
487 aa  270  5.9999999999999995e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.81 
 
 
487 aa  261  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.96 
 
 
508 aa  250  5e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.92 
 
 
522 aa  247  4.9999999999999997e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5562  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.71 
 
 
493 aa  239  5.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.39 
 
 
487 aa  237  3e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1042  putative membrane transport protein  38.64 
 
 
498 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.010302  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5556  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.29 
 
 
489 aa  234  3e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798171  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.66 
 
 
478 aa  233  5e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7424  major facilitator superfamily MFS_1  37.96 
 
 
494 aa  230  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.75 
 
 
474 aa  229  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7524  major facilitator superfamily MFS_1  38.53 
 
 
503 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47136  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.36 
 
 
509 aa  226  7e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4824  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.59 
 
 
519 aa  226  7e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4552  putative transmembrane efflux protein  42.82 
 
 
454 aa  226  8e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.739035  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3359  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.8 
 
 
1112 aa  223  8e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0181255 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.28 
 
 
501 aa  220  6e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0782  putative transmembrane efflux protein  36.67 
 
 
470 aa  218  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000700007 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0103  major facilitator transporter  39.47 
 
 
470 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.360848  hitchhiker  0.000281581 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.42 
 
 
490 aa  217  5e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.48 
 
 
534 aa  216  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7966  major facilitator superfamily MFS_1  37.12 
 
 
487 aa  215  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1038  major facilitator superfamily MFS_1  37.83 
 
 
506 aa  215  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.05 
 
 
519 aa  216  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4632  putative transmembrane efflux protein  35.57 
 
 
475 aa  215  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0412  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.54 
 
 
499 aa  215  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758903  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.17 
 
 
553 aa  213  4.9999999999999996e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.95 
 
 
479 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.384361 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5575  major facilitator superfamily MFS_1  46.81 
 
 
481 aa  212  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.530519 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1704  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.41 
 
 
757 aa  212  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  36.9 
 
 
522 aa  211  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  37.1 
 
 
490 aa  211  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3496  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.69 
 
 
482 aa  209  9e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.152282  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4568  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.69 
 
 
482 aa  209  9e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.411532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8779  putative transport protein  41.63 
 
 
481 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.18 
 
 
507 aa  209  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0213589 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.84 
 
 
502 aa  209  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.69 
 
 
480 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.189888  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0891  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.69 
 
 
480 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.69 
 
 
480 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1885  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.69 
 
 
480 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7839  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.52 
 
 
505 aa  207  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4680  major facilitator superfamily MFS_1  36.91 
 
 
467 aa  207  4e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0947  major facilitator transporter  36.97 
 
 
483 aa  207  4e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289424  normal  0.783186 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.42 
 
 
528 aa  207  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4898  putative transport protein  38.94 
 
 
489 aa  206  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00331224  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3141  drug resistance MFS transporter  42.45 
 
 
480 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3178  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.45 
 
 
480 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1424  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.04 
 
 
548 aa  206  7e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.589759  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0312  major facilitator superfamily MFS_1  38.69 
 
 
485 aa  205  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.116628 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1130  major facilitator superfamily MFS_1  37.08 
 
 
491 aa  206  1e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3195  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.21 
 
 
480 aa  205  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2475  major facilitator transporter  39.62 
 
 
468 aa  204  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4079  major facilitator transporter  39.71 
 
 
470 aa  204  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0276069  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.08 
 
 
788 aa  204  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.63 
 
 
532 aa  203  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3373  major facilitator superfamily MFS_1  40.54 
 
 
482 aa  203  5e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3935  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.24 
 
 
479 aa  203  6e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000976381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.8 
 
 
478 aa  202  9e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.41 
 
 
486 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37915  major facilitator transporter  39.75 
 
 
471 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000756673  normal  0.0508172 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4492  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.67 
 
 
487 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.41 
 
 
486 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.35 
 
 
520 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.41 
 
 
486 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2666  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.17 
 
 
487 aa  202  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.608352  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0817  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.43 
 
 
479 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278156  normal  0.800505 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0362  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.43 
 
 
479 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0845  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.43 
 
 
479 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.880414  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4810  major facilitator transporter  35.5 
 
 
555 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.41 
 
 
486 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.41 
 
 
486 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.41 
 
 
486 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.23 
 
 
489 aa  202  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2510  major facilitator superfamily MFS_1  40.15 
 
 
480 aa  201  3e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.563077 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4328  major facilitator transporter  38.41 
 
 
482 aa  201  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40 
 
 
496 aa  200  3.9999999999999996e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  35.89 
 
 
519 aa  200  5e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2443  major facilitator transporter  35.14 
 
 
481 aa  200  6e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.15 
 
 
489 aa  199  7.999999999999999e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.7 
 
 
469 aa  199  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.84 
 
 
510 aa  197  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7473  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.45 
 
 
514 aa  197  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.62 
 
 
488 aa  197  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5374  major facilitator transporter  40.72 
 
 
481 aa  196  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.558764 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.02 
 
 
522 aa  196  9e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.99 
 
 
458 aa  196  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1705  major facilitator superfamily MFS_1  34.72 
 
 
733 aa  195  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.77 
 
 
478 aa  195  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.61 
 
 
508 aa  194  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1255  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  39.42 
 
 
476 aa  194  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.269768 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0776  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.11 
 
 
488 aa  194  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000908237 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1149  major facilitator transporter  39.91 
 
 
460 aa  194  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>