39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0112 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_0112  heat shock protein DnaJ-like  100 
 
 
254 aa  504  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0852489  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0313  dnaJ domain-containing protein  37.5 
 
 
255 aa  96.3  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.859197  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2736  heat shock protein DnaJ-like  41.94 
 
 
201 aa  57  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.302164 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1853  pentapeptide repeat protein  38.98 
 
 
369 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.150883  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0864  heat shock protein DnaJ-like  35.38 
 
 
217 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4759  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.29 
 
 
222 aa  53.9  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1351  heat shock protein DnaJ-like  39.66 
 
 
741 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0473185 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1465  heat shock protein DnaJ domain protein  37.5 
 
 
213 aa  51.6  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00965011  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1089  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  29.81 
 
 
116 aa  50.8  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1017  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  29.81 
 
 
116 aa  50.8  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0217  heat shock protein DnaJ domain protein  39.39 
 
 
412 aa  49.7  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1469  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.71 
 
 
445 aa  48.5  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0854841  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0616  putative chaperonin  32.26 
 
 
250 aa  47  0.0003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0286  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  41.07 
 
 
439 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00648173 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03720  DnaJ domain containing protein  33.33 
 
 
249 aa  47  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.338466  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0012  heat shock protein DnaJ domain protein  35.94 
 
 
189 aa  46.2  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155448 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0826  heat shock protein DnaJ domain protein  35.59 
 
 
241 aa  46.2  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000315568  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1093  heat shock protein DnaJ-like  44.23 
 
 
309 aa  45.8  0.0007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137615  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1420  heat shock protein DnaJ domain protein  33.33 
 
 
191 aa  45.4  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04250  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain protein  43.1 
 
 
282 aa  45.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2289  chaperone protein DnaJ  42.31 
 
 
387 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0258  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  41.07 
 
 
451 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11594 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1276  chaperone protein DnaJ  33.33 
 
 
374 aa  44.7  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00131629  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2004  chaperone protein DnaJ  42.31 
 
 
387 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0565  heat shock protein DnaJ domain protein  31.58 
 
 
296 aa  43.9  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000172  DnaJ-related protein  37.5 
 
 
206 aa  43.9  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1395  heat shock protein DnaJ-like  37.14 
 
 
310 aa  44.3  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1396  chaperone protein DnaJ  31.75 
 
 
373 aa  43.5  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.427983  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0455  chaperone protein DnaJ  32.81 
 
 
373 aa  43.5  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0631  pentapeptide repeat protein  41.46 
 
 
225 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0465  chaperone protein DnaJ  31.75 
 
 
374 aa  43.9  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141639  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0207  DnaJ domain-containing protein  34.48 
 
 
273 aa  43.5  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08671  DnaJ2 protein  31.07 
 
 
326 aa  42.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0154865 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0200  chaperone DnaJ domain protein  38.46 
 
 
297 aa  42.4  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000536584 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1429  heat shock protein DnaJ-like  33.93 
 
 
177 aa  42.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.22108 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0217  chaperone DnaJ domain protein  38.46 
 
 
297 aa  42  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000962373  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2511  heat shock protein DnaJ domain protein  33.8 
 
 
316 aa  42  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0350748  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0493  chaperone protein DnaJ  30.16 
 
 
373 aa  42  0.01  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_9611  predicted protein  37.5 
 
 
78 aa  42  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>