44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0275 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0275  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  100 
 
 		 350 aa  629  1e-179  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.381814  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  33.9 
 
 		 1148 aa  79.3  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  31.22 
 
 		 644 aa  67  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  42.59 
 
 		 1438 aa  66.2  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  41.18 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.02 
 
 		 510 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.76 
 
 		 1343 aa  63.2  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0779  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.58 
 
 		 641 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0925  hypothetical protein  24.88 
 
 		 517 aa  59.7  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  35.09 
 
 		 958 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  40 
 
 		 180 aa  59.3  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  32.51 
 
 		 501 aa  58.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1151  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.55 
 
 		 642 aa  56.2  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.43 
 
 		 399 aa  55.8  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  31.25 
 
 		 1094 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2190  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.04 
 
 		 411 aa  54.3  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 		 524 aa  53.5  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.46 
 
 		 323 aa  53.1  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1378  HEAT domain containing protein  30.61 
 
 		 643 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.905373  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  31.82 
 
 		 493 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0125  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.82 
 
 		 286 aa  50.4  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000154581  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.08 
 
 		 395 aa  49.7  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.19 
 
 		 1181 aa  48.5  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.26 
 
 		 1139 aa  48.5  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.68 
 
 		 176 aa  47  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  32.54 
 
 		 431 aa  46.6  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0996  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.34 
 
 		 1110 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.399368  normal  0.160233 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  35.94 
 
 		 1133 aa  45.8  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4537  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 		 400 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0156  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36.45 
 
 		 284 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00291683 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.13 
 
 		 232 aa  44.3  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0940  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.76 
 
 		 408 aa  44.7  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0342  HEAT repeat-containing PBS lyase  46.84 
 
 		 101 aa  44.3  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.649618 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2171  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.26 
 
 		 375 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0184822  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1970  HEAT-like repeat-containing protein  36.26 
 
 		 375 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000496262  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1988  HEAT-like repeat-containing protein  36.26 
 
 		 375 aa  43.9  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00393125  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2017  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.26 
 
 		 375 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537402  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  27.4 
 
 		 1224 aa  43.1  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2006  HEAT repeat-containing PBS lyase  36 
 
 		 375 aa  42.7  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000482717  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2194  PBS lyase HEAT-like repeat domain protein  35.56 
 
 		 375 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0153783 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2314  PBS lyase HEAT-like repeat domain protein  36.26 
 
 		 375 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000816736  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3139  PBS lyase HEAT-like repeat domain protein  36.26 
 
 		 375 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640173  normal  0.0140567 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2177  PBS lyase HEAT-like repeat domain protein  36.26 
 
 		 375 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.88 
 
 		 208 aa  42.7  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>