More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_R0028 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_R0014  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.207182  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0028  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0034  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0065  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00143134  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0047  tRNA-Ile  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0035  tRNA-Ile  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.849815  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt14  tRNA-Ile  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.033496  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1585  tRNA-Ile  97.4 
 
 
79 bp  137  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1793  tRNA-Ile  97.4 
 
 
79 bp  137  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00299619  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1021  tRNA-Ile  97.4 
 
 
79 bp  137  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0011  tRNA-Ile  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0055  tRNA-Ile  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.744049  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0071  tRNA-Ile  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.741425  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0019  tRNA-Ile  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t33  tRNA-Ile  97.3 
 
 
74 bp  131  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.332244  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t38  tRNA-Ile  97.3 
 
 
74 bp  131  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00741229  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0050  tRNA-Ile  95.77 
 
 
77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0057  tRNA-Ile  95.77 
 
 
77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.085942  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0048  tRNA-Ile  95.77 
 
 
77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0041  tRNA-Ile  95.77 
 
 
77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130016  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0055  tRNA-Ile  95.77 
 
 
77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.168616  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0039  tRNA-Ile  95.77 
 
 
77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1085  tRNA-Ile  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0259  tRNA-Ile  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0013  tRNA-Ile  94.37 
 
 
77 bp  109  9.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.059772  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0014  tRNA-Ile  92.11 
 
 
77 bp  103  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6551  tRNA-Ile  92.96 
 
 
77 bp  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4551  tRNA-Ile  92.96 
 
 
77 bp  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.349279  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4579  tRNA-Ile  92.96 
 
 
77 bp  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6554  tRNA-Ile  92.96 
 
 
77 bp  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0053  tRNA-Ile  92.31 
 
 
78 bp  99.6  9e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.154517  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0032  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA9  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0010  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0369476  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0040  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000178667  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0014    90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.686239  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0052  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.461525 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0042  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0051  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0056  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.239639  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0048  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.622626  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0062  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.648574  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0054  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0666927 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0019  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.848767  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0064  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.17499  normal  0.116646 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0055  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0011  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0219307 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0069  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0014  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA17  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0006  tRNA-Ile  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0012  tRNA-Ile  89.61 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0003  tRNA-Ile  93.33 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.784686  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0058  tRNA-Ile  93.33 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0051  tRNA-Ile  93.33 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6007  tRNA-Ile  93.33 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.358731 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4324  tRNA-Ile  93.33 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0101134  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4348  tRNA-Ile  93.33 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.265257  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4353  tRNA-Ile  93.33 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.116887  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0050  tRNA-Ile  93.33 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.303318 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_R0085  tRNA-Ile  93.33 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0058  tRNA-Ile  93.33 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.646695 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0064  tRNA-Ile  93.33 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0072  tRNA-Ile  93.33 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.152177 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0003  tRNA-Ile  93.33 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00132267  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0049  tRNA-Ile  93.33 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.319822 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0056  tRNA-Ile  93.33 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0037  tRNA-Ile  93.33 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0064  tRNA-Ile  93.33 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_R0064  tRNA-Ile  93.33 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.375989  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6014  tRNA-Ile  93.33 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0003  tRNA-Ile  93.33 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0042  tRNA-Ile  93.33 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0017  tRNA-Ile  90.14 
 
 
77 bp  85.7  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0599655  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0026  tRNA-Ile  90.14 
 
 
77 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0532408 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0057  tRNA-Ile  90.14 
 
 
77 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.926394 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0028  tRNA-Ile  90.14 
 
 
77 bp  85.7  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.897252  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0038  tRNA-Ile  90.14 
 
 
77 bp  85.7  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00492352  normal  0.805671 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0033  tRNA-Ile  90.14 
 
 
77 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0063  tRNA-Ile  90.14 
 
 
77 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.809971 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0008  tRNA-Ile  90 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.135162  normal  0.696922 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0030  tRNA-Ile  88.31 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0035  tRNA-Ile  88.31 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.15056  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0035  tRNA-Ile  92.86 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.215089 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  88.73 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0018  tRNA-Ile  88.73 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0042  tRNA-Ile  88.73 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0006  tRNA-Ile  88.73 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293878 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0022  tRNA-Ile  88.73 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0029  tRNA-Ile  88.73 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.125391  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0077  tRNA-Ile  88.73 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.982522 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0084  tRNA-Ile  88.73 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0002  tRNA-Ile  88.57 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0021  tRNA-Ile  88.57 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0055  tRNA-Ile  88.57 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0078  tRNA-Ile  88.57 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0223  tRNA-Ile  90.32 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0090777  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0547  tRNA-Ile  88.57 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0033  tRNA-Ile  88.57 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000392062  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0040  tRNA-Ile  91.23 
 
 
74 bp  73.8  0.000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>