130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3540 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2751  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  86.85 
 
 
442 aa  731    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1800  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  74.94 
 
 
447 aa  667    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.920741  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2120  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  80.32 
 
 
441 aa  662    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.20125  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1304  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  88.84 
 
 
443 aa  744    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000133068 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3540  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  100 
 
 
442 aa  878    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000247021  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1726  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  75.17 
 
 
447 aa  667    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2921  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  88.84 
 
 
443 aa  743    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4182  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  73.53 
 
 
441 aa  632  1e-180  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.877677 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3993  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  61.05 
 
 
440 aa  512  1e-144  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000171498  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0685  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  56.49 
 
 
438 aa  484  1e-136  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3841  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  55.13 
 
 
438 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4417  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  49.21 
 
 
447 aa  432  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0293  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  50.11 
 
 
447 aa  432  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000600202 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3726  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  50.11 
 
 
447 aa  432  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00035323 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0293  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  49.89 
 
 
447 aa  431  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000012855 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0302  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  48.76 
 
 
447 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0298  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  48.76 
 
 
447 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0307  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  48.98 
 
 
447 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0303  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  48.76 
 
 
447 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2500  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  48.28 
 
 
447 aa  428  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1023  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  47.5 
 
 
442 aa  427  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05690  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  46.36 
 
 
443 aa  420  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000075  C4-dicarboxylate like transporter  46.82 
 
 
443 aa  421  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.834607  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1566  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  48.59 
 
 
441 aa  409  1e-113  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2479  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  45.41 
 
 
447 aa  402  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3222  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  46.98 
 
 
447 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3359  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  46.76 
 
 
447 aa  388  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0561  C4-dicarboxylate transporter, anaerobic  44.7 
 
 
442 aa  367  1e-100  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3845  anaerobic c4-dicarboxylate membrane transporter family protein  45.21 
 
 
441 aa  367  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1756  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  46.8 
 
 
453 aa  363  4e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2178  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  47.02 
 
 
453 aa  362  6e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3863  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  44.44 
 
 
446 aa  361  1e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39327  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1813  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  46.45 
 
 
446 aa  362  1e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.235403  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0240  hypothetical protein  42.44 
 
 
439 aa  360  3e-98  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3576  anaerobic c4-dicarboxylate membrane transporter family protein  47.51 
 
 
446 aa  359  4e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1406  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  45.31 
 
 
446 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2084  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  45.7 
 
 
453 aa  355  1e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2701  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  44.85 
 
 
453 aa  353  4e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4696  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  44.75 
 
 
446 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4647  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  44.5 
 
 
446 aa  345  8e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873915  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4647  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  44.5 
 
 
446 aa  345  8e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4556  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  44.5 
 
 
446 aa  345  8e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4565  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  44.5 
 
 
446 aa  345  8e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03994  C4-dicarboxylate antiporter  44 
 
 
446 aa  344  2e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3869  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family  44 
 
 
446 aa  344  2e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0697  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  41.89 
 
 
474 aa  343  2e-93  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5637  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  44 
 
 
446 aa  344  2e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.363668  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03955  hypothetical protein  44 
 
 
446 aa  344  2e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.905652  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4364  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  44 
 
 
446 aa  344  2e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.282822  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3904  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  44 
 
 
446 aa  344  2e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4589  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  44 
 
 
446 aa  344  2e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0772  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  41.89 
 
 
474 aa  343  4e-93  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3278  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family  43.49 
 
 
443 aa  343  4e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.737723 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0441  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  46.31 
 
 
437 aa  343  5e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0488  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  46.09 
 
 
437 aa  341  2e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1605  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family  42.53 
 
 
441 aa  341  2e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0364  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  46.09 
 
 
437 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0378  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  46.09 
 
 
437 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4883  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  46.09 
 
 
437 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0359  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  46.31 
 
 
437 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0421  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  45.86 
 
 
437 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0354  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  46.09 
 
 
437 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0489  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  45.86 
 
 
437 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0351  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  45.86 
 
 
437 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0366  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  45.64 
 
 
437 aa  334  2e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2657  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family  43.12 
 
 
433 aa  330  4e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000544517  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3974  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  44.92 
 
 
439 aa  329  8e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1227  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  43.55 
 
 
437 aa  328  8e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0182987  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3871  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  45.15 
 
 
439 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0593006  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3793  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  45.15 
 
 
439 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.261131  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3805  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  45.15 
 
 
439 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3913  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  45.15 
 
 
439 aa  322  9.000000000000001e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.689386  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0158  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  43.22 
 
 
436 aa  306  4.0000000000000004e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0683  anaerobic c4-dicarboxylate transporter DcuB  42.12 
 
 
444 aa  305  7e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.788285  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2007  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family  37.47 
 
 
433 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3893  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family protein  36.71 
 
 
433 aa  280  5e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1121  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  37.61 
 
 
438 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.387894 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0588  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  35.63 
 
 
435 aa  263  4.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3408  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  37.87 
 
 
433 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3748  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter  35.63 
 
 
433 aa  259  8e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0617  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter  35.63 
 
 
433 aa  259  8e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0639  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family  35.63 
 
 
433 aa  259  8e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0681  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family protein  35.85 
 
 
415 aa  258  1e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1122  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  37.5 
 
 
438 aa  257  3e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.253067 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0505  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  38.04 
 
 
433 aa  256  4e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0325  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  38.99 
 
 
433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000434648 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3533  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  37.87 
 
 
433 aa  253  6e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0724  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  37.5 
 
 
433 aa  252  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1089  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  37.59 
 
 
432 aa  250  3e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1117  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  37.92 
 
 
444 aa  248  1e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0644  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter  35.34 
 
 
415 aa  247  3e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0405  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  37.33 
 
 
433 aa  246  4.9999999999999997e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.219267  hitchhiker  0.00256647 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1644  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  35.9 
 
 
445 aa  246  6.999999999999999e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04008  C4-dicarboxylate antiporter  35.79 
 
 
433 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3854  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, Dcu family  35.79 
 
 
433 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5654  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  35.79 
 
 
433 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00371648  normal  0.384394 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03970  hypothetical protein  35.79 
 
 
433 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4379  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  35.79 
 
 
433 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0860444  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4693  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  35.79 
 
 
433 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4721  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  36.61 
 
 
433 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0855825  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>