125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2338 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2338  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 69 aa  144  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00013829  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5582  integrase catalytic subunit  65.15 
 
 		 304 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0423164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5587  integrase catalytic subunit  65.15 
 
 		 304 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.123613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5653  integrase catalytic subunit  65.15 
 
 		 304 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.225588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6426  integrase catalytic region  48.94 
 
 		 301 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6463  integrase catalytic region  48.94 
 
 		 301 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.666389 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3846  integrase catalytic subunit  45.45 
 
 		 301 aa  47.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3162  integrase catalytic subunit  43.18 
 
 		 301 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.116464  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0597  integrase, catalytic region  42.31 
 
 		 126 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.603645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1216  Integrase catalytic region  47.73 
 
 		 311 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4441  integrase catalytic region  45.45 
 
 		 284 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5064  integrase catalytic region  45.45 
 
 		 284 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5344  integrase catalytic region  45.45 
 
 		 284 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438366  normal  0.0855179 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5555  integrase catalytic region  45.45 
 
 		 284 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.884215 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1664  IS1203 transposase orfB  42.22 
 
 		 296 aa  45.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0930  integrase catalytic subunit  42.31 
 
 		 279 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2594  integrase catalytic subunit  42.31 
 
 		 279 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0806255  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2029  hypothetical protein  46.51 
 
 		 112 aa  45.1  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0947  integrase catalytic subunit  42.31 
 
 		 279 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1484  integrase catalytic subunit  42.31 
 
 		 279 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0324114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2638  integrase catalytic subunit  42.31 
 
 		 279 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220037  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9898  transposase  39.58 
 
 		 301 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9838  transposase  39.58 
 
 		 301 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0016  IS629, transposase orfB, truncation  42.22 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3705  integrase catalytic region  38.64 
 
 		 301 aa  45.1  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3736  integrase catalytic region  38.64 
 
 		 301 aa  45.1  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2258  IS629 transposase orfB  51.43 
 
 		 296 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4791  IS1203 transposase orfB  51.43 
 
 		 296 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.2388 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1390  transposase  42.22 
 
 		 82 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.185969 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0760  integrase catalytic subunit  45 
 
 		 244 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1592  integrase catalytic subunit  46.51 
 
 		 250 aa  44.3  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3565  integrase catalytic subunit  46.51 
 
 		 250 aa  44.3  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0035  IS629, transposase orfB  44.19 
 
 		 295 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0102  IS629, transposase orfB  44.19 
 
 		 295 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1303  IS629, transposase orfB  44.19 
 
 		 295 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1379  IS629, transposase orfB  44.19 
 
 		 295 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.822294  normal  0.0945096 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2492  IS629, transposase orfB  42.22 
 
 		 295 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2680  IS629, transposase orfB  44.19 
 
 		 295 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00648038  normal  0.0200158 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0737  Integrase catalytic region  37.1 
 
 		 322 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2753  integrase catalytic subunit  46.51 
 
 		 253 aa  44.3  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0367  Integrase catalytic region  37.1 
 
 		 322 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0819  Integrase catalytic region  37.1 
 
 		 322 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1177  Integrase catalytic region  37.1 
 
 		 322 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2658  Integrase catalytic region  37.1 
 
 		 322 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2588  Integrase catalytic region  37.1 
 
 		 322 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1739  Integrase catalytic region  37.1 
 
 		 322 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0682469  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1173  Integrase catalytic region  37.1 
 
 		 322 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4660  Integrase catalytic region  37.1 
 
 		 322 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2801  Integrase catalytic region  37.1 
 
 		 322 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0160717  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0364  Integrase catalytic region  37.1 
 
 		 322 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4212  integrase catalytic subunit  42.5 
 
 		 301 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.955324  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0102  IS629 transposase orfB  42.22 
 
 		 295 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0471323  hitchhiker  0.000157883 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1240  IS1203 transposase orfB  42.22 
 
 		 296 aa  43.9  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.605  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0221  IS629 transposase orfB  42.22 
 
 		 296 aa  43.9  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0297  IS629 transposase orfB  42.22 
 
 		 296 aa  43.9  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000478745  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0740  Integrase catalytic region  40 
 
 		 285 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0332591  normal  0.114218 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6067  transposase catalytic site ISRme15  40 
 
 		 285 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5541  transposase catalytic site ISRme15  40 
 
 		 285 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0988  IS629 transposase orfB  42.22 
 
 		 296 aa  43.9  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1592  IS629 transposase orfB  42.22 
 
 		 296 aa  43.9  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1924  IS629 transposase orfB  42.22 
 
 		 296 aa  43.9  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.454462  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4642  IS629 transposase orfB  42.22 
 
 		 296 aa  43.9  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.835933  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4763  IS1203 transposase orfB  42.22 
 
 		 296 aa  43.9  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0134  IS629 transposase orfB  42.22 
 
 		 296 aa  43.9  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0247  IS629 transposase orfB  42.22 
 
 		 296 aa  43.9  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.45525  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0008  Integrase catalytic region  40 
 
 		 285 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.230626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1826  Integrase catalytic region  40 
 
 		 285 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.0211966 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0735  ISMca3, transposase, OrfB  41.67 
 
 		 282 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.990065  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1896  ISMca3, transposase, OrfB  41.67 
 
 		 282 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1572  integrase, catalytic region  45 
 
 		 301 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2120  integrase, catalytic region  45 
 
 		 301 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.824405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3608  Integrase catalytic region  37.74 
 
 		 301 aa  42.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0251528  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2528  Integrase catalytic region  37.74 
 
 		 301 aa  42.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000564647  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4771  IS1203 transposase orfB  42.22 
 
 		 296 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.220432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1236  Integrase catalytic region  37.74 
 
 		 291 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.305005 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3483  Integrase catalytic region  37.74 
 
 		 301 aa  42.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00971742  hitchhiker  0.00375901 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1426  Integrase catalytic region  43.18 
 
 		 304 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0450418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0041  IS629, transposase orfB  42.22 
 
 		 295 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0291  IS629, transposase orfB  42.22 
 
 		 296 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.638063 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1170  IS629, transposase orfB  42.22 
 
 		 296 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.563398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1178  IS629, transposase orfB  42.22 
 
 		 296 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1657  IS629, transposase orfB  42.22 
 
 		 296 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000216946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2286  IS629, transposase orfB  42.22 
 
 		 296 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.292769  hitchhiker  5.1383e-16 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2789  IS629, transposase orfB  42.22 
 
 		 296 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.194228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2843  IS629, transposase orfB  42.22 
 
 		 296 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.69714 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2932  IS629, transposase orfB  42.22 
 
 		 296 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.529947  hitchhiker  0.00000000000000217145 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3232  IS629, transposase orfB  42.22 
 
 		 296 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.312429  hitchhiker  0.000944743 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3386  IS629, transposase orfB  42.22 
 
 		 296 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3516  IS629, transposase orfB  42.22 
 
 		 296 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0367503 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3874  IS629, transposase orfB  42.22 
 
 		 296 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.816642 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4591  IS629, transposase orfB  42.22 
 
 		 296 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.987029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2709  integrase catalytic subunit  41.86 
 
 		 299 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2937  integrase catalytic subunit  41.86 
 
 		 299 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  0.799386 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2222  integrase catalytic subunit  44.23 
 
 		 278 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.21419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12114  hypothetical protein  46.34 
 
 		 294 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.76426e-46  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12378  transposase  46.34 
 
 		 294 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.6977900000000003e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12381  transposase  46.34 
 
 		 294 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.55066e-37  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13132  transposase  46.34 
 
 		 294 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000174572  normal  0.138383 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13206  transposase  46.34 
 
 		 294 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.3114300000000003e-18  normal  0.570802 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13357  transposase  46.34 
 
 		 294 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.77516e-37  normal  0.294919 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>