10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0535 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0535  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  484  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.518716  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0158  hypothetical protein  31.87 
 
 
313 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.494039  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8914  hypothetical protein  35.67 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0914  hypothetical protein  30 
 
 
269 aa  62.8  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.320599  normal  0.183978 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4037  hypothetical protein  36.67 
 
 
222 aa  62.8  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000240032  normal  0.0313625 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5626  hypothetical protein  32.05 
 
 
337 aa  56.6  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.154259  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5146  hypothetical protein  28.16 
 
 
214 aa  56.2  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3233  hypothetical protein  23.16 
 
 
212 aa  50.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0741087  hitchhiker  0.00218633 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0046  hypothetical protein  29.9 
 
 
287 aa  47.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2715  hypothetical protein  29.93 
 
 
279 aa  47  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0442027  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>