More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0740 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0740  ABC-type amino acid transport/signal transduction systems periplasmic component/domain-like protein  100 
 
 
261 aa  535  1e-151  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1178  amino acid ABC transporter periplasmic protein  67.32 
 
 
265 aa  369  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.241034  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1035  amino acid ABC transporter periplasmic protein  65.35 
 
 
260 aa  348  6e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.218421 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0858  amino acid ABC transporter periplasmic protein  65.35 
 
 
260 aa  347  8e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00112891  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2022  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.29 
 
 
748 aa  159  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0714  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.12 
 
 
755 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0859  amino acid ABC transporter permease  35.19 
 
 
990 aa  139  3e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0204986  normal  0.722319 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1036  amino acid ABC transporter permease  35.19 
 
 
990 aa  140  3e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.328178 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0860  amino acid ABC transporter permease  33.18 
 
 
508 aa  112  7.000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00720787  normal  0.228592 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1037  amino acid ABC transporter permease  33.18 
 
 
508 aa  112  7.000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.42517  normal  0.248691 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0847  amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.14 
 
 
262 aa  100  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000135059  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0739  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  27.59 
 
 
515 aa  96.3  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  43.69 
 
 
246 aa  88.2  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  45.36 
 
 
250 aa  87.4  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1466  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein/permease protein  25.2 
 
 
727 aa  85.5  9e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  40.95 
 
 
246 aa  85.1  9e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  40.95 
 
 
247 aa  85.1  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  39.45 
 
 
258 aa  83.6  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  42.24 
 
 
260 aa  83.2  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0327  extracellular solute-binding protein  35.25 
 
 
305 aa  83.2  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2291  extracellular solute-binding protein family 3  43.82 
 
 
260 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299609  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2278  extracellular solute-binding protein  30.32 
 
 
287 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000861711  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  44.68 
 
 
257 aa  80.1  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1232  arginine-binding periplasmic protein 1  39.29 
 
 
242 aa  78.6  0.00000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.94 
 
 
489 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4942  amino acid ABC transporter permease  44.94 
 
 
489 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5030  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.94 
 
 
489 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3925  extracellular solute-binding protein family 3  40.62 
 
 
295 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4264  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  38.46 
 
 
259 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000272293  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1959  extracellular solute-binding protein  47.25 
 
 
222 aa  77.8  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.553895 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0971  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  38.46 
 
 
259 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000530479  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1461  ABC-type amino acid transport system, periplasmic and permease components  25.97 
 
 
736 aa  77.8  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4039  extracellular solute-binding protein family 3  40.62 
 
 
295 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4270  extracellular solute-binding protein  44.05 
 
 
250 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.861992  hitchhiker  0.00000000000000985175 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4225  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  39.18 
 
 
259 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000103966  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3905  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  39.18 
 
 
259 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000878527  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3166  extracellular solute-binding protein  45.65 
 
 
242 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.190587  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4285  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  39.18 
 
 
259 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000352358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4174  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  39.18 
 
 
259 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0433211 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3397  extracellular solute-binding protein  45.26 
 
 
245 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4059  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  39.18 
 
 
259 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988465  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3898  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  39.18 
 
 
259 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1385  extracellular solute-binding protein  41.49 
 
 
271 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00529871  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4376  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  39.18 
 
 
259 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000139221  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1137  extracellular solute-binding protein  43.75 
 
 
271 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1593  extracellular solute-binding protein  43.75 
 
 
271 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227678  normal  0.74753 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1617  extracellular solute-binding protein  43.75 
 
 
271 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0906  extracellular solute-binding protein  45.98 
 
 
279 aa  76.6  0.0000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.663665  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2849  extracellular solute-binding protein  35.58 
 
 
261 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000542084  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1531  extracellular solute-binding protein  38.54 
 
 
260 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0450484  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1926  solute-binding family 1 protein  41.05 
 
 
250 aa  76.3  0.0000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1515  extracellular solute-binding protein  43.75 
 
 
271 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1044  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  41.41 
 
 
244 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0495  TcmP  38.2 
 
 
255 aa  75.9  0.0000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3053  extracellular solute-binding protein  41.41 
 
 
244 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000807518  normal  0.0316275 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0919  extracellular solute-binding protein  41.41 
 
 
244 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7227  extracellular solute-binding protein  46.07 
 
 
262 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5891  putative periplasmic binding protein  42.86 
 
 
250 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1767  extracellular solute-binding protein  39.64 
 
 
276 aa  75.5  0.0000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.99488  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0413  homoserine kinase (HSK; HK)  39.29 
 
 
256 aa  75.5  0.0000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.862983  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68070  putative periplasmic binding protein  42.86 
 
 
250 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.467705  normal  0.0215943 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0411  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase  35.71 
 
 
238 aa  75.1  0.0000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4712  arginine-binding periplasmic protein 2  37.89 
 
 
246 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00168872  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1538  extracellular solute-binding protein  42.71 
 
 
292 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133709  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0553  hypothetical protein  39.36 
 
 
244 aa  75.1  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4762  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  42.71 
 
 
271 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4769  arginine-binding periplasmic protein 2  37.89 
 
 
246 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.129317  normal  0.0665997 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4748  arginine-binding periplasmic protein 2  37.89 
 
 
246 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00354956  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0882  extracellular solute-binding protein  40.4 
 
 
244 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00121366  normal  0.225798 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4629  arginine-binding periplasmic protein 2  37.89 
 
 
246 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336124  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4274  extracellular solute-binding protein  39.29 
 
 
258 aa  74.3  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882363  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0951  extracellular solute-binding protein  40.4 
 
 
244 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0326  polar amino acid ABC uptake transporter substrate binding protein  41.67 
 
 
271 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.178009  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1895  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  41.67 
 
 
271 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.299924  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1883  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  41.67 
 
 
271 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3760  extracellular solute-binding protein  45.26 
 
 
245 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000882813  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0835  extracellular solute-binding protein  41.67 
 
 
271 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2051  extracellular solute-binding protein  41.67 
 
 
271 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0325389  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0986  extracellular solute-binding protein  40.4 
 
 
244 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2450  extracellular solute-binding protein  42.71 
 
 
271 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1621  extracellular solute-binding protein  41.67 
 
 
271 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0810697  normal  0.181323 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3995  extracellular solute-binding protein  37.78 
 
 
259 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0155411  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4752  extracellular solute-binding protein family 3  39.77 
 
 
269 aa  74.3  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000170582  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1562  extracellular solute-binding protein  43.37 
 
 
261 aa  74.3  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470134  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1379  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  38.1 
 
 
243 aa  74.3  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1924  glutamine-binding periplasmic protein/glutamine transport system permease protein  38.95 
 
 
259 aa  74.3  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4620  arginine-binding periplasmic protein 2  37.89 
 
 
246 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3392  extracellular solute-binding protein  40.4 
 
 
244 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0624048  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0357  extracellular solute-binding protein  41.18 
 
 
270 aa  74.3  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1670  extracellular solute-binding protein  41.67 
 
 
271 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.720486  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3136  extracellular solute-binding protein  39.58 
 
 
257 aa  73.9  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598939  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1232  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.83 
 
 
503 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0615942 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3027  extracellular solute-binding protein  42.7 
 
 
244 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0529  hypothetical protein  39.36 
 
 
244 aa  73.2  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1779  extracellular solute-binding protein  38.89 
 
 
276 aa  73.2  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  37.23 
 
 
266 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2212  extracellular solute-binding protein  44.94 
 
 
267 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0972  extracellular solute-binding protein family 3  41.24 
 
 
250 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.801508  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5358  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  43.37 
 
 
254 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2022  extracellular solute-binding protein  40 
 
 
272 aa  72.8  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.167722  normal  0.899953 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>