44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3128 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3128  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  221  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.168775  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1853  hypothetical protein  62.75 
 
 		 105 aa  130  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1860  hypothetical protein  62.75 
 
 		 105 aa  130  6e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.39326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3196  putative integration host factor MihF  73.79 
 
 		 105 aa  125  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.242589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1061  hypothetical protein  70.48 
 
 		 105 aa  124  5e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2435  hypothetical protein  63 
 
 		 108 aa  123  7e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2812  hypothetical protein  66.35 
 
 		 107 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3098  hypothetical protein  61.17 
 
 		 101 aa  118  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3008  hypothetical protein  69.23 
 
 		 108 aa  117  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000974881  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5346  hypothetical protein  66.02 
 
 		 104 aa  115  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1712  integration host factor-like protein  69.9 
 
 		 106 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696223 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1359  hypothetical protein  68.27 
 
 		 107 aa  113  8.999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19805  normal  0.0604733 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5239  hypothetical protein  70.48 
 
 		 105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1319  hypothetical protein  53.4 
 
 		 109 aa  109  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.129436  normal  0.2348 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0809  hypothetical protein  60.2 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0768002  normal  0.858288 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15610  hypothetical protein  67.62 
 
 		 105 aa  103  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.167288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1661  hypothetical protein  53.4 
 
 		 102 aa  99.4  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000000371749  hitchhiker  0.0000841753 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3156  hypothetical protein  60.95 
 
 		 107 aa  98.2  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  hitchhiker  0.0000150374 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4163  hypothetical protein  65.05 
 
 		 104 aa  95.9  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.1563  normal  0.37873 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1849  hypothetical protein  61.17 
 
 		 103 aa  95.9  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.317329  normal  0.137078 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18020  hypothetical protein  58.25 
 
 		 106 aa  95.1  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00327498  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2579  putative integration host factor  65.69 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130539  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2993  hypothetical protein  61.17 
 
 		 118 aa  93.6  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.65036 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2416  MihF  64.71 
 
 		 105 aa  93.6  9e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.623884  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2369  MIHF  64.71 
 
 		 105 aa  93.6  9e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0348363  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2666  MihF  64.71 
 
 		 105 aa  93.6  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2410  MihF  64.71 
 
 		 105 aa  93.6  9e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1696  hypothetical protein  53.77 
 
 		 106 aa  92.8  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.877224  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3741  MihF  64.71 
 
 		 105 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0746797 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1294  putative integration host factor MihF  62.5 
 
 		 113 aa  92.8  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.203046  normal  0.0715568 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2344  hypothetical protein  63.73 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11417  integration host factor mihF  64.36 
 
 		 190 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000282847  normal  0.291955 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14790  hypothetical protein  50.94 
 
 		 108 aa  87.4  5e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.469927  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1714  hypothetical protein  54.43 
 
 		 80 aa  86.7  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0927785  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2041  hypothetical protein  55.34 
 
 		 103 aa  83.6  8e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.537681  hitchhiker  0.00591086 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11900  hypothetical protein  53.06 
 
 		 102 aa  79.7  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000932793  normal  0.0171922 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07810  hypothetical protein  50.49 
 
 		 102 aa  78.6  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.175394  normal  0.797766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1864  integration host factor  46.46 
 
 		 104 aa  79  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3448  hypothetical protein  42.31 
 
 		 102 aa  76.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.030186  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12710  hypothetical protein  45.74 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0463914  normal  0.0241518 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2260  putative integration host factor IHF  50 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.46856  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33240  hypothetical protein  46.94 
 
 		 103 aa  65.5  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.595786 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1997  putative integration host factor IHF  65.96 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000128008 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0876  hypothetical protein  41.41 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>